Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_DYM_0019700
Sequence Length
1545 nt
GC Content
0.4142
GAGGAUCUUUUGAGACUAAGAGUUUGAGACCAGCCUGGGCAACAUGGCGAGACCCCCAUCUCUACAAAAAAUAAAAAAAUUAGCUGAGCUCGGUGGCUUAUGCUUGUAGUCCCAACUACUUGGGAGGCUGAGUCAGGAGGAUUCCUUGAGCCCAGGAGUUCAAGGUUGUAGUGACUAUGGUCAGGCCAAUGCUUUCGCCAGCCUGGGCAACAGAACAAGACCCUGUCUCAAACAACACCACCACCAACACCACCGCUACCACCUUAUACAUAUGGGUAGAAGUGACUUCUUGUACUAUAAAGGAAACGUGGCCAGAUGACUUCUAGUAAUGCUUCCAGUUUGUGUUGAGAGGAAUGGGAAUCAAGUGUAAUAGGUUGGGAAUGUAGAAAUUGCUUCCCAACAUAGUUCAUGAUGCUUCAGGGUAAAUUGAUAAGGCUGCUUGGGUCUAGAGUGGUCUGGGGCUCUGAAGGGUGUAGGGGCUCUAACUAUGAAAGGCUGAACUGGGAAAUAAAAAUAUGUCCACCUGUUACCUAUUUUUGGCACACUUGUUAGAAAGCUGAGGAUUAGAAGUAGGGUCCCUUGUAGGCUCUUGUUGAGUGGAUUUGGAGAAAACAUUGUUUCAGAGACAUUAUUUUUUUAAGUAGGGUGAGUAGGUGGAAAGUGCAGGAAGAAAAACUAGGGCAGGAAAACAAAAUCUGAGACAUCUGCAGCAAUAUACCUGUGAUGUGCUGAAGGUCUGAAUUUCUAUUACUGUGUAGGAAAUGGAAAGUCCUACAUCUCAGUAAGUGUGUGUAACCAGCUAACAGCAGUAUAGAGAAUAAUAUCUUUAAAAAGUUCUUUUGUUUUAAAUUAACACCUGAUUUGAGUGUUAAUACUUAAUGAGCUUAGAGUUCCAGAUUUGAGAGCAGCUCUGAGCAGUAUAGCAGCAGCCUGAAUACUCUUCUCCAGAGGAAUUGUUUUGCUAAAAGGUGCAGUGACUUUGGGUGAAGUGUGAAGAAUGGAGACCAUGUAGCAUGGCAGGGGGAACAUGGAUUUUGGAGCCAAACUGACCUUGCCUGAGCUCCACAACUGACUAGUUUGUGAAUUCAGGAAAGCUGCUUAAUCUCACUGAACCUGUUGUUGCUUUUGUAAAAUGGAAAUAAUAACCCCUACCAUGUAGAUUCAUAGGGAUGAUGAAACACUAUCAUGCAUGUAAAGUGUCUGACUUUGCUCUUCUUUCAAGGAGUAAUUACCUAUUAGUUUACAAAGACCUAGGACUCUGUCUUGAGAGUUAGUCUAAAAUAUUUGAGGAAUGAAAAUAAGCAGCAGAAAUUUAACCAAUUUUCUGAUGACCGCUUUAUCUUGAUGAUUGAAAGUCCUGUGCCUCUUUUGAACUAAUUGUUCUGCUGUUUUAAAAAUUAAGCCAGACAGUGAUUAUAGUAAUAGUCAUCUUUGUGUAUAAGCAAUCUACCUUUUUUUUUUUUUUUUGAGUCAGAGUUUCGCUCUUGUUGCCCAGGCUGGAGUACAGUGGCACGACCUUGGCUCACUGCAGCCUCUGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-450.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -480.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 390.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.....(((.(((((.((((.((((.(((.((.((((..((((..((((......))))..))..................)).))))))))))))).)))).))))).))))).)(((((((((.((.......((((((((.(....)))))))))..((((((((((((((.((((..((((.((((....(((((((((((((((((.(.((((.(((.((((((..................(((..(((((..............)))))..)))....(((((((.(((((((((.(((.((.(((.....))).)).))).)))(((((.((...((((((.(((((..((((((((.....((((((((.(((.....)))))))))))..........((.(((((((((.........(((((((((.......)))))))))...))))))))).))(((((((((((((((....(((.(((..((((..........(((.((((((((((((((.(((((((((....)))))))))((...(((((........)))))...))..((((.....))))..(((((((((((....(((((...)))))