Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DYM_0004300
Sequence Length
1616 nt
GC Content
0.4146
GUUGUCUUUUGGAAAUGCAGGUUUAAGGACAAAUUAUCUGCUUAAGCUAGAAGAUGGGAUCGAAUAGCAGCAGAAUCGGCGAUCUUCCUAAAAAUGAGUACUUGAAAAAGUUAUCAGGCACGGAAUCUAUCUCUGAGAAUGACCCGUUCUGGAAUCAGCUUCUCUCAUUUUCUUUCCCUGCACCAACUAGCAGUAGUGAGUUGAAACUCUUGGAGGAAGCAACCAUUUCAGUCUGCAGGUCAUUAGUUGAAAACAAUCCUCGAACAGGAAAUCUUGGUGCACUAAUUAAGGUCUUCCUUUCUAGAACCAAAGAACUAAAACUUUCAGCAGAAUGUCAGAACCACAUCUUCAUUUGGCAGACACACAAUGCUUUGUUUAUUAUUUGCUGUUUGCUGAAAGUGUUCAUCUGUCAGAUGUCAGAGGAGGAAUUACAACUUCAUUUUACUUAUGAAGAAAAAUCUCCUGGCAAUUACAGUUCUGACUCAGAAGAUCUUUUGGAAGAAUUGCUGUGCUGUUUGAUGCAGUUGAUCACUGAUAUUCCACUCUUAGAUAUUACAUAUGAAAUAUCAGUAGAAGCUAUAUCAACAAUGGUUGUUUUCCUUUCCUGCCAACUCUUCCACAAAGAAGUUUUGCGACAGAGCAUCAGCCACAAGUAUUUGAUGCGAGGUCCAUGUCUUCCAUACACCAGCAAACUUGUGAAGACCUUAUUAUAUAACUUUAUCAGACAAGAAAAGCCACCUCCUCCAGGGGCCCAUGUUUUCCCUCAGCAGUCGGAUGGGGGAGGACUGCUUUAUGGACUUGCAUCAGGAGUAGCAACAGGACUCUGGACUGUCUUCACACUAGGUGGUGUGGGCAGCAAAGCGGCUGCCUCUCCAGAGCUUUCUUCCCCUCUGGCCAACCAGAGUCUCCUGCUUCUGCUGGUGUUGGCCAAUCUGACAGAUGCCUCAGAUGCGCCAAACCCCUACAGACAAGCCAUUAUGUCCUUCAAGAACACACAAGAUAGCAGUCCUUUCCCCUCAUCAAUUCCACAUGCCUUCCAGAUCAACUUUAAUAGUUUGUACACAGCUCUUUGUGAACAGCAGACAUCUGAUCAAGCAACUCUCCUCUUGUAUACCUUGCUCCAUCAAAAUAGUAAUAUUAGAACAUACAUGUUGGCUCGCACAGAUAUGGAAAAUCUUGUUUUACCAAUUCUUGAGAUUCUGUAUCAUGUUGAAGAAAGGAAUUCACACCAUGUGUAUAUGGCCCUUAUAAUAUUGUUGAUCCUUACGGAAGAUGAUGGCUUCAACAGAUCCAUUCAUGAAGUGAUACUAAAAAAUAUUACUUGGUAUUCAGAACGAGUUUUAACUGAAAUCUCCUUGGGGAGUCUCCUGAUCCUGGUGGUAAUAAGAACCAUUCAAUACAACAUGACUAGGACACGAGACAAGUACCUUCACACAAAUUGUUUGGCAGCUUUAGCAAAUAUGUCGGCACAGUUUCGUUCUCUCCAUCAGUAUGCUGCCCAGAGGAUCAUCAGUUUAUUUUCUUUGCUGUCUAAAAAACACAACAAAGUUCUGGAACAAGCCACACAGUCCUUGAGAGGUUCGCUGAGUUCUAAUGAUGUUCCUCUACCAGAUUAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-428.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -455.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 365.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((....((((((.............)))))).....)))))))))))((((.....((((((...((((.(((.((((......(((..((((....))))..))).....))))...))).)))).(((((((.((.(((((((..(((((.(((...........((((........))))....((((....))))...))))))))....)))))))...)).))))))).((((....)))).((.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).)).......((((....(((((((((((((((..(((......))).)))))((((((...((((....))))......))))))...)))))))))))))).((((((((((((((..(((((........((((((.......)))))).....))))))))))........))))))..)))....((..(((((((((.(((((((((.....((((((((.(((((((((((.((.................)).))))))))).)).(((((((..(((.((((((..(((((((((((((((..((((......))))..))).).))).((...(((((((.