Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ELAVL1_0002300

Sequence Length

279 nt

GC Content

0.6129

AUCAUCAUUCAGCAAAUACUGGUUGAGUGCCAGCCAUGGGCUGGGCACUGGUGGCGGGAGGAAGGAGGGGCGUGAUGAUGGCUGGGAGGAAGGGACUGCCCCAUGUGCUGCUCUCAAGACUCGGAAUGUUUCUGGCUGGCCUGGCCCUGGUCCCUAUGUUGGGGAUAUGGCGUUGGUUGGUUGUUGGCUGUUCCACCCACAAACACCAGCUAAGGAGGCCACUGCAGCGCCCGGUGGUCCUGCCCGCUGCCUUCCUGGGCAGCCCUGCCCCAGUGUCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-116.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -121.29

Frequency: 0.0003

Diversity: 51.10

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((((((........))))))))((((((...))))))(((((((.((((((.........((.(((....))).))....((..(((((((((....(((((((.........((((((...)))))).((((((.(((...(((((((...)))))))..))).((((((((((((.((........)).)))...)))))))))..))))))..)))))))..)))))))))..))(((((((....))))))))))))))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....((((((((........))))))))((((((...))))))(((((((.((((((,,,,,,,,,(((((.,..(((.((((({.....(((....,))}..{((((((......,..,(((({...}))))}.((((((.(((...(((((({...}))))))..))).((((((((((((,((.{{...}},),))),.})))))))}}..))))))..)))))))))))).)))}))))){||{|||,,,,}}}}}}))))))))))))))...