Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DYM_0015500
Sequence Length
2745 nt
GC Content
0.4011
AUGAAGUUUCUCUCUUGUUGCUUAGGCUGGAGUGCAAUGGUGCCAUCUCAGCUCACCGCAAUCUCUGCCUCCUGCAUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGAAAUUACAGGCAUGCACCACCACACCCGGCUAAUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCUCCAUGUUGGUCAGGCUGGUCUUGAACUCCCGACUUCAGGUGAUCUGCCCGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCGCGCCUGUCAAAAUUCCCUAUUUCUUAAGACUAAAUAAUAUUCCAUUGUGUGUAUGUACAUUUCAUUUAUCCAUCUAUCUGUUGGUACACAUGUGGGUUACUUCUACCUCUUGGCUACUGUUAGUGGAGCUGCCAUGGACACGAGUGUACAACUAUCUCUUCAAGACCCUGCUUUCACUUCUUUUGGGUAUCUACCCGGAUGGUAAUUUUAUGUUUAAUUUUUUGAGGAACUGCCAUAUUUUUGCCAUAGUGGCUGCAUCAUUUUACAUACCAUCAGUGCACAAGGGUCCUAAUUUCUCUGCAUCCUUGCUAACACUUGUUACUUUCUUUUUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCUUCCCUCCCUCCCUUCUUUCCUCCUCCUCCUCCUCCCCUCCUCCCCUCCUCCUCCUCCUCCUCCUCCUUCUUCCUCUUCUUCUUCUUCUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUGACUCUGUCUCCCAGGUUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUUGGCUCACUGUAACCUCUGCCUCCUGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCUGCAUCCUCCCAAGUAGCUGGGAUCACAGGCGUGUACCACCAUGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGUUUCACCAUAUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUCAAGUUAUCUGCCCUCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCCACCUCGCCUGGCCUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAAUAAAAGCCAUCCCAAUGGGUGUGGAGUAGUAUCUCGCUCUGGUUUUAGUGUUUCACUAAUGACUAGUGAUGUUGAGCAUGUUUUCAUGUACUUAUUGGCCAUUUCUAUAUCCUCUUUGGAAAAUGGCUAUUUAAGUCGUUGGUCCAUUUUAAAAUUGGGUUGUUUGGUUUUUGUUGUUGUUGAGUUGUAGGAGUUUUAAAAGUAUAUUCUGGAUAUCAAUCUCUUAUCAGAUAUGUGAUUUACAAGUACUGUUUUCCAUUCUGUGGGUUGACUUUUCACUCUGUAGAUAGUAUCCUUUGAUCCACAGAAGUUUUUAAUUUUGGUAAAGUCCAGCAUGUCUGUUUUUUUCUGUUGAUACCUGUGCUUUUUGGUGUCACAUCCAAGAAAUUGUUGUCAAAUGCAAUCUCAAGAAACAUAUUUUCUUCUAAGCUUUAUUUCUGUCUCUGUCUAUCUGUGCCUCUUUUCUCUGUGUCAUCUUGAGUCUGUCUCUGUAUCUGUUUCUGUAUGUUUGUAUCUUUGUAUCUUUUUUCUAUAUAUUUAUAAACCACCAAAACAUAUAUGUAUCGUCUCUCUUUUCUUGCUUUAUUUCUUCCUUUUCCUUUUUUUCUAGAACUUUUUGAAAGUAUUGUAGCAAUCAUGACACUCCAUGUAUUUCCUAAAAAUAAUAGCAUAUUUCUAAACUAUAAUUAGUACUGCCUUUAGAAUUGGGCACACAGGGCCCUUGCCUUGAGCUCUCUACUUUGGAGUGCCUUUCUUGAAUUUUUCUAAGUCUCCCUGCUGCCUUAAUGCCUGAAAGGCAGGGUGCCCCAAGCUCUUCUCUUUAGGAGUCUCAUAUUUAGAAAUACAGUAAAUUUCCUAAUUAUAUUGAAAAUUGAAGCCUAACUUUUUUUUUUGCUGAUCUUAUUGUUCACUACUGUGCACCAUAUUUUUCUUCUAAAUUAUUUUUCUUAUCUUUAUAUAUUUCUUUAACUGAUUAGCAUGUACAUAUUUAGUAUUAUAGUCAUUAAUUACCUUUAUUCUUCUGUCUCUCCAGUAGUGAGUUGAAACUCUUGGAGGAAGCAACCAUUUCAGUCUGCAGGUCAUUAGUUGAAAACAAUCCUCGAACAGGAAAUCUUGGUGCACUAAUUAAGGUCUUCCUUUCUAGAACCAAAGAACUAAAACUUUCAGCAGAAUGUCAGAACCACAUCUUCAUUUGGCAGACACACAAUGCUUUGUUUAUUAUUUGCUGUUUGCUGAAAGUGUUCAUCUGUCAGAUGUCAGAGGAGGAAUUACAACUUCAUUUUACUUAUGAAGAAAAAUCUCCUGGCAAUUACAGUUCUGACUCAGAAGAUCUUUUGGAAGAAUUGCUGUGCUGUUUGAUGCAGUUGAUCACUGAUAUUCCACUCUUAGAUAUUACAUAUGAAAUAUCAGUAGAAGCUAUAUCAACAAUGGUUGUUUUCCUUUCCUGCCAACUCUUCCACAAAGAAGUUUUGCGACAGAGCAUCAGCCACAAGUAUUUGAUGCGAGGUCCAUGUCUUCCAUACACCAGCAAACUUGUGAAGACCUUAUUAUAUAACUUUAUCAGACAAGAAAAGCCACCUCCUCCAGGGGCCCAUGUUUUCCCUCAGCAGUCGGAUGGGGGAGGACUGCUUUAUGGACUUGCAUCAGGAGUAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-651.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -706.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 581.21
