Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DYM_0002300
Sequence Length
1525 nt
GC Content
0.3574
AUAGCAGUCCUUUCCCCUCAUCAAUUCCACAUGCCUUCCAGAUCAACUUUAAUAGUUUGUACACAGCUCUUUGUGAACAGCAGACAUCUGAUCAAGCAACUCUCCUCUUGUAUACCUUGCUCCAUCAAAAUAGUAAUAUUAGAACAUACAUGUUGGCUCGCACAGAUAUGGAAAAUCUUGUUUUACCAAUUCUUGAGAUUCUGUAUCAUGUUGAAGAAAGGAAUUCACACCAUGUGUAUAUGGCCCUUAUAAUAUUGUUGAUCCUUACGGAAGAUGAUGGCUUCAACAGAUCCAUUCAUGAAGUGAUACUAAAAAAUAUUACUUGGUAUUCAGAACGAGUUUUAACUGAAAUCUCCUUGGGGAGUCUCCUGAUCCUGGUGGUAAUAAGAACCAUUCAAUACAACAUGACUAGGACACGAGACAAGUACCUUCACACAAAUUGUUUGGCAGCUUUAGCAAAUAUGUCGGCACAGUUUCGUUCUCUCCAUCAGUAUGCUGCCCAGAGGAUCAUCAGUUUAUUUUCUUUGCUGUCUAAAAAACACAACAAAGUUCUGGAACAAGCCACACAGUCCUUGAGAGGUUCGCUGAGUUCUAAUGAUGUUCCUCUACCAGAUUAUGCACAAGACCUAAAUGUCAUUGAAGAAGUGAUUCGAAUGAUGUUAGAGAUCAUCAACUCCUGCCUGACAAAUUCCCUUCACCACAACCCAAACUUGGUAUACGCCCUGCUUUACAAACGCGAUCUCUUUGAACAAUUUCGAACUCAUCCUUCAUUUCAGGAUAUAAUGCAAAAUAUUGAUCUGGUGAGUGUAAAUGAAGACAUUUAUUAUGAUUCUUUUUUAAGUAUUAAAGCAGAGAAUGUUUAAUAAGCCUUGGUAAGAACUAUAAUAGUAAGAGUUUCUUCUUUCAACAUUAACUGUAUUUGCAGUCUAUUUUACUAUAAUAGUUGUGGUAAUCUGUGUGUGUGUUGUAUAUACACACACAUACAUAUUUAAUACAAUUGAAGUCAUACUUCAUACAGUUUUUUAUUCUGACUUUUUUACUUUACACUUAGACCAUGAGCAUUUUUCUGUGGUAUUAUCAAUUCUUUGAAAGUCUCACAUUUUAAUUUCUAUCUAGCCCAUGUUUGUGUCCUAAAAUAUAUAUAACUAUUAUCCCAUUUUUGCUCAUUUAUUUCCAGUAUUUUAUAUCAAUUCAUAAUGAAUGAAAAGUUUAUAAAUAAGUCUUAUCUCAAAUUUUAAAAUUAUAUUUUUGAUAUGGUUUUAAAGCUGGAAUUUUACUAGUUUUUACUGUCAAAAGAUAUCUUUAUUUUCAAGAUUCAACACAGGUUGCCAAAUUGCUUUCCAGAAAAACUGUAGAAUUUAUGCCUGUGGGCCGGGUGUGGUGGCUGAUGCCUAUAAUCCCAGCUACUUGAGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCAGGAAAUAGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCACACCAUUGUACUCUGGCCUGAGCAACGAGAGUAAAACUCCGUCUCACACACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-326.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -360.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 474.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((((((((............(((((.(((...((((.....)))).((.(((((....))))).))((((((....((((..(((((.................)))))..)))).((((((.(((((((.(((((((((..((((.....(((((((((((((...))))).))).....(((((..((((((.(((((((((.(((((((((...(((((....)))))..................((((((.(((.((((((((..((....)).))))).((.((((((((........)))))))).)).(((((............))))))))))).))))))(((((.((.(((((((.((......................)).))))))))).)))))..(((((............((((((.......((..(((.((((((((.((((....(((((.(((((((((((((...((((((.(((((.........(((((.(((.........))).)))))...((((((.(((.((.(..((...))..)))..)))..)))))).))))).))))))..)))..)))))....(((......))).(((((.......))))).)))))..))))).....))))..)))).)))).)))..))..........))))))..)))))..(((..((((...(((((...((((((((((....)))))....(((((.......))))).((((((((((....((((((((((((((........)))))))))).))))...))))..))))))....))))).)))))...))))...)))....((((...))))..))))))))).)))))))))..(((((....))))).....(((((((((...)))))))))..(((((((((((.....)))))))))))..................(((((...)))))))))))..)))))....(((((((...............((((((((.....))).)))))..............)))))))...............))))))))))))))..)))).)))......)))).))))))........)))))).......(((((((..((((((....(((((.....))))).....)))))).................((((((((((((((...)))))))))))))))))))))......((((....))))......((.(((((.......)))))))..(((((((....(((((.((...(((.....))).)))))))..)))))))(((.(((..((..(((....)))..))..))).)))..))).))))))))))..))))).(((((..(((((........).))))..)))))(((.(((..(((....)))..)))))).((((..(((.((((...))))))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......(((((((...,,.......{.{{{{(.....,,{,,.,,,,.....,||{(((.(((({....,)))).}}}}}}}}}...{(((..(((((..........,......}))))..}}}}.,,{{,,..}}}},,,,,...||})}}}}|{,,.{,{(((((((((.,((,,{..,,...,...,.,))}}))))))))),))}})),)))))))..........(((({....((((..((((((..(({{((((((((.(((...((.((((((.....{{.....}}{(.((((((((........)))))))).)).(((((((((((....((((((....((((((((.{((,{,{(({(((((((,((.......},,..,,........,).))))))},|,|||||..{{.,{...{,{,,,,{(((((({{{......,}}},..)))})).))}))))})).......,}})}...))).)))}}))))...))))))....}))((((.(((.......,.))).)))))))))))}..})))))))...))).)))).(((((((((..{(({{.{((((.{,{((({.,{,,,,,{.....,{{,....,,|||{|||,,.,{{|{{|||,,,|||||,}}}}}}.))))}.{((((((((.............,(((({.,(((......||{..,,|||,.((,,...,...|}|,,,..{(((({....}))))}...{(({(.,.....}))}}.,,,{{,,,,,,,,|||||{((((((((({{{,{{{{|,,}|{{{(({{.{((({..{{((({{{{{{{{((.....)))))}})),..}}})}.}))}},|}}}}}}|,{{((|....,}}}}.,...,,..(((((....)))))..,,.{{{{{{{{|.,,}}|||}}||..(((((((((({,({....))))))))))))).,.....,,,...((((((...))))))..{{(,,.......}}),,,}}}}}}.}}}}}}}}},.}}}|((((({......(((((.(((.((((....)))).))).)))))...............,|..,{{||,{|||,.,,,,,}}},,,,,..,,,.,..........}))}}}}....,{{{{{{,,|||,|,,,..{{{{...})))))),,||,,||,,,,,,}|.,,,.........((((((((((((((...))))))))))))))}}}}|||{{({{{.((({{{{.{{(...,{{({,({{{{.......}}}}}.{{{(,,,,||}}...,,||.||,..|||}}}}})))})))))))..))}}))))}}.))))))))}|((....))}........(((((........)))))))))))))),,},,|||{....}}))...}})))}},.)))))))))..)))))))..))))))....)))){(((..(((.((((...))))))))))),))),..
Back