Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EIF3J_0000400

Sequence Length

2079 nt

GC Content

0.4084

GAUAACUGGGAUGACGAUGAUGAUGAAAAAAAAGAGGAAGCAGAAGUAAAACCAGAGGUAAAAAUUUCAGAAAAGAAAAAAAUAGCAGAGAAGAUAAAAGAGAAAGAACGGCAACAGAAGAAAAGGCAAGAAGAAAUUAAAAAGAGGUUAGAAGAACCCGAAGAACCUAAAGUGCUAACACCAGAAGAACAAUUAGCAGAUAAACUGCGGCUAAAGAAAUUACAGGAAGAGUCAGACCUCGAAUUAGCAAAGGAAACUUUUGGUAAGACGGGAUUAUGAUUGCAAUACAGUAUUAAACUGUUACAGGUGAAGACCCAGAAAGUUCAGAAAACAUCUCCUUUUCUUAAAAGAAACAUACUGGCUAAUGUAGAUAUUAGAAAGCAGUUUUUAAUCUCUGUGUAUAUUUGAGAUUUCAUUACAUGUUCAGAUUUUUGAAUAAUUGUUUUGAGUAAAAGAUUAUUAAGAUAAGUCAUUUAUAGCAAUGCAAGAAGGGCAAAAAGGAGUAGACUCAGAUGAAGUACACUACUGCAUAGAAUAUUUUUAUCAGCUGGAUGAAAUUUGCAUGAAAUGUGAGGUCUGUAGCUUUGAAAUGGACUGUAGGGCUGUCCUGUUGUCUUAAGACUUAGACAGUAGGAUGUUGCUCCAGGUGAGAGGCAUGCAGCUUUUGCUGUGCCUUCUUGUGCUCAGUGUCAUUUCCUUCUGCAACCCUUCUUUGCCCUUACCAUGCCCUAUCUUUAGAGGGCCUCCAUUUCUUUGUGCGGUGUCUGCAGCUGUGGUUAGUGCGUGAGAUAAAAGUGCAGGAUCCUAUAAAUAGAUAAAUUCAGAGUGUUCCAGAGUAAGAGACAUGGCUAGAGAAAUAGUCAAAGCCCUCGCUUCAUUUAACCAAGUUAUCGUUACCUGUUGAGUACUUUUCAGAGUAGAAGAUCAUGUUGAAACAGUUAAAUCACUGAAAUUUAUAACCAAGAAGGAAAGCUCUAGUUAUUCUGAUACCCCUCCCCCACUUUCAUACUUUCUCUACUCUGAAACAGAUCAACAGGCUGACUGUAGUGAUUGUUUUCCUUUUCAUGAGGAAGUAUGACCUUAUCUGUCAGUGGAUCUGUACAAAUACCAGGAGUUGAUGUGAAUGCUCCUGUGCACCAUUGUAUGCUUGGCAGGUCUUAACUGCACUCAUCUAAUUAUAGAGAGCUCUUGGCUGUUAAUAUGUGUCUUCCUAGGAUGGUAAAAGCUGCCCAUGUGUUUAUUAAAGAGGCAGGUUUAUGAAGUGUGCAUAAAGCCUAGCAUGGGACACCUGUUAUAGACUAAAAGGUAAAAACAUGCAUUCAUAUAGUCAUUGUUAAUAGGAUUUUACUGUUGUGUUUCUCAUACUAAAAUACCACAUGUAAUAUUGUUAAUAACUAAUCUACUUGACAUGGAGGAUACAGAAGCAUACUUAUCUUAGUGUAAAACUCAUCUAGGCCAGAUUUUUUUUUUUCUAACAGGGUCUGGCUCUGUCAUCCAGGCUAGAGGACAGUGGCUGAGAUCGGCUCACUGCAACCUCUGCCUCUGGGCUCAAGCCAUCCUCCCACCUUAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGCGCAUGCCACCACGCCUGGGUAAUUUUUGUUUUUUGGGGCUUUUUUUGUAGAUACAAGGUUUCACCAUGCUGCCCAGGCUGUUGUUGAAGUCCUGAGCUCAAGUGAUCUGCCGCCUUGGCCUCCUAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCAUGCACAGCCUAGGCCAGAUUUCUUCUAUUGGGAUUUAACAUGUUUACCCCCGCUUAGCUUCUGGAGUUAGACAAAUACUUUCACAGGAUCCAUCUUUGUUUCUUAUUCUUUUUGUUCCCUCUCUCCCCACUUUACUGUGGGGGUGUUCUUGGACAAGAACAGAGUAUCCCUUUUGUAAUGUAAUAUGUUGUGUUUUGUUUUUAGAGAAAGGUUCUUGCUCAGUCAUCCAGUCUGGAAUGCAGUGGCAUGACCAUAGCUCACUGCAGCCUCAAACUCCUGGGCUCAAGCAAUCCUCCCACCUCAGCCUCCCGGGUAGCGAGGGCUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-573.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -614.02

Frequency: 0.0000

Diversity: 568.33

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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