Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DYM_0018800

Sequence Length

1692 nt

GC Content

0.4072

GCGGGAGGAUUCUUGAGUCCAGGAGCAACAUAGCAAGACCCUGUCUCUACAAAAAACUAAAAGAAAAUUAGCCAGACAUGGUGACUCCUGAGUAGCUACUCAGGAGGCUGAGAUGGGAAGAUCUCUUGAGCCUGGGAGGUUGAGGCUGCAGUGAGCUGUGAUCACACUACGACAUUCAGCCUAGGUGACAGAGUGAGACUCUGUUUCAAAAAAAAAAAAAAAAGUAAAUAAAUACGAAGAAAUUUUGCAAGAACUACCAAAACGUGAUGCAGAGACAUGAAGUGAGCACGUAUUGUUGGAAAAAUGGUGCUGAUAGACUUGCUCACUGCAAGGUUGCCACAAACCUUCAAUUUGUAAAAAAUGCCAUGUCUUUGAAGCACAAUAAAGCAAAGCACAGUAAAAUGAGUUUAUGUUAAUUUUAUUGACUAAACUACACCCUUCACUCAGACUUUCACUAACUUUCUCCUAAUCUGCCUUCACUGUUCCAGGAUCCCACCUAGGGUGCCACAUGACAUCUAGUCAUCAUGUAUUUCUCUGGUCUGCAACAGUUUCUCAGAUUUCCCACAUUUUUUAUGCCUUUUGAUGAUUUUGGGGAGUAUUAGUAGGGUAUUUUCCAAAACGUUCCUCAAUUUGAGUUGUCUGAUGGCUUUCUCAUGCUUAGACUGGGGUUAUAGGUUUGUGGAAGGAAGACCAUGGAGGUGAAGUGCUGUUCUCAACACACCGUAUCAAGGGGACAUGCUAUUAAUAUGACUUAUCACUGAUGGUGUUGAUGUUGAUCACUUGGCUGAGGUACUAUUUAUCAAGUUUCUUCAGUGUAAAGUUGUUUCUUUCUCUCCUGAUCCCUUCAUUUUCAAAGGAUAGUUUUUCUAGAUAUAGAAUUCUUGGUUAACAUUUUUUUUCUCUUUCAGCACUUUGAACAUAUUAUUCUACUGCCUUCUGGUCUCUAUUUUUUUCAGAUAAAUCUGACGUUAAUUGUAUUAUUGUUCCCCUGAAAAUCAUGAGAAAUUUUUUCCUGCUGCUUGUAAGGUGCUCUCUUUGCCUUUUAAAAGAGUUUUUUGGCCAGGCAUGGUGACUCACACCUGUAAUUCCAGCUCUUUGGGAGGCCACGGCAGGAAGAUUGCUUGAGGCCGAGAGUUAGAUGCCAGCCUGGGCAACAUAGCAAGACCCUGUCUCUACAAAAUAAGAAGAAAAAUAAAAAUUAACCUGGCAUGGUGGCAUGCAUCUCUUAGAUGUGUAGAUUAAUGUUUUUCAACAAUUUUGGGAAAUUCAUUGCCUUUUUUUUUCUUUUUUUAAGGAAUAGGGUCUCACACUCUUAUCCAGUCUUGUCUUGAACUCCUGACCCCAAGCAUGCCUCCCACCUCAGCCUCCCAAAGCACUGGCCAUUAUUUUUGUUAGGCUUUUUGUGUUUAGCUUUAUUACUUUUUUCCUGAAUGUACACAUAAGGUUUUCUGGAUCAGAUUUCUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUUUUGCUCUUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGUGUGAUCUCCACUCACUGCAACCUCCACCUCCUGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGUCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGCACCACCACACCCAGCUAAUUUUGUAUUUUUAGUAGAGUUGGAGUUUCACCAUGUCAGUGAGACUGGUCUCAGAACUCCUGACCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-552.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -583.22

