Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_DYM_0019500

Sequence Length

966 nt

GC Content

0.3934

GAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUCUAAGCGGCAGUGAGCUGGGAUCAUGACACUGUAAUCCAGCCUUGGGAAUGCAUCGAGACCCUGUCUCUAAAACACACACACACAAAAUCCAAAGUGUUCAGAUGAAGAAGAAAGAGACAGAUGAGUUAGUAGAAAAGCAGAUUGAGAUGACAAAGGAAAAAAGUGUUGGAUGAUAGAAACCACUAAAGAGGCACAAAUCGUUUCUUUAGGUACUACGUAUAGGCUCCACGACCUAAGUCACAGAACAUCAGCUGAGUUAGCUUAAGUGUGCUGCUUCUGUUGACCCCAGUUGUGAGUAUUUCACUUGCAAACUGUAGCCUGCCUGACCUGCUACACCAAUUGACCAACAUAUUGUAAAUACCUCUUGCAUAUUUUCAUAUGUGACAAUUAUCAGGACUAGGUAUUUAGUUUAUUAGAUGGUCCAUGUUAUAUAUUUAUUUUUAUUGUGGAAACUUGAAUUCUUGAACUACAGGCUUCAUAUGAAAGAGGCUUUUUUUCCCUACCAACAAAUAUUUUUUCCUUAUUAAUUUGCCAGGAUGGGAAAACUAAUUGACAUCCAACAGUGGUACUCUGUUGAUGAAUGAAGGGAUACAUGCUUUAACACCAAGCUCUGGUCUUUUUAUUCCAUCAUUCAUGAGCUGUGGUGGGGUCUCCCCUGAGUUGUGGUGGAGAGCAGAUCUACCAUCAAGGCCAUGGUUGUUUCUCUUCCAUCACCUCCUGAAUUGUGGCUCAUGACAUUUGGAAGCAUUUUCUGCUUAAGCAGCAAUAUAGUCAAUCAUGUGUCUUUAUAAUGAACAAAUAUAAUCCAGAAUUUUUUAUUUAAUAUUUGCUAAGUUUUUUUCUUUUUUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUCACUCUGUCACCCAGACUAGAGUGCAGUGGUGCAAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-260.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -283.99

Frequency: 0.0000

Diversity: 154.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.(((((((((......)))).)))))(((((((((((((((.....(((((((.((.((.((.(((...(((..(((((.(((((((.((((.......((((..........))))..(((.((((((((((((((.(((.((.((((((((...(((((((((.......((((((((((.((((((.............((((((((((.......))))))))))((((...))))((..(((((((.....(((((((((...((((..(.(((...))).)..)))).))))).)))).....((((((((.....))))))))..((((((...........))))))......(((((.((((...(((((((((((((...(((.(((....))).)))...)))))...))))))))...)))..).))))).....................)))))))..))................(((((((........)))))))..........))))))....)))))))))).)))))))))..(((((..((......))..)))))(((((.......)))))(((((((((((((((....((((.......))))....))))))))))).))))..((((((((((((((((((...)))).(((..(((((((((((.((((..(((((.......))))).))))))).)))))))))))....))))))))))))))..((((((........((((....))))...((((.....(((((((....))).)))).....)))).))))))...............)))))))).)).))))))))))))))))).)))....)))).))))))).)))))....)))..))))).)).)).))))))).....)))))))))))))))....))(........)

Thermodynamic Ensemble Prediction

({.{((((((((......)))).))))}(((((((((((((((..,..(((((({.((.((.{,{(((...{{{..(((((.(((((((.{(({.....,,{{............))))..{((.((((((((((((((.(((.((.((((((((...(((((((((.......,(((((((({.((((((..{..{({,,...((((((((((.......)))))))))){{,{...}},}((..(((((({.....(((((((((...((((..(.{{{...))}.}..)))).)))))}})))...,{((((((((.....)))))))},}|(((((..{........))))),...,,.(((((.{{((...(((((((((((((.{{({{.(({....))).)),,}}))))}..,))))))))...})}..}.))))).,,,.................}))))))..)}.........,......{((((((........))))))).,,}},....))))))....}))))))))).)))))))))..(((((..{{......})..))))),((((.......))))|(((((((((((((((....((((.......))))....)))))))))))}}))),.((((((((({,(({((((...)))).(((..(((((((((((.((((..(((((.......))))).)))))))}}))))))))))....}}},})))))))))..{(((((...,..,.((((....)))).,,,{{,.....{{{{{||....}}},,})}.....},,,.}))))}...............)))))))).)).))})))))))))))))).}},....,))}.))))))).)))))....}}},.))))).)).)).)))))))..,..)))))))))))))))....}}{........)