Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DYM_0018900
Sequence Length
2632 nt
GC Content
0.3784
UGAGUUGAAACUCUUGGAGGAAGCAACCAUUUCAGUCUGCAGGUCAUUAGGUAAGUGGGAAAAAUGUGUGUGGGGUGUUGUUUUCAAAUUUUGUUUUAGAUUUUGAUAGUAUAAUAUGAACUGAAUUAAUGAAGUAAUUACUCUUCUUUGAUAGCAAUAGUAAUAAUUUUUUCUAUUUGUGGCAUUCACAGAUGCUGCUAGAAGGUACCCUUCAGUCAAUAGCAAUAUGACACAUGCUUGGCUAUAUCUGCAGUAGUGGUAAUGGACUCUGCUAAGCCAUAGACACUCUUUCGUCUUGUUCUUUUUGUGAAUUUUGAAAUACUGAAAAUAAUGUGAUUUACCAAGUGCUGUUAUUGACUAUGUUCACCAGAACAAUAUUAAAAUCUAUUAAGAAUGUAUAUUAGGAAGUUUCCAUAACAACUUGAUAUUAUGGCAAAGAGCAUGGAAUCCAGAAUCAUUUUAUGAUUUUAAUUUCAGCUGUGCUACCUAUUAGCUGAGCCUUAAUUUCCUCAUAUAGAUUGAGGAUAAGGACAACUAUUUACAGGAUUCUUAUAAGGAAAAAUUAGGUAAUAUGAAAUAUUCAGUACAAUGUGUGUCAUGUAGUCAUUGCAAACCAUUUAUGUCAGCAAAUGUUACCCUUUUCAGGUCUUGUUUCUCAAAUGCUUAACUUUCAAGUUCAUAGCAAUUGGAAGGAAAUUGUAUAUAUUUUUAAAAUGCAGGCAGUUUUACUUAGAUUGCAUUGGUGCUUUGAAAAGUAAGACAAUGUGUCUGUGAAAUACCUAGGGUACAGGAAUGUAAUAAGUGAGAACAAUAUUCUGUUUUAAAAUCAGGCUGUCUAGGCCGGACACAGUGGCUCACGCCUAUAAUCCCAGCAUUUUGAGAGGCUGAUGCGAGUGGAUCACGAAGUCAGGAGUUCAAGACCAGCUUGGCCAAGAUGGUGAAACCCCGUCACUACUAAAAAUCCAAAAAUUAGCAAGGCAUGGUGGUGGGCGCCUGUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGAGAAUUGCUUGAACCCGGGAGGCAGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCGCGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAGAGCGAGACUCUGUCUCAAAAAACAUUAAAAAAAAAAAUCGAGCUGUAUGGAUAACUCCCAUAUAAACUAUUUUGCUAAAAACAGUUUUUGAUGAUUUAUUUUUUUUUUUAAAGAGAUAGAGUCUUGCUUUGCUGCCCAGGCUGGAGUGCACUGGUGCCAUUGUGGCUCACUGCAGCCUUGAUCUCCUGGGCUUCAGUGAUCCUUCCACCUCAGCCUCCUCAGAAGCUGGGGCUAUAGGUGCAUGGCACCACACCUGCCUAAUGAUUUUAUUUUAUUUUUGUAUAGAUGGGGGUCUCCUGUGUUGCCGAGGCUAGUCUCAGGCUCCUGGCCGCAAGCCUUCCUCCUCCUACCUUGGACCCCCAAAGUGUUGGGAUAUUACAGGUGUUAGCCACCGUGCCUGGGCCCAAAUAUUUUUGUUUUUAAAAACAAACUAUGUUGAUAAUGAAAAGGUGUUAUUGUAGUAGUUGUCUUGCCUUACAACCAUAGCUUAGGGAAUUUUUUGCUAAAUAGAGCUGGCUUUCAAAAGCCAUGUCGCAAUUCAGUGCUGAAAAUUAAGGAGUUUUAUGUAACAAUAUUAGUGUAGUUACUGUGAUAAUGGCUUUUAAGGUGACUUUGGGUUUUUAAAAAAAUUAUAAAAUUAAAAGAUGAAAAAACAAAAAUAUAACAAAGCAAUGAGAAAACAAAGAAAAAAUUACAUUAAGAAAACUGAAAGUAGCUGGGAGUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUACUGGUAACUUUAGGAGGCUGAGGCAGGAGGGUUGCUUGAGGUCAGAGUUCAAGACCAGCUUGGGCAACAUAAUAAGACCCCAUCUCUUACAAAAUCUACAUCUUACCCAUCUACACGCAAAAAAAUUGAAAAAACUUAACCAGGCAUGGUGGCAUGUGCCUGUAGUCUCAGCUGCUUGCGAGAUUGAGGUAGGAGGAUUGAUCGAGCCCAGGAAUUUGAGGCUGCAGGGAACCAUGAUGGCGCCACUGGACUCCAGUCUGGACAAUACAGCAAGACUCCAAAUCUAGGGGCGAAAAAAAGCAAGUAAUAUUUACUCAUUAUACAUAAUGUGGAAAGCAUACUAAAAUGUAAAUGAGGUAGUAAUUGCUCAUAAUUUGAAAACCCUGACAUAGGCAUUGUUGAUAUUUUUGUAUUUUUUCUUCUACUACUUAUUCAAUAGAUAUAAAUUUAUAUAUAUAUCAUCCACCACACACACACACACACAGACACACACACACAUUUUAAUCUGUGUUUUUCACUUGACAUUGUAUCAGGAAUGUGUUACAUGUUUAAAAAUACUUUUGGGAACAGCAAAACAAGAUAUACAUUUAUUGCCCCAAAUUCCAGUAAUGUGAUGGUAUGGCUAAAAUAAAAAUCAUCUCAUAUUAAACAGUACAUGUGUAAUCACUGCUAAUCUUUUGUGACAAUUUCAUAUAAAUGGUAUUAUUUAUAUUUUGUUUACACGCAGCAACAUGUCAGGAACCUCUUCACAUCAAUAAGUAUAAGUGCAUAUCAACUUUAAGGGCUAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-812.