Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DYM_0017400

Sequence Length

1953 nt

GC Content

0.3922

AUUCAGAAGACCCAGCUGUCCAUGUGCAUCAUCGGGGAAGCAUCUUGCUCUCAGAAUAAGCAGCUCAAUCCAGCUCCCAAAUUCUGACCGUGGCUUCAGUGCCUUUGUGGAAUGAGAAGGGACAUGAGGAAGAAAGUGAGUCACUAAUACACAUUCUCACCUGACCUGAGCCGCCUUUGGUCCCUGAGGCCAUGUAGUUUCCUUUCAUUGUGAUGGUAAUUUUAAAAUAGUAUAAUGUAUUAUUUAUCUUAUCACCAUUUUAUUAUUCAAUGGGAGAACUUUUCUGAACAAAUCAAGAUAAAACAUGAUCUAAAUCUAUGUUAAGUGUGAUUUAAGGGAGACAGUGAUUCAUAUUUGUAACUAGUUUUCUUCCCUUAGUGACUGAGAACAACCAAUACUGACUUUUGAAGAGCCUCGUGGAUACUAAUUAUUUAUUCACUCCCUUGUUCCUUCAACAUACUGUUUAGGGAAUUUUUUACAUGCUAGUCUAGACAGUGGGCAUAGACAGAUGAAUGAGAUAAUUCCUGUCGUAAAAAUGUGCAUGGUUUAGGGGAAGAGGCAUAUCAACUAAAACUGCAUAUGUGCCCUACAGCAGAAUGACAGAAACAUUAAAUGUGAUUCCUUUGUAAUUGGGAUCUCUUUCACUUGAAGUUGGUAAUUCAGGUUUGUCCCUAUGACCCCCAUAAGUAGAAGUAGCACAUGGUAAUUACUUGAGCUAUGUUCCCUUCCUUGUACAUUCAAGCCAUCCAGAUUUCUGUAUUUCUUUGUCACCAUUGUUUUGGUUGUAAAACAGCUUCAUUUUCAGACUAAUUAUAAGUUACCAUUAUUAUGAUUUUGCUUUGAGACAUUUUCUUGGGUAGAGCUAUGCCCAUCCUAAGAUACAUGGUACAAGUACAAUAUAGAUUCGGAUUUUUGUGUUUGUAUUGGCUAAGACAGGUGUUAGCUCCAUAUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUCGCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCGAUCUUGGCCCACUGCAACUUCUGCCUCCUGGGUUCAUGUGAUUCUCUUGCCUCAGCCUCUUGAGUAGCUGGGACUACGGGUGCGUGCCACCACGCCCAGCUAAGUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCGUGUUGGCCAGGAUGGUCUCAAUCUCUUGACCUCAUGAUCUGCCCGCCUCAGCCUCCCAAAGUGUUGGGAUUACAGGCGUGAGUCACCAUGCCUGGCCUAGCCCCAUAUUUCUUGUAACUUUGUAUCUGAUGUCUAAUAUAUUUAUAAAUACAGAAAUGUGUGAUUUUCUUUAGUAAGUUUAUAGUUUUUUUAUAGGUAGACAAAGCAUGAUGACUUUUGAACAAGUUUAAAGUUUUUAUUUUUAUUUUUUAUAGGUUGUCUUUUGGAAAUGCAGGUUUAAGGACAAAUUAUCUGCUUAAGCUAGAAGAUGGGAUCGAAUAGCAGCAGAAUCGGCGAUCUUCCUAAAAAUGAGUACUUGAAAAAGUUAUCAGGCACGGAAUCUAUCUCUGAGAAUGACCCGUUCUGGAAUCAGCUUCUCUCAUUUUCUUUCCCUGCACCAACUAGCAGUAGUGAGUUGAAACUCUUGGAGGAAGCAACCAUUUCAGUCUGCAGGUCAUUAGUUGAAAACAAUCCUCGAACAGGAAAUCUUGGUGCACUAAUUAAGGUCUUCCUUUCUAGAACCAAAGAACUAAAACUUUCAGCAGAAUGUCAGAACCACAUCUUCAUUUGGCAGACACACAAUGCUUUGUUUAUUAUUUGCUGUUUGCUGAAAGUGUUCAUCUGUCAGAUGUCAGAGGAGGAAUUACAACUUCAUUUUACUUAUGAAGAAAAAUCUCCUGGCAAUUACAGUUCUGACUCAGAAGAUCUUUUGGAAGAAUUGCUGUGCUGUUUGAUGCAGUUGAUCACUGAUAUUCCACUCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-524.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -564.59