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((......))..(((((((((.((((((((((((..((.((.......((.....)).......))))..)))))))..(((((.....(((((((((..(....)..))))).....((((((.((.((((.(((...((((((....(((((((((((((((((((((............((((((((.(((((((((........))))))......))).))).)))))(((((......)))))..((((((.((......)).)))))).......))))))))))....)))))).)))))(((((.((((((((..(((...................)))..))))))))))))).............))))))..)))..)))).)))))).))...((((((((................((((((.....((((.....(((((....)))))(((((((......(((..((.....(((......(((((............)))))....)))))..))))))))))))))....))))))...........(((....)))..))))))))....................................................................................................(((((((((...........................................................................((((((..(((((((.((....((((((.((((((((((((((.((....)))).)))))))..)))))...))))))....))......(((((((((..........))))).))))...((((((((......))))))))(((((...........)))))((((.(((((((((.......((((((((.((((..........))))......((((((...(((.((((((.....)).)))))))...)))))).(((.....)))))))))))................................(((((((((((.((((((....(((((.(((....(((((..((((((((((...)))))).)))))))))......(((((....)))))(((((.(((((((((.....(((.....))))))))))))..)))))..))).)))))......)))))).....)))))))))))(((((((.....((((((....(((((((((....((.(((((((.......(((((((((..(((((...............(((((((((((((......(((........))).....))))))))))))).............))))).....))))))))).........))))))))))))))))))(((........)))((((((.(.((.((...(((..(((((((.(((((...........((.........................))..........)))))..)))))))..)))...)))).).))))))((((((((.....((((((.................))))))......))))))))...................(((((.((...(((.(......((((.....))))......).)))...)).))))).((((......))))...))))))....))))))).(((((((((((((....))))..(((((........)))))....(((((((((((((..((.(((((...))))).))................((((.(........).))))........))))))))).))))...((((((......)))))).......)))))))))(((((((((....)))).))))).....))))))))).))))...(((((((((.......((((......((((((((...((((((((........(((((........................(((((....((((.......))))..)))))((((((.((((...........((.((((((.(((........))).)))))))).(((..(......)..))))))).)))))).)))))........))..))))))...)))))))).......(((((........)).)))...))))........))))))))).))))).))..))))))(((((((((((.((((...((.....................)).....))))...)))))))))))...)))))))))......((((((.......))))))...........))))))))).((((((.(.(((((..((((((((((((...((...))((((.((((.((((..(.(((((((((.((.................)).))))))))))..)))).)))))))).((((..............))))..))))))).)))))..))))).).))))))..)))))........