Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ELAVL1_0001300
Sequence Length
380 nt
GC Content
0.5632
GUGUCGUAUGCUCGCCCGAGCUCAGAGGUGAUCAAAGACGCCAACUUGUACAUCAGCGGGCUCCCGCGGACCAUGACCCAGAAGGACGUAGAAGACAUGUUCUCUCGGUUUGGGCGGAUCAUCAACUCGCGGGUCCUCGUGGAUCAGACUACAGGUUUGUCCAGAGGGGUUGCGUUUAUCCGGUUUGACAAACGGUCGGAGGCAGAAGAGGCAAUUACCAGUUUCAAUGGUCAUAAACCCCCAGGUUCCUCUGAGCCCAUCACAGUGAAGUUUGCAGCCAACCCCAACCAGAACAAAAACGUGGCACUCCUCUCGCAGCUGUACCACUCGCCAGCGCGACGGUUCGGAGGCCCCGUUCACCACCAGGCGCAGAGAUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-115.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -121.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 71.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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