Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DYM_0013500

Sequence Length

999 nt

GC Content

0.4304

GUUGUCUUUUGGAAAUGCAGGUUUAAGGACAAAUUAUCUGCUUAAGCUAGAAGAUGGGAUCGAAUAGCAGCAGAAUCGGCGAUCUUCCUAAAAAUGAGUACUUGAAAAAGUUAUCAGGCACGGAAUCUAUCUCUGAGAAUGACCCGUUCUGGAAUCAGCUUCUCUCAUUUUCUUUCCCUGCACCAACUAGCAGUAGUGAGUUGAAACUCUUGGAGGAAGCAACCAUUUCAGUCUGCAGGUCAUUAGUUGAAAACAAUCCUCGAACAGGAAAUCUUGGUGCACUAAUUAAGGUCUUCCUUUCUAGAACCAAAGAACUAAAACUUUCAGCAGAAUGUCAGAACCACAUCUUCAUUUGGCAGACACACAAUGCUUUGUUUAUUAUUUGCUGUUUGCUGAAAGUGUUCAUCUGUCAGAUGUCAGAGGAGGAAUUACAACUUCAUUUUACUUAUGAAGAAAAAUCUCCUGGCAAUUACAGUUCUGACUCAGAAGAUCUUUUGGAAGAAUUGCUGUGCUGUUUGAUGCAGUUGAUCACUGAUAUUCCACUCUUAGAUAUUACAUAUGAAAUAUCAGUAGAAGCUAUAUCAACAAUGGUUGUUUUCCUUUCCUGCCAACUCUUCCACAAAGAAGUUUUGCGACAGAGCAUCAGCCACAAGUAUUUGAUGCGAGGUCCAUGUCUUCCAUACACCAGCAAACUUGUGAAGACCUUAUUAUAUAACUUUAUCAGACAAGAAAAGCCACCUCCUCCAGGGGCCCAUGUUUUCCCUCAGCAGUCGGAUGGGGGAGGACUGCUUUAUGGACUUGCAUCAGGAGUAGCAACAGGACUCUGGACUGUCUUCACACUAGGUGGUGUGGGCAGCAAAGCGGCUGCCUCUCCAGAGCUUUCUUCCCCUCUGGCCAACCAGAGUCUCCUGCUUCUGCUGGUGUUGGCCAAUCUGACAGAUGCCUCAGAUGCGCCAAACCCCUACAGACAAGCCAUUAUGUCCUUCAAGAACACACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-281.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -300.65

Frequency: 0.0000

Diversity: 259.96

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(..(((((((((....((((((.............)))))).....))))))))).(.(((((((((((.......((((((((((((......(((..((((....))))..))).....(((.(((...(((((.(((((((.((.(((((((..(((((.(((...........((((........))))....((((....))))...))))))))....)))))))...)).))))))).((((....)))).((.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).)).......((((....(((((((((((((((..(((......))).)))))((((((...((((....))))......))))))...))))))))))))))....(((((((((((..(((((........((((((.......)))))).....))))))))))........)))))))))))))))))...))))).)))))))))))))))))).).((((((((((((((((.((.................)).))))))))).)).......)))))(((((((((((.......(((((((..((((......))))..))).).))).(((((((..........))))))).((((((((((((((((..............)).))))))...........................(((((..(((((((((..(((...((........))...)))...)))))))))...)))))))))))))(((((((.((.((((...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....)))))))))..)))).)).)))))))((((..((((((........))))))..)))).........)))).)))))))....)(((...........)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((...((....(((((...{((({......,((({((...{{{|,.,|||.,.|||,,,|||||}}}},..((((((((((((.,,,..(((..((((....))))..))).....||,,.,,,||((((({(((((((.((.(((((((..(((((.(((...,,,.,,,.((((........))))..|.|||{.,,,)}}}..,))))))))....)))))))...)).))))))).((((....)}}}.{{.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).}}.......((((....(((((((((((({{(..(((......}}}.}}},|((((({...{{({....})))......)))))}.}))))))))))))))).,{{(({{{{(((({,{(((((..,,....((((((.......)))))).....)))))))))}....,,|,}}}},)})))}})}},}}}})))))}}))))))}}}||||||||{,((((..(,(((((((((.{{....,,...........}).))))))))).},)))).}})))}},,}}}}}}},,}))}}.}}})}{{{.,(({{,..,,,))}}.,))).}.,))}|((((({{.........,{((((({((((((((((((((((..............)),)))))),,,.,...,......,,}..,..,}).{{(((..(((((((({,,{{{...{(,,.,,,,,|}...}}}...)))))))))...)))}})))))))))))))|||((,((,,...(((((((((........((((((....))))))((((((......))))))...((((((..........))))))....))))))))).,))))})))))))))|(((({.{(((((........)))))),.)))),...))...))))))})(.,,.(((.{,...,).}}).....)