Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EIF3J_0002500
Sequence Length
426 nt
GC Content
0.3920
GUGUGGUUCCUGGAGGGGGAUUAAAAGCCACCAUGAAAGAUGAUCUGGCAGAUUAUGGUGGUUAUGAUGGAGGAUAUGUACAAGACUAUGAAGACUUCAUGUGACAUUUUAUCUUUUCUUGGUGUCAUCUUUAUGUUGCCCACAAUCCCUUGAACAUGUAGCACAACUUCCUUUCCUUUCAGUUCUGCCAAAUGCUACAAUCAGAAGUGCAGUAUCUUUUGUGCUGGUUAUUUAACCCCUUGACACUUAGGUGCUAAUGUGCAAAUGAGGGAACUUGGAUCUUGCUGCCAAGGGGUUAAAAUUGGGAACCUAAGUUGCUACUAAAUCAUAGUUCAAAACCUAAUAAUGUUGUCGUUGUUGCUAUCUGAUUUCAUAGCAGCAGUCACUAAAUUGGAAACAAAAGGUUGCAACGUGACAAAAAAAAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-103.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -111.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 119.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((((((((((.....(((((((((((....((......))..)))))))))))(((.(.((((...(((....(((.(((((((.......(((((((............)))))))))))))))))....)))...)))).).)))..........)))))))))...((.(((((..............))))).))((((((.....))))))....((((((((((((.((..((((..((((.((............))))))..)))).)).))))))))))))...)))))))...(((((((..((((((((((.........(((((((....)))))))))))..))))))..))))))).(((((....(((.(..(....)..).))).)))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{..((((((({{{{{||||,,...(((((((((({....{(......})..))))))))))),{{.{,(((({(.(((....(((.(((((({......,(((((((............)))))))))))))))))....)))}},}})}.,.|||{{.,,,...,||}}|||||...{(,({(((,....{,,,,.,{{|||||,||((((({.....))))))....((((((((((((.((..,((({.({{{.{{.|......,.,.}}}})},})),,.)).))))))))))))...||}}}})...(((({{(..({{{{{{{{{........,(((((((....))))))))))}},)))))}..))))))),|{{||,...{{|,||,,....},}),)}),)))))........,,
Back