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -862.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 501.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((.......(((((.((((((((((((.(..(((((((((.......((((((((...((((((((.(((((((....)))(((((....((((((((((((................(((((.((((........)))).)))))...(((((.((......)).))))).((((((((....))))))))..(((((...)))))(((((((((((..............(((((......((((.(((........)))))))..))))).((((........)))).((.(((...(((((((.....................))))))).))).))))))))))))).(((((....))))).))))))))))))...)))))..((((((((..(((.....)))..))))))))....((.....))..(((((((((((((((...))))))))...((((((((..........))))))))(((((...((((((.......))))))))))).............))))))).(((((........(((.(((((((((...(((..((((((((((((.((.((((.((((....(((((((..((.....(((.(((((....((((...(((((((((.((((.((((....))))...)))).))))..((((((.......)))))).....((((((((((((((((.....(((....)))......)))))))))....))))))))))))))))))))))))....))..)))))))((((((......))))))..........(((((((((.(((..(((((((....(((.....((((.((.(((((((...(((((....(((...)))...)))))...)))))))(((...)))....(((((.(....)))))).........(((((.(((((((...(((((.(((((((.(((((((((.((((((((.((.((((((((((((..(((.((((((.((((((((((((..(((((((((((((((((.(((.((((((.((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((........((((((((((((((.....(((((((.......)))))))((((.((((....)))).))))...........)))))))))))))).))))))))))))))))))).)))))))))))))))))).)))))).))).)))))))))))))))))..))))))))).))))))))).)))...)))))))))))).)).)))))))).)))))))))....)))))).).)))))..))))))).......(((((((.((((((((.(((..(((((((((.(((((.((((..(((((.(((((.(((((.....(((((((.((((((.((((.(((((..(.((.((((((((((((.((((((((..(((((......((((((((((((((.......((((((..(((((((........)))))))..))))))(((((.(((((...........)))))((((((((...((((((((.(.(((((.(((((((((((((((.((((....))))................(((((.(((....))).))))))))))).)))))))))))))).)))))..))))...))))))))..........)))))..)))))))))))))).............................((((....((....))....)))))))))..)))))))).)))))))))))))).)..))))).)).)))))))).)))))))..))))).))))))))))..)))).))))).)))))))))...)))))))))))..)))))))......((((((((((((...(((((..................((((....))))(((....))).(((((....))))))))))))).)).)))))))))))).....(((((((....))).)))))).))))........))))))))))...))).))))))))).....)))))))).)).....((((((........))..((((((((..((((((.(((((..((((.....)))).....)))))))))))..))).)))))(((.....)))...)))))))))..))))))))))...)))))))))...))).......)))))......((((((.((....)).))))))...)))).))))))))...(((((((..................))))))))))))))))))).))))).).)))))).))(((.(((((((...((((((((((....((((.................))))))))))....))))(((.((((((...............)))))).))).))))))))))...(((....))))))).....