((((((((((.(((((((((((((..............)).))))))...........................(((((..(((((((((..(((...((........))...)))...)))))))))...)))))))))))))))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((......))..((((((((((((..((((((((.(.(((((((..((((({.,,(((.....}||,...{((((.(..(((((((..((({{((........))))))..))}}))))..).))))),{,{,.,,...||{{,,....(((({((((((((((((((((..,.........((((((((.((({,,((,..,{....,,},)).,.,}.))).)))}}))))(((((......)))))..((((((.((......)).))))))....,..))))))))))....)))))).))))},(((,,((((((((..(((...................)))..))))))))))))|........,,...,}))),..,)},.)))))))))..)))).))).}.)))))..............((((((.....((((.....{((((....)))))(((((({.....,{{(..{{.....|||,,....(((((.........,..)))))..,.}}},,..}}})))))))))))....))))))...........(((....))){(((....)))}...................................................................................................,,,,,,,,...........................................................................|||{{||||((((((,|{{,,.((((((.,(((((((((((((.(,....}))).)))))))..)))),...))))))....||{{....,{{|(({((....,,,,,.}}}}},))))...((((((((......))))))))(((((...........))))){(((.(((((((((.......((((((((.((((..,....,..))))......,{{{{{...(((.((((((.....)).)))))))...}}||||.{,,..}}})),))))))))................................{((((((((((.((((((....(((((.(({...,{(((,{{((((((((((...)))))).))))))})}.,....(((((....)))))(((((.((((((((({{{..,,,....}))))))))))))..)))))..})).)))))......)))))).....))))))))))|(((((({.....((((({.,..,,{{(((({....((,((((({{.....,.((((((((((((((((.,,....,.......(((((((((((((......{({......,.))).....)))))))))))))......,...,,.)))))}))..))))))))).........}}}|||||}}}}}}}}||{((||,,,,,..,,{(({((,(,,,.{{...|||,.{{{((((.({({{...........((.......................|,||..........}|}}|,,}}}}|||..}}}...}|||,,,||||}}{,.,(((((((....((((.........,))).,..))))))),}}}}))}}|||||||....|,|.........{((({.{{,,,(,,........,,,,.....})}}......)}))),,..},))})}..||))),,..}}}}|},}}}}}}..,.})))))),{{{{{((({((((....)))}..{{(((..||,...))))},...(((((((((((({|.((.(((({...})))).)),...{,,{,,....,,.}||.......|{,,.......,}..,.))))))))).))))...|||{{,......)))))}.,.,,,})))))))))|{{{|||{|..,.)}}}.}}))).....))))))))).)))}...{((((((((.......((((......((((((((...{(((((,,................................,,,.((((((....((((.......))))..)))))}|||{,.{{{,...........{,,((((((.(((........))).)))))))}.{{{.........}..})}}))}.}}))}||}}},.......,.}}..})))))...))))))))......,(({{{.,,,....)),,))...))))........))))))))}.}}}|||.,..}}}}}}({{((((((((,{{{{{{,{,.,,,,........,}|,,,,,)),}}},))))...))))}))))))...)))))))).......((((((.......))))))...,,,{{..((((.......((((((.(.(((((..((((((((((((.,,({...||(({{(((((.((((..(,(((((((((.{{....,,...........}).))))))))).,,)))).))))))}}.|((|..............))))}.))))))).)))))..))))).).))))))....))))..)).,,|(((((((((((((((((((((((..............)),)))))),,,.,...,......,,}..,..,}).{{(((..(((((((({,,{{{...{(,,..,,,,|}...}}}...)))))))))...)))}}))))))))))))))})))))))))
Back