Frequency: 0.0000

Diversity: 300.62

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((..((((.(((.((((...((((((.(..((((((...((((((.(((((.....(.(((((((((......(((((...((((..((((((((..((((((((((((((((.(((..((((((((((((((((.((((.(((((((((.((.((((((((((...((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((........(((......)))((((((((((....((((..(((.....(((...((((((((((.((((((((.((.(((((((..........))))))))).))))))))..((((((......))))))..((((.....))))..))))))))))...))).(((((((.((((((((.......((((((.((((((...)))))))))))).((((...((..(((.(.......((.((((((..((((((.....((((((.((((.......((((((....((((((..........))))))....)))))))))).))))))....)))))).....(((.....))).......((((((((((((((((.(((((.(((...(((((((((...(((((.(((((((.....((......))....))))))).)))))......)))).)))))(((.(((((.(((((((((((((((........(((((((......(((.((((.......)))).))).......))))))).(((((((((((....(((((((.(((........)))..)))))))..((((......))))((.((((.................)))).))...(((((....)))))....)))))))))))............))))))))).................)))))))))))))).......(((((....))))).....))).))))).))))))))..)))))))))))))).))......))))..))...))))........((((.....((((((....((((((((((.((((.....)))))))..........(((((((((((...((..(((.(..((((((.((.((.(((((.((.((.((.(((((..........(((((((((.(((..((((.(((((((((((.........(((......)))((((((.((.(((((((..(((.((..........)).)))..))))))).)).)).)))).))))))))))).))))..))))))))))))..........))))).)).)).)).))))).)).)).))))))..).)))..))...)))))))))))..)))))))..))))))...))))...)))))))).)))))))(((.(((.....))).))).......))).)))).....))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))).))))).)))))...))))))))))..))))))))))).)))).))))))))))))))))..))).))))))))))))))))..))))))))......))))....))))).........))))))))).).))))).))))))..)).))))..).))))...))...)))).))))))))))))).)(...)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((..((({{(((.((((..{(,((((.(..(((({(,,.((((((.(((((.....{.(((((((((..,...(((((...(((({{((((((((..((((((((((((((((.(({..((((((((((((((((.((((.(((((((((.,(.((((((((((...((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((({,.....(((......|||{(((({{(({,,{,((((..(({.....(((...((((((((((.((((((((.((.(((((((..........))))))))).)))))))){.((((((......))))))}.,,{{.....,,,}..))))))))))...))),{((((((.((((((((.{{,...((((((.((((((...)))))))))))).|{,{,,,((..(((.{.......,,.{{{{{{..((((((.....((((((.((((...,,,.{,((((,{{.,,(((((.....))}}),,,)),...))}))))))).))))))....)))))).....{{{.....}}}......,((({((((((((((((,({{{{.|||,,|||||||||{,|.{((((.{{{|||{.{{,,({.,,...}}.,,.))))))).)))))....},)))),}))))|(,((((((.(((((((((((((((....,,..{(,{{,{...,.,(({.{(((,,,,...}}}}.}},.,,..}}))))))),|((((((((((.,..(((((((.(((........)))..)))))))..,{||......}}}},..,,{{|{..,,,{........})))}.,}...(((((....)))))....}))))))))),............))))))))).................))))))))))))},.......(((({....))))}.....}}).))))).))))))))..}))))))))))))}.,,.....,})))..)).,,))))..,,,,,,{{{{....||||||,....((((((((((.((((.....))))))).......{,,{{(((((((((...((..(((.(..((((((.((.((.(((((.((.((.((.(((((.......,..(((((((((.(((..((((.(((((((((((.........(((......)))((((((.((.(((((((..(((.((..........)).)))..))))))).)).)),}))).))))))))))).))))..))))))))))))..,.......))))).)).)).)}.))))).)).)).))))))..).)))..))...)))))))))))}.)))))))..}))))),..))))}},)))))))).))))))))||,|||..,,.,,|,|,...,,,..))}.})}}|...,)))})))))))))))))))))))))))))))))))}})))))).)))))))))))...)))))))))).,,,))))))))).)))).))))))))))))))))..}}),))))))))))))))))..)))))))}...,}.))))....))))).........))))))))).}.))))).))))))..)).))))..).))))..})}...)))).))))))})))))).)(...)