Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DYM_0019400
Sequence Length
1591 nt
GC Content
0.3979
GUGAUCCACCCGCUUCAGCCUCCCAGAGUGCUGGUAUUACAGGCAUGAGCCACAGCACCCAGCCUAGUUGUGAAAAUUUUCAUAACCACUUCCUUACUGAAUUAUCUUCCGGGUAGCCCAAUGAAGUUUCUUAACCGUGUUUCAGAUUUUGUGUGUGUGUGCGUGUGUGUGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGGUUGAUUGAUUGAUUCUUGGGCAUAGUUCUCCAAUCCCUUAGUAAUUGUUUAUUGUGAUGUCACCAGCAAAACUGACACAAAGAAAUGACAGAUGUUUGAGAUGAGGAUGCCCCAAUUACCCUGAUUUGAUCUUUCACAGUGUGUACAUGUAUCAAAAUACCACAUGUAUCCCACAAAUAUUUACAAUUAUUAUGUAUCAGUAAAAAACAAAAUAAAACUGAGAUUCCAGUUUUGUGACUCCCAUCUGUUUAUGUUGCUGCCAAAGUGAUAGUGUGGCCAUCCUCUGAGAAGAAGGCUUCUAAUAUAUGGAUUGCUUCAGGGAGAGUCACACCUGGUCAUUGGAUCAGUAUGGUUGUUGAGAGUUUAGUUUGUUUAGCUACUUUGACUAAGAGAUUACUAGUUUUAAGUAUUUAUCCCUAAUUUCCCACUAUUGACAGUUUUCAAAUUGACCUGGAGGUAUGGAAUUUAUGUAUGCAUUAAACUUGAAGUAUACUGUGUGAUACUUAUUUAGUCUGAAUUAGUAUGAAUAUUUGACACUGCCUUUUUGCCCCCUUUUGUGUGUUUUUACUGCCCAAAUCUGCCUUCAGAAACAACAUUUGGUUUCUAAUUGUAAUAUUCUUGGAAACACUGGCAUAUUUUUACAGUACCAUUUUACUUUUAUUUACUGCAAAUGAUGGUUUGUUAGUUGCCUGCUGCCAGCACAUCUGAGCUCAUUUGUUUAACUAAAACAGCAUUGUGCAUAGAUGCCUGUAACAGGCAGCAACAGUUACCAACCACCCCAGUUCCUUACUACCUCAUUAUAGCUCUAAAUCAAGCAAAUAGGAAAGCAGAUUAUUCUUAAAAUGUUCCAAGAAGUUUAGAAAAUUGAGGGAUGGAAGGAUGAAAGGAAAGGAAUUCUAAUGUAACAAAUAAUUGGUGUGUUGCUUUUGGCAGGGGUGUGCCUGGCUGAUUUCUUCUGUAGAAAUAACUAACACUUCAGAGUGCAGAAAUUGCAGGCAUCCUGCAACAAACAGAGCUCUAUGACUCCUUUAGUUAAUAAAUAAUUACCAAGUGGUUUUUUUCUGGCUGAGCCACUGUAUCAGACACAGUGGGGGAUGUAUAAGUGAAUGAGAUCUUCCUGUUCUCUUGGAGCUUAUAAUGUGGGCUCUGAAGAUGCUUCUGCUCUAAAGUGUUGAUUGUUGAACGAGGCAGUGGCAGUGGUGCUGUUUCAGAUUGUGGCUGUGUGUUGGGGGAUCCAGGCCUGGGGGACAUAGUCACAGAAUGGCAGGUGCUGGCUGGCUCACCACAGUGGGGAGCUUUCCAGAUAAUUCUGACAAAUCAGACUGCUUCAAAAGGAUAUGCUCUUUUAUAUUUGGAAAGAAAGAAAUGUCUUUUAGUCUGGGUGCUAUGGCUCACACCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-442.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -473.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 470.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..(((((..........))))).))).)))))(((..(((((((.(((((((((.(((((((((((....))))))))(((((((...(((.((((((((((((((..............((((((.(((.(.(((..((((((((..((.(((.(((((.((((((.((..((..((......))..))..))..)))))).)))))...............(((((....)))))(((....)))..)))..))..))))))))...))).).))).))))))...((((.(((((((.((.(((...(((....)))))).))((((((((...........)))))))).(((..((((((.(((((((........(((((((((((((((((((((((......)))))))))(((........)))..(((((((.....)))))))(((((((..(((.((((......(((.((((.....))))..))))))))))..)))))))((((((....))))))...(((....(((.((...(((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((.(.(((.((((...((((..(((...