Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EEFSEC_0002000
Sequence Length
470 nt
GC Content
0.5468
GGGCCCAGAUCAUUGAUCUGAUGAUGCUGGUCAUCGAUGUGACCAAGGGGAUGCAGACCCAGUCAGCGGAAUGCCUUGUGAUCGGCCAGAUUGCCUGCCAGAAGCUGGUCGUGGUGCUGAACAAAAUAGACCUCUUACCUGAAGGAAAGAGACAGGCAGCAAUUGAUAAAAUGACCAAGAAAAUGCAGAAGACCCUAGAGAACACCAAGUUCCGAGGUGCACCGAUUAUACCCGUGGCGGCCAAGCCGGGGGGACCAGAGGCCCCCGAAACUGAAGCUCCACAGGGCAUUCCAGAGCUCAUUGAGCUCCUGACGUCCCAGAUUUCCAUCCCAACGAGAGAUCCCUCGGGACCGUUCCUCAUGUCUGUGGACCACUGUUUCUCCAUCAAAGGCCAAGGCACUGUGAUGACAGGGACCAUCCUUUCAGGCUCCAUCAGCCUCGGUGACAGUGUGGAGAUCCCUGCCCUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-156.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -163.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 121.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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