Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DYM_0011100

Sequence Length

1304 nt

GC Content

0.4187

GUUGUCUUUUGGAAAUGCAGGUUUAAGGACAAAUUAUCUGCUUAAGCUAGAAGAUGGGAUCGAAUAGCAGCAGAAUCGGCGAUCUUCCUAAAAAUGAGUACUUGAAAAAGUUAUCAGGCACGGAAUCUAUCUCUGAGAAUGACCCGUUCUGGAAUCAGCUUCUCUCAUUUUCUUUCCCUGCACCAACUAGCAGUAGUGAGUUGAAACUCUUGGAGGAAGCAACCAUUUCAGUCUGCAGGUCAUUAGUUGAAAACAAUCCUCGAACAGGAAAUCUUGGUGCACUAAUUAAGGUCUUCCUUUCUAGAACCAAAGAACUAAAACUUUCAGCAGAAUGUCAGAACCACAUCUUCAUUUGGCAGACACACAAUGCUUUGUUUAUUAUUUGCUGUUUGCUGAAAGUGUUCAUCUGUCAGAUGUCAGAGGAGGAAUUACAACUUCAUUUUACUUAUGAAGAAAAAUCUCCUGGCAAUUACAGUUCUGACUCAGAAGAUCUUUUGGAAGAAUUGCUGUGCUGUUUGAUGCAGUUGAUCACUGAUAUUCCACUCUUAGAUAUUACAUAUGAAAUAUCAGUAGAAGCUAUAUCAACAAUGGUUGUUUUCCUUUCCUGCCAACUCUUCCACAAAGAAGUUUUGCGACAGAGCAUCAGCCACAAGUAUUUGAUGCGAGGUCCAUGUCUUCCAUACACCAGCAAACUUGUGAAGACCUUAUUAUAUAACUUUAUCAGACAAGAAAAGCCACCUCCUCCAGGGGCCCAUGUUUUCCCUCAGCAGUCGGAUGGGGGAGGACUGCUUUAUGGACUUGCAUCAGGAGUAGCAACAGGACUCUGGACUGUCUUCACACUAGGUGGUGUGGGCAGCAAAGCGGCUGCCUCUCCAGAGCUUUCUUCCCCUCUGGCCAACCAGAGUCUCCUGCUUCUGCUGGUGUUGGCCAAUCUGACAGAUGCCUCAGAUGCGCCAAACCCCUACAGACAAGCCAUUAUGUCCUUCAAGAACACACAAGAUAGCAGUCCUUUCCCCUCAUCAAUUCCACAUGCCUUCCAGAUCAACUUUAAUAGUUUGUACACAGCUCUUUGUGAACAGCAGACAUCUGAUCAAGCAACUCUCCUCUUGUAUACCUUGCUCCAUCAAAAUAGUAAUAUUAGAACAUACAUGUUGGCUCGCACAGAUAUGGAAAAUCUUGUUUUACCAAUUCUUGAGAUUCUGUAUCAUGUUGAAGAAAGGAAUUCACACCAUGUGUAUAUGGCCCUUAUAAUAUUGUUGAUCCUUACGGAAGAUGAUGGCUUCAACAGAUCCAUUCAUGAAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-355.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -379.41

Frequency: 0.0000

Diversity: 221.68

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((...((((...(((((........((((((...((((...(((...)))...))))))))))..((((((((((((......(((..((((....))))..))).....(((.(((...(((((.(((((((.((.(((((((..(((((.(((...........((((........))))....((((....))))...))))))))....)))))))...)).))))))).((((....)))).((.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).)).......((((....(((((((((((((((..(((......))).)))))((((((...((((....))))......))))))...))))))))))))))....(((((((((((..(((((........((((((.......)))))).....))))))))))........)))))))))))))))))...))))).))))))).(((((.....)))))...(((((((((((.((.................)).))))))))).)).(((((((..(((.((((((..(((((((((((((((..((((......))))..))).).))).((...(((((((.((((((((((((((((....((((((((..............)).)))))).....................((((((...(((.(((.....))))))...(((((....((((..(((.(((((((((((((((((..((((.((((((((((.((.((((...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....)))))))))..)))).)).))))))(((((..((((((........))))))..)))))...........)))))))).........................)))))))))...))))))))......................((((.....))))(((.(((((....))))).)))...)))..))))..))))).......))))))..)))))))...))))).................)))).)).))))).))((((((((((((..((..(...........)..))..))))))))).)))....))))))))..)).)))))))..)))))))))))).....))))...)))....)))))))))).((((((...((.....)).)))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((((...((((,{,(((((......,,((({((...||,|}..|||,{.{||{{{|||||,},,,..((((((((((((.{{{..{((..((((....))))..))).....,,..,,,,,{((((({(((((((.((.(((((((..(((((.(((.....,.,,,.((((........))))..,.|||,.,,,)}}}..,))))))))....)))))))...)).))))))).((((....)}}}.{{.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).}}.......((((....(((((((((((({{(.,(((......}}}.}}},|((((({...{{({....})))......)))))}.})))))))))))))))..{{(({(({(((({.,(((({..,,....((((((.......)))))).....))))))))))...,,,,.))))}))))))}))).))},)))))},))))))}|||||}}}}},),,,...{((((((((((.{{....,,...........}).))))))))).)}.(((((((..(({{((((((..(((((((((((((((..((((......))))..))).).))).((...(((((((.((((((((((((((((....((((((((..............)),))))))................,,.,,({{{((...(((.(((.....))))))...,{{|,.....,,({{({.,(((((((((((((((((..{(((.((((((((((.((.((((...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....)))))))))..)))).)).)))))){(((({.((((((........))))))}.))))}.........,,||}}}}}}..|||}.....,}..,,........))))))))}.,)))),))}}....,.,,.}}}......{,,.,,,,.....,||{(((.(((({....})))).}}}}},}}}.,)))),.,}}}|.......}}))))..)))))))...)))))|,{,....,,,,.....}))).))}})))).)}((((((((((((..((,,(........,..,..)),,))))))))).)))....))))))))..)).))))))),.)))))))))))).,},.))))...)))....)))))))))).((((((...((.....)).)))))).