(((.(((((.....(((((((((....))))))))).(((((.......)))))..))))).)))))))))))..)))(((.((..((((........)))).....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((,......(((((.,{{({{((((((.{..(((((((({.......((((((((...((((((((,((((,{(....}},{{(((....((((((((((((........,..,{...(((((.((((........)))).)))))...{((((.{{......}}.))))}.((((((((....))))))))..(((((...)))))(((((((((((.,{{{.,,{||,..(((((......((((.(((........))))))).,))))).((((........)))).((,(,,...{,||||{.,................,,,)})}}}}.}})})}))))))))))).{((((....))))}.))))))))))))...)))}},.((((((((..(((.....)))..)))))))),||,{{.....}),,(((((((((((((((...))))))))...,(((((((..........)))))))}(((((...((((((.......))))))))))).............))))))).,.{(((((({{,..,,.,{{{{(((({{,{((..((((((((((((,{(.((((.((((....(((((((..((.....(({,(((((....((((...(((((.({..{(((,,{{((((((({{({..((((((..{{{((((((((...(((({...})))}...)))))))}.}}}.))))))..}}}.))}}})}}))))}||{|,...)))))).)))))))))))))))))....))..)))))))((((((......))))))..........(((((((((.(((..(((((((....(((.....((((.((.{((((((...(((((....(((...)))...)))))...))))))){{,.,,})},...(((((,{....,}}})).........((({{.(((((((...(((((.(((({((.(((((((((.((((((((.((.((((((((((((..(((.((((({,((((((((((((..(((((((((((((((((.(((.((((((.((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((....,...,{(((((((((((({{{..(((((((.......))))))}((((.((((....)))).)))),.,,,,,,}},.)))))))))))},.))))))))))))))))))).)))))))))))))))))).)))))).))).)))))))))))))))))..))))))))).))))))))).)))}..)))))))))))).)).)))))))).)))))))))....)))))).).)))))..))))))).......{((((((.((((((((((((..(((((((((.(((((.((((..(((({,(((((.(((((....,{((((((.((((((.(({(,(((((..{.((.((((((((((((.((((((((..((((({{....((((((((((((((....{{,{(((((..{((((((,......})))))))..))))))||.,,.{{{{{...,....{,,|||}|{{,{{|||.}}|,.{{{{|.(.(((((.(((((((((((((((.,,{,.,,,|}||.,,{....,}}},...(((((.{{{....}}).))))))))))),}))))))))))))).)}|||,.||||,,.},,,,,}}....,,,,.,,,,....))))))))))))))..........,,.................,{((.,,.{{....))..,.)))})))))..)))))))).)))))))))))))).}..))))).)).)))))))).)))))))..))))).))))))))))..)))).))))).)))))))))...)))))))))))..))))))}......((((((((((((...(((((......,,,......,..,,(({{({{|,,,,,.,}})))}|((((.,,.)})}}})))))))}}).)))))))))))}.....(((((({....})).)))))).))))...,,..,))))))))))...))).))))))))).....)))))))).)}.....{((({{........}}.(((((((((..((((((.(((((..{(((.....)})),,...)))))))))))..)))},))))),,....,),....)))))))))..))))))))))}}}))))}))))))))))}.................((((((.{{....)}.))))))...)))).))))))))...{((((((..................))))))))))))))))))).))))).}.)))))),}}|{{.(((({{,...{{{{((((((....((((....,,.......,,,.))))))))))....}}}}(((.((((((.,.............)))))).))).}))}))}}}|||,(({....}}}|||}.......{{((({({....(((((((((....))))))))).}|||},,}}.}}}},,,,})))}}}}}.}}))))))..)))(({,((..((((........)))).....)))))
Back