Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DYM_0001500
Sequence Length
609 nt
GC Content
0.4204
AUACUAAAAAAUAUUACUUGGUAUUCAGAACGAGUUUUAACUGAAAUCUCCUUGGGGAGUCUCCUGAUCCUGGUGGUAAUAAGAACCAUUCAAUACAACAUGACUAGGACACGAGACAAGUACCUUCACACAAAUUGUUUGGCAGCUUUAGCAAAUAUGUCGGCACAGUUUCGUUCUCUCCAUCAGUAUGCUGCCCAGAGGAUCAUCAGUUUAUUUUCUUUGCUGUCUAAAAAACACAACAAAGUUCUGGAACAAGCCACACAGUCCUUGAGAGGUUCGCUGAGUUCUAAUGAUGUUCCUCUACCAGAUUAUGCACAAGACCUAAAUGUCAUUGAAGAAGUGAUUCGAAUGAUGUUAGAGAUCAUCAACUCCUGCCUGACAAAUUCCCUUCACCACAACCCAAACUUGGUAUACGCCCUGCUUUACAAACGCGAUCUCUUUGAACAAUUUCGAACUCAUCCUUCAUUUCAGGAUAUAAUGCAAAAUAUUGAUCUGGUGAUCUCCUUCUUUAGCUCAAGGUUGCUGCAAGCUGGAGCUGAGCUGUCAGUGGAACGGGUCCUGGAAAUCAUUAAGCAAGGCGUCGUUGCGCUGCCCAAAGACAGACUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-136.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -148.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 118.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((......((..(((((..........)))))..)).......((((....))))(((((.((.(((((((.((......................)).))))))))).))))).)))).(((((......((((((((((((....((((...((((((((.((((....(((((.(((((((((((((...((((((.(((((.........(((((.(((.........))).)))))...((((((.(((.((.(..((...))..)))..)))..)))))).))))).))))))..)))..)))))....(((......))).(((((.......))))).)))))..))))).....))))..)))).))))..........((((...........))))..(((((.(((((.........(((...((((((....))))))...))).....(((((((((...............((((....))))(((.....(((((((.....(((.((...)).)))))))))).....)))....)))))))))......))))).)))))..))))))))))...))))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((......,,..{{{{(,,.,,,,,..}}}}}..},...,,..,{((,...})))(((((.((.(((((((,((.......,....,,........}).))))))))).))))).)))).(((((......,(((((((((((...,(({{,,.((((((((.((((..,.(((((.((((((((({(((...((((((.(((((.........(((((.(((.........))).)))))...{(((((.(((.,,.(..((,..,,.,))...)))..)))))}.))))).))))))..)))..)))))....{{{......}||,{(|,,..,....))),,.)))))..))))).,...))))..)))).)))).,,.......,,,,....,,.....)))}..(((((.(((((.......,.(((...((((({....})))))...})),....{((((((((..............,((((....))}}{{{..,{{((((((,.,.{{{||.,}},,}}})))))))}}}|,,,.})}.,,,))))))))}......))))).))))).,)))})))))).,.)))}}}..)))))
Back