...))))))))))).)))))).))))))))..)))............))))..))).(((((((((......(((((.((((........)))))))))((((..((.(((.....(..(((((((((((((.........)))))))...))))))..)........)))))..))))....((((((......))))))........)))))))))..(((((((((......).)))))))).)))....)).))))))(((((....((((((((((......((((..((((((..(((((((((.(((((((((((..(((((...(((....))))))))..))))))).)))).)).....((((...))))..(((..(((((((......(((.........)))......)))))))...))).(((((((....)).))))).)))))))...)))))).......))))........)))))))))).....))))).......)))))))..((((((((.(((((.((((((......))))))....(((((((.....))))))).(((((....)))))......))))).)))))))).((((....((((((......)))))).))))...))))))))..............((.((((((..........)))))).))...((((((((.....)))..)))))))))).))))))....)).)))))..((((((.(((((...))))).))).)))(((((((....))))))).)))))))))))))......................)))))).))).)))).).)).)))))))))))))))))))...))))..)))).))).))))))))))))).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,({.....(((.(((((.((((.((((.(((.((,((((....{({{((((......))))..,......,.......,,.}}},.))))))))))))).)))).))))).))))).)(((((((((.(,.......((((((({,(....,)))))))).{((((((((((((((.((((..((((.((,,..,.(((((((((((((((((.(.((((.(((.((((((...((((.(((((((({.(((,.(((({.{,,,......,.})))|}.,}}}.{{{||{,.||,{{{||{{{{.{{{,{(.(((..,,,|||,||.}}|,||||.,|||}|}|||}}}}},,|,|{.{{{,.{{(.,,({.((((((((.(((,...,))))))))))).||,,,}}}}||.{{(((((((.........(((((((((.......))))))))),..))))))}||{||.{((((((((({,{{.,...{{{,|||||,{(({.(((....})).))).}},}))})}}.{((((((({....}}}}))}}}}}},,,,}}))}.}})}}))))))}...,,)))}}))))).))))(((((((((((....(((({...}))))...)))))))))))..)))).|,(((({{{..(((((.(((({,{{{..(((((((((...,,,,({{,.(((((((.((((........))))))))){||{.,(({((,.,{,,(,,(((((((((((((.........)))))))...)))))}..|......,,}|||,,{||||{{..((((((......))))))....{{{{,,||||,,,..(((((((((......).))))))))....,,.,,(((((((((((({....,|.}||.|))))))))),,,..((((((..(((((((((.(((((((((((..(((((...{({....))})))))..))))))).)))).)).....((((...))))..(((..(((((((......(((.,,....,.)))......))))))).,.))).(((((((....))}}}))).)))))))...))))))...,,,....},..}})}})))))},,,,....,}})}},,......,,,|,...{(((((({.{((((,((((((......)))))).,.,(((((((.....)))}|||,((({,....))))),,....})))}.)})))))}.||||}|,,((((((......)))))),}}}}.......,{.|||..|,,|...,,,({.((((((.,,....,}.)))))).}}...,,}}}}))}}}}.)))),....)))))).))).,}}}((((.....)))){((((,(({,.....,})}.})),))||((((((....))))))}))))).)))}}..,,..))))))}............)))))).))).)))).).))}})))))))))))))).).,,}.))))..)))).))).))))))))))))}.)))))))))
Back