Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ELAVL1_0000900
Sequence Length
484 nt
GC Content
0.5537
GACACAGCUUGGGCUAUGGCUUUGUGAACUACGUGACCGCGAAGGAUGCAGAGAGAGCGAUCAACACGCUGAACGGCUUGAGGCUCCAGUCAAAAACCAUUAAGGUGUCGUAUGCUCGCCCGAGCUCAGAGGUGAUCAAAGACGCCAACUUGUACAUCAGCGGGCUCCCGCGGACCAUGACCCAGAAGGACGUAGAAGACAUGUUCUCUCGGUUUGGGCGGAUCAUCAACUCGCGGGUCCUCGUGGAUCAGACUACAGGUUUGUCCAGAGGGGUUGCGUUUAUCCGGUUUGACAAACGGUCGGAGGCAGAAGAGGCAAUUACCAGUUUCAAUGGUCAUAAACCCCCAGGUUCCUCUGAGCCCAUCACAGUGAAGUUUGCAGCCAACCCCAACCAGAACAAAAACGUGGCACUCCUCUCGCAGCUGUACCACUCGCCAGCGCGACGGUUCGGAGGCCCCGUUCACCACCAGGCGCAGAGAUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-144.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -153.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 136.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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