(((...))).)))..)))).)))).))).).))).))...)))))))....)))).))))).)))..)))))).))).)))).))))))...)))...)))))...)))....)))))...))))))))).(((((((((....)))).......)))))....)))))))))))))..)))..((((.(.((((.(((.((((((((((.......((((((.....))))))(((((((((.((((((((.(((.((..((((((.((.((.((((((.....))))))...)).)).)))))).))))).)))))))))))))..))))..((((((.(((((((.((((((((.......(((((((..........(((..(((..(((....)))..)))))).....)))))))....)))))..))))))))......(((((.(((.(((((..........)))))...))).))))).)).))))))((((..((((....((((.((...(((((.((((((((.(((..((((((.(((((((...)))))))....(((((((((((((((((((((((((..(((.((((((...)))))).)))..))))))))(((((((.......))))))).................((((.(.....).))))..)))).)))))....)))))))).......))))))))).)))))))).)))))..))))))))))))))))))))))))...))).)))).).))))))))))).))))..))))))))))..))))..)))...)).)))))((((..(((((.(((...))).)))))..)))).....(((((....))))).........((((((((..((((((...........)))))).))))))))))).))))))))).)))))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((..{(({(,.,.......)))}),))).)))))(((..(((((((.(((((((((.(((((((((((....))))))))...{((({(((((.........((((,(((({(..{({{,((((.{{({((({...,,,{{,,((((,(,({((((((((((((((((((..(({,.,{,...{((.((((((..........(((((,..{((((..{{{.{,{{{,..(((((,,{{.({.(((({..........)))))}}....,,,))))).},.},)})),)))))))))))))))).)))..)))..))))))))),,,..}}}}}||}}....}))}))))}|||||,||||,|,{{{{,{{,.{,,,,{{|,.{{((({.,{{{{..(((((((((......))))))))){{{.......,}}},.,,|||||}.,..})))))}(((((((..(((.((((......(((.((((.....))))..))))))))))..)))))))((((((....))))))})}))}})..)}}},}}||,{|,|,,{||||||||,(((({{{{{{{,,||||||{{{||||,,{{,..,{{{.(({(,{.((((..(((.,.{{,...,)).)))..))))}))}}.}}},|,||||,|,,...})))}))))})}},),)))})},..,,}|||,|||.||||||}}}}},,||,{{{{(((...,{{{{,,,..,,{{{{(({{{{{{.{,,.,,(((,(((,,{{{{{{{......,,||||||{{..,,,,.,,.,|}|}}}}},|.||,|,,,,,,.,((({({{{{,......,,{,,|.,,,.}}}}},(((({((((.((((((((.(({,((..((((((.((.((.((((((.....))))))...)).)).)))))).))))).))))))))))))}..))))..((((((.{{(((((.(,.(((((......,((({{,{..||{...,.(((..{{(..{{{....))}..)))))).....)))))))....)))))..,),})))).,..,|{{{{|.,,|,||{{,{{{{{{.,,.,,,,),.})))}),,},,}}.)))))),|||,}|},}}|||{,.,.}}))))|||{.((((((((.(((,.((((((.{((((((...))))))}....(((((((({{{,,{(((((((((((..(((.((((((...)))))).)))..))))))),(((((((.......))))))),}}}..{{(((({..,.((((.{.....).)))).,,,,)))))))..,.)))))))).......))))))))).)))))))).,}}},..,,)))))))})))))))))))))|||,}},,(((((((((((.((.(((........))).})}.)))))))))))))),}))))),)}}),)})}....,,.))))))))))(((((((((((..(((((....)))))........((((({.....}))))}.))))))))))){{(({....)))))))).))))))))).)))))))..)))
Back