Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DYM_0006500

Sequence Length

484 nt

GC Content

0.4215

GUGUGAGCCACCGCGCCCGGCCAGCACUAACUCUUAAUGAAGGUUCUCAGAAGCUGCCAGGAGACCUUCAAUCUAGCAAUCCAGAAUUCACCAUGGGAUCAUACUUAACAGCAGUGGAAGCUGAGAAAUAUAGUCUUUAUUAAUUGCAGCCAUGUGCUCUACUAAAAAAAAUCUGUUAGUGUAGAAGAAAGGGAGAAAUGGAUCAUUGGGGAACAGUCAACAGCCUCUGCCCCACCAAGUGCAUUUAUCUAAUCAUUGGAAACCAGCAAACUGGAGGGAGUGAUAGCACAACUACUACAUUGUGGGAGUGGAGCAACAGCACCAUCAUAGGCAAGUUAGAGGGACAUAGGGUUAGAUUGAAGAGAAAUCUGUCAUGUAACUACAUCUGAACACAAAGAUUUUAUACCUGAAAGAGCAUCUAGAAGCUAUUUCAUCUGACUGAAAAAAUGGAUGCUUUUUUUUUCAUCUGACUGUUCUGCGAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-110.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -120.45

Frequency: 0.0000

Diversity: 170.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((..(((.........)))..))))(...((((....))))(((.(((((.(.(.((((.((.((((((((((((..(((((..(((((..((..(.......)..))...)))))..))).))......((((((.((((((...(((((((((((((((........(((..((((((((.((....(((.(((((.((...(((((..(((..........))))))))....)).))))).))).((((((.....((((....))))....)))))).......)).)))))))).))))))))))))..........))).))).)))))))))))).....)))))))))))).(((((((....(((............)))...)))))))......(((((((((((((.......(((((......)))))...)))))))))))))..)).)))).).)))))).))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((..(((.........)))..))))(.........(((((({{(((.{.......,.,)))))))))}.,.,,,..{((((...(((.({.{,...{,,{{{,|{{{{{.{|||||.{|}|.,,..,,,.{{||||,||,,||||,||,,|,|||||||||.........|}}}}}}}))|}}.....,|||},{,||}||..{((,(({{((({{,...,{{{|||||||,{,,.||{|,,,..|||,{{{{||,,,..{({{....)))).,,,,|||,,..}}}..||{|,,,.,,))))},||||,||....}}.}}}},...})}.,}}}}}}))}|}....{{{((|(||{{{{{,.,,}}}.|||},|},}}..{(((........)))).........(((((((((((((.......{((({......))))}...)))))))))))))..,,.,,)))))))))),})}..)