Frequency: 0.0000

Diversity: 488.05

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((..((..(((((((..(((((((.....((((((.(((...((((.((((((....((((......)))).....))))))(((((((((....(((..((((((.......((((((....((((((((((((((((((..((((...(((((...((((.(((....))).))))..)))))...))))((((((((((((((.((((((.((....(((((((((...))))))))).....)).))))))........)))))(((((...)))))....((((((..((..((((((((....))).)))))..)).))))))))))))))))))))))))).............))))))))...(((((..((((....(((((........(((((((((...(((((((.........)))))))......))).))))))...((((((((((..................))))))))))((((((.(((((..((((......)))))))))......(((((((.(..((((..((.........))..))))..))))))))))))))(((((..((((.(((...........))).))))..))))))))))..))))..))))).(((.((((....)))).))))))))).......))))))))).....))).))))))........)))).)))))))))....))))))).((((((((((.((..((((((((..(((((.(((((((((((((((((...))))).....((((((((.((((((((..........))))))))..).)))))))........((((((......))))))...))))))).))))))))))...)))))))).)))))....)).)))))...((((...((((((.((.(((((((..((((................))))))))).)).))))))))))))(((.((((((((((((.((.......))))))))).))))).)))((((((.(.(((((((..((((...(((((....)))))((((((((....((((((.....)))).)))))))))).(((((............)))))))))..))).))))..).)))))).((((..........))))(((((.((((((.((....)).((((((....))))))...((((((((......)))))))).........(((((((((.(((..((((((...(((((.....))))))))))))))))))))))).(((((........)))))(((((.....))))))))))).....))))).(((((.((((.((((..(((((....))))).)))))))).)))))(((((((((....((((((.............)))))).....)))))))))...(((((((((((.......((((((((((((......(((..((((....))))..))).....(((.(((...(((((.(((((((.((.(((((((..(((((.(((...........((((........))))....((((....))))...))))))))....)))))))...)).))))))).((((....)))).((.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).)).......((((....(((((((((((((((..(((......))).)))))((((((...((((....))))......))))))...))))))))))))))....(((((((((((..(((((........((((((.......)))))).....))))))))))........)))))))))))))))))...))))).))))))))))))))))))))))))).)).))))............

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,,{{,.(({{(((,,,...(((((((.....(((({{{(((...((((.((((((..{.((((......)))).,...))))))(((((((((....(((..((((((.......(((((((..,((((((({(((((({(({..|,|{|.||{{{{...((((,(((..,,|||.)))}.,}}))},,||}||((({{(((((((((.((((((.(,....(((((((((...))))))))).....}}.))))}}........)))))}}|||...,||||....((((((..{{..((((((((....))).)))))..}}.))))))|||}}}}}}}))))}})}}.............)))))))}|{{(({,,,||||.....{{{,{|||||,,,{{(({{{({...(((((({.........)))))))||||,,||{{{||.||{,.,,||||{|||}}},......,.......||||}}}}})||||{{.(((((..((((......)))))))))......||{||||,|}|||||}}||,}}}}}.{,||,,||,,,.||||||,|}|||}}{((({.,((((.(((...........))).))))..})))}...))),})}}..})).,.}|)))))))}.})}})))}))))))).,.....))))))))).....))).))))))........)))).)))))))))....))))))).{{{(((((((.((..((((((((..{((((.(((((((((({(({{({...))))},....{((((((,.((((((((..........))))))))..}.))))))}........((((((......))))))...,}}))|},})))))))}|...||||||||.}}}}}....)).))))),,.|(((...((((((.((.(((((((,.,(((................))))))))).)).)))))))))))|(((.((((((((((((.((.......)))))))))},)))).)))}.}}||}}|((.(((({{,.({,{{(((({....,))))((((((((....{{((((.....)))).}))))))))).{{{(({(,..,{{{.{{{({({({|,.....))))|{,((((((((((((.,,,......{{{.,{{{{{.{{{{..,{(({,,{{,({{{{,,,.,))))),...})))))))))}}))))).))))))).})),,((((((((||(({..{(((((..,|{{{{...,,}},..)))))))))))))))))).}.....}}}}}.}))},{||||{.....}}}}}}}.,,)}}}}}}{{((.((((({{(({....|},}))))}.}})),}},,|,,,,,),})}||(((((((((....((((((.............)))))).....)))))))))}}.(((((((((((.......((((((((((((.{{{..{((..((((....))))..))).....,,..,,,,,{((((({(((((((.((.(((((((..(((((.(((.....,.,,,.((((........))))..,.|||,.,,,)}}}..,))))))))....)))))))...)).))))))).((((....)}}}.{{.(((.(((((((((((((......)))))))).)))))))).}}.......((((....(((((((((((({{(.,(((......}}}.}}},|((((({...{{({....})))......)))))}.})))))))))))))))..{{(({(({(((({.,(((({..,,....((((((.......)))))).....))))))))))...,,,}.))))}))))))}))).))},)))))},))))))))))))))))))))),.)}))}))))........,,,.