Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DYM_0008800

Sequence Length

1918 nt

GC Content

0.3738

AUGAGAAAACUGAGGUUGGAGAAGUACAGUGAUUUGUCUGAGAUUCAGUAUUCAGUUAAUUAUAGACCUGGAUCUAGAAACUAAAUCUUCUGAUUCCUGAUACAGUUGCUGAAAUGCCCAUCGUUUAAAGUUAAAAAAAAAUUCUUUAAAGUUUUGUCUGGUCAAAUAGCUCCCCUUCUAGCCACACUGCUUUGUUGAUAUGUUUUCUUAAUUUUUCAUUCAAAUGAUUUGUAAUCUGAAGAGUGUUUUAGAUUUAAUAAACUUUUAUAGUUUAUUAUAUUCUAUAUACUGGAGACAUAGAUAAUCAAUUUUUGAGUUUUUAAAAAUCUCCUUUCUAGAGAAAGAUUUAGUGUGUAAGUUGAAUGUGUCUAUUAACUAUUUUUUCCUUUAUGAUUUUGGAUUCUGAGAUAAGAUGGCUACUUGUACUGUUUCUAUCAUUUUCAUUUUGCAAAUCAGUUUUUGAUGUUCAGAAUUAAGACCAAGAGCAGCAGUUUCUCUCAUUGCUUAGUUCUCUAAUUAGGUAUGAAAUUAACAGUAAAGUUGGUCACUGAGCAAUUUUAAUAUGACAUUUGGUUUUAUAAAUGUUAUGAUAAGCUCACUUUGAUUUUAGUUCUUAAAUUUAACUUUUUAAAACCUUUUCUUCUCUUGCAGUUGAAAACAAUCCUCGAACAGGAAAUCUUGGUGCACUAAUUAAGGUCUUCCUUUCUAGAACCAAAGAACUAAAACUUUCAGCAGAAUGUCAGAACCACAUCUUCAUUUGGCAGACACACAAUGCUUUGUUUAUUAUUUGCUGUUUGCUGAAAGUGUUCAUCUGUCAGAUGUCAGAGGAGGAAUUACAACUUCAUUUUACUUAUGAAGAAAAAUCUCCUGGCAAUUACAGUUCUGACUCAGAAGAUCUUUUGGAAGAAUUGCUGUGCUGUUUGAUGCAGUUGAUCACUGAUAUUCCACUCUUAGAUAUUACAUAUGAAAUAUCAGUAGAAGCUAUAUCAACAAUGGUUGUUUUCCUUUCCUGCCAACUCUUCCACAAAGAAGUUUUGCGACAGAGCAUCAGCCACAAGUAUUUGAUGCGAGGUCCAUGUCUUCCAUACACCAGCAAACUUGUGAAGACCUUAUUAUAUAACUUUAUCAGACAAGAAAAGCCACCUCCUCCAGGGGCCCAUGUUUUCCCUCAGCAGUCGGAUGGGGGAGGACUGCUUUAUGGACUUGCAUCAGGAGUAGCAACAGGACUCUGGACUGUCUUCACACUAGGUGGUGUGGGCAGCAAAGCGGCUGCCUCUCCAGAGCUUUCUUCCCCUCUGGCCAACCAGAGUCUCCUGCUUCUGCUGGUGUUGGCCAAUCUGACAGAUGCCUCAGAUGCGCCAAACCCCUACAGACAAGCCAUUAUGUCCUUCAAGAACACACAAGAUAGCAGUCCUUUCCCCUCAUCAAUUCCACAUGCCUUCCAGAUCAACUUUAAUAGUUUGUACACAGCUCUUUGUGAACAGCAGACAUCUGAUCAAGCAACUCUCCUCUUGUAUACCUUGCUCCAUCAAAAUAGUAAUAUUAGAACAUACAUGUUGGCUCGCACAGAUAUGGAAAAUCUUGUUUUACCAAUUCUUGAGAUUCUGUAUCAUGUUGAAGAAAGGAAUUCACACCAUGUGUAUAUGGCCCUUAUAAUAUUGUUGAUCCUUACGGAAGAUGAUGGCUUCAACAGAUCCAUUCAUGAAGUGAUACUAAAAAAUAUUACUUGGUAUUCAGAACGAGUUUUAACUGAAAUCUCCUUGGGGAGUCUCCUGAUCCUGGUGGUAAUAAGAACCAUUCAAUACAACAUGACUAGGACACGAGACAAGUACCUUCACACAAAUUGUUUGGCAGCUUUAGCAAAUAUGUCGGCACAGUUUCGUUCUCUCCAUCAGUAUGCUGCCCAGAGGAUCAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-479.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -514.56