((((((((((((((((....((((((((..............)).)))))).....................((((((...(((.(((.....))))))...(((((....((((..(((.(((((((((((((((((..((((.((((((((((.((.((((...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....)))))))))..)))).)).))))))(((((..((((((........))))))..)))))...........)))))))).........................)))))))))...))))))))......................((((.....))))(((.(((((....))))).)))...)))..))))..))))).......))))))..)))))))...))))).................)))).)).))))).))((((((((((((..((..(...........)..))..))))))))).)))....))))))))..)).)))))))..)))))))((..(((((.(((((((((((((.(((.((((((((..((....)).))))).((.((((((((........)))))))).)).(((((............))))))))))).))))))(((((.((.(((((((.((......................)).))))))))).)))))........))).)))))))))..)))))))...))).......)))))))))...))))).))))..))..))))))..((((((.(((((.........(((((.(((.........))).)))))...((((((.(((.((.(..((...))..)))..)))..)))))).))))).))))))....))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((,(((((({...((((((,,,,,........}}})}),,.|||}|||||||{{.(((((((((((,,,....((((((((((((.,,,..(((..((((....))))..))).....|||,.,.,||{({({,(((((((.((.(((((((..(((((.(((.....,.,,,.((((........))))..,.|||,.,,,)}}}..,))))))))....)))))))...)).))))))).((((....)}}}.{{.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).}}.......((((....(((((((((((({{(.,(((......}}}.}}},|((((({...{{({....})))......)))))}.})))))))))))))))..{{(({(({(((({.,(((({..,,....((((((.......)))))).....))))))))))...,,,,.))))})}))))}))},}}}|}}}}}||}}}||||||||}}}}}}.},,,,,.{{(((((((((.{{....,,...........}).))))))))).}}.(((((((..(({{((((((..(((((((((((((((..((((......))))..))).).))).((...(((((((.((((((((((((((((....((((((((..............)),))))))................,,.,,({{{((...(((.(((.....))))))...,{{|,.....,,({{({.,(((((((((((((((((..{(((.((((((((((.((.((((...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....)))))))))..)))).)).)))))){(((({.((((((........))))))}.))))}.........,,||}}}}}}..|||}.....,}..,,........))))))))}.,)))),))}}....,.,,.}}}......{,,.,,,,.....,||{(((.(((({....})))).}}}}},}}}.,)))),.,}}}|.......}}))))..)))))))...)))))|,{,....,,,,.....}))).))}})))).)}((((((((((((..((,,(........,..,..)),,))))))))).)))....))))))))..)).))))))),.))))))),,..,,,,.{(((,((((((((..((.,{{((((((,,((,...||.}}},)}{|,|||{((((,,,.....}}}}}}))})),||{(({{{{{,......}|}},,}||||.,|}))}(((((.((.(((((((,((.......,....,,........}).))))))))).)))))..,......,,.}}|||||||{{|||||||...,},,,..})}))),)))))}},))))).,)))}}},....)),)}.,)))))))}.)}}}.}}}}}}}|,||}|,|}}}}}}...)))})|.||.{{(((,.({((,......,,.}}}){{{{{..{||}...,,,...,),)).,))))).}))))}}.)
Back