Frequency: 0.0000

Diversity: 346.84

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((.(((((((..((...(((.(((((.((.((((...(((((((((.((((.((.....(((..(((((........)))))..)))...)).)))))))).)))))......(((((((.............))))))).....)))))).))))).)))...)))))))))...(((((((............((((((((((.(((.((((((((((((((..((((((((((..((((..(((((((((.....)))))))))...)))).)))))(((((..((((...((((...))))...))))....)))))....(((((.((((..((((..(((.............)))..))))..)))).)))))..(((((((...)))))))..(((((..((.......))..)))))..)))))..))))))))))...)))))))...))))))))))...))))))))))))).))))))(.....(((((((.....((((((....((((......))))((((.(((((....(((.(((((((((((......))))))))))).))))))))...))))((((((((((....................(((((..((.....))..))))).....((.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).)).....))))))))))(((((((((((((((..(((......))).)))))((((((...((((....))))......))))))...))))))))))..((.((((((((((((((..(((((........((((((.......)))))).....))))))))))........))))))..))).)).((..(((((((((.(((((((((.....((((((((.(((((((((((.((.................)).))))))))).)).(((((((..(((.((((((..(((((((((((((((..((((......))))..))).).))).((...(((((((.((((((((((((((((....((((((((..............)).)))))).....................((((((...(((.(((.....))))))...(((((....((((..(((.(((((((((((((((((..((((.((((((((((.((.((((...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....)))))))))..)))).)).))))))(((((..((((((........))))))..)))))...........)))))))).........................)))))))))...))))))))......................((((.....))))(((.(((((....))))).)))...)))..))))..))))).......))))))..)))))))...))))).................)))).)).))))).))((((((((((((..((..(...........)..))..))))))))).)))....))))))))..)).)))))))..)))))))((..(((((.(((((((((((((.(((.((((((((..((....)).))))).((.((((((((........)))))))).)).(((((............))))))))))).))))))(((((.((.(((((((.((......................)).))))))))).)))))........))).)))))))))..)))))))...))).......)))))))))...))))).))))..))))))))....))))))).....)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((((.((((((({,{(...(((.(((((.((.((((...(((((((({,((((.({.....((({{{((((........)))))},))}.,.)}.))))))))}}})))......(((((((.............))))))).....)))))).))))}.)))...}))))))))...(((((((............((((((((((.(({(((((((((((((((..((((((((((..((((..(((((((((.....))))))))).,.)))).))))}(((((..((((...((({...|)))...}))}....)))))...,{{{{{,{{{(..{({{..{{|,{,,,,......})})..)))}..})}},}}}}}.,{{{{{||,..}}))))}..(((((..((.......))..)))))..)))))..))))))))))...)))))))...)))))))))).,,))))))))))))).))))))(,,,{,((({{{{.,,,,||||{|..,,((((......))))||{{.(((((....(((.(((((((((((......))))))))))).))))))))...}}}}((((((((((...,{{{,....,}},,...{((((..((.....))..))))}.....((.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).)).....))))))))))((((((((((((,{(.,(((......}}}.}}},|((((({...{{({....})))......}))))}.})))))))))))..{{.{{{(((((((((({.,(((({..,,....((((((.......)))))).....))))))))))........)))))}.,})}.||,((,,((({(((((.((((((((({{{{.{({(((((.{((((((((((.{{....,,...........}).))))))))).)}.(((((((..(({{((((((..(((((((((((((((..((((......))))..))).).))).((...(((((((.((((((((((((((((....((((((((..............)),))))))................,,.,,({{{((...(((.(((.....))))))...,{{|,.....,,({{({.,(((((((((((((((((..{(((.((((((((((.((.((((...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....)))))))))..)))).)).)))))){(((({.((((((........))))))}.))))}.........,,||}}}}}}..|||}.....,}..,,........))))))))}.,)))),))}}....,.,,.}}}......{,,.,,,,.....,||{(((.(((({....})))).}}}}},}}}.,)))),.,}}}|.......}}))))..)))))))...)))))|,{,....,,,,.....}))).))}})))).)}((((((((((((..((,,(........,..,..)),,))))))))).)))....))))))))..)).))))))),.)))))))((..(((((.(((((((((((((.(({,((((((((..((....)).))))).((.((((((((........)))))))).)).(((((............))))))))))).))))))(((((.((.(((((((,((.......,....,,........}).))))))))).)))))........))).)))))))))..)))))))...})),,.....)))))))))...))))).}}}}.,||,}}})),.,,))))))),..,.)