Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ELAVL1_0002700
Sequence Length
1369 nt
GC Content
0.5427
GUGUGAGCCACCGCGCCCAGCCCAUGGUGCUAUUUCAAGUAAAAGAAAUGAGAGAAUUAUGAAAAAACUUUAUGAAAAUUUCUUGCCUCUCUCACUCUCCGCUUCCCAUCUCUUCCCUCUUUCCACACUCCAGCAGGAGUUCUGUUCUGUAAAUGCACAUCUAAUUGUAUCCCUUCUGAUUUAAAAUCUUUGUGCAGAAAAAAGACACGUUUUCUUGACCUCUCUGGUGGCUUAAAAGAUAAAGCUAGAAGCCCUUAGUUUGGAGUGCCAGUUCCUUCACACCCUAACCCUCCCCGCCCCUGCACGUAGACCCCAAACUCUAACCCUCCCUGCCUGUUGCAGCCUCCACCUGGAGACAGAUCUCUUCCACCUGGAGAUCCUUUGCUUAUGCUCCAUGGCUCAGCCCAGAGCUCACUGGCCGUUUGAAGCCUCGUCUGACUGCCACUCUUCCUCCACCCGCACCGGAAUCAACUGUUCCCUCCUUAGUGUUCCCAUCCCAUUCAGUUUAUUGAAUCGAAUUCAAGGCUGAAUGGCGAGAGAAGCGCAGCGCCCGGCUGGCGCCCCUAGGUGGCAGUAGCGAGGCGGUGCGGCCGACCCGAGCUGUGGGUCAGGGGAAGACCAACGGAAGCCAGCCUGUGGGAGGGAAGUGAGGCUCGCUCCCUCCUCUGAACGACUCUCCCUGCUCCGCUGCUGUGUCCUGGGCCCCCGCUAGGCUCUGGAGAGUGUGCAUGAUGUGUGUAGGUCAUCUCAGCCCACUCUGAUGAGUGCUGUGAGAAUUAUGCCCUGGCUGAUGUGGAAGCCCAGAAAAGGGACCUGGGUGGGCACAGGAGAGCCCAGAAUGCUUCCUGGAGGAGAGGAGGCAGUAGCGGUGGGGAGGAGCUAACCAGGCAAAGACAAUAGGGUGGGGCUUUUUAGGAUACAGCCAAGCCCGGAGGUGGGAACAUCGCAGUGUUCAGAGAACAUCGUGUGUUCAAAGAACCACGUGGGUUCUUUAGGGACAAGAAGGCUGAGAUGGGUAGUGGUGGCAGGAGUGCUCAGGUGUCCACUGGGCAGAGGGCUUGGCUGUUACCCUGCAGGUAGGCCAGGGGUGGCUACUGAGCAGUUUUAGUUCACUGCUCACCCUGGUGGAGAGGCUGGGGGGAGACAAGGAGAAACCAGUCACAGGCUGUUGCAGUACUGAGGUGGCCCCGUAAUGGCUGAACCGCUUGAGGGUCAGGACUGGGACUGCUUCUAUAUUUUGUAUGCCUGAUGCUUUGCUCUGUGCCUGGCACGUGGUUGAUAUUUUGUCUGUGCCAGGGAAAGGAAAGAUUGGCAGACUACUCAGAAGCGACUGGAUCCAGGUACCUGUCAAACAGACAUCUGUGGCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-532.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -553.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 260.61
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......)))))((((((((.(((((((((((........)))))((((((.(((((((.....)))))))...))))))(((((((.(((((.(((((.((((((((..((.(((((((.(((((((((((((......))))))....(((((.....(((.(((......))).)))......)))))((((((........))))))..(((.....)))(((((...((......))..))))).......)))))))(((.((((....(((((((..((((((((((.((((...((((........))))..(((((((((.....))))((((((.(((....)))...((((((.(((((((.......((....)).......))).(((((.(((((..(((((((.....((((((.(((.((((((((.................(((((.....))))).......(((((.(..((((((((((((..((((((...)))))))))))))))).))..).))))).(((((.....))))).....)))))))))))))))))...)))))))....))))).))))))))))))))).....((((((.........(((((((.((((...)))))))))))((((...(.((((((.(((.(((((...((.((((((((..((((..((((..((.......(((((((............(((((...(((((....)))))...)))))))))))))).))))...))))..))))))....)).))...))))))))..))))))).))))..))))))))))))...)))))..)))).)))))))))).(((.....)))........)))))))((((((....((......)))))))))))).)))(((((.(((.((((((...)))))).))))))))((((((((.....))))))))..))).)))).))..)))))))).))))).).......(((((((.......)))))))...((((((.((((......)))).)))))).((((((((...(((((.......)))))..)).)))))))))))))))))(((.(((..((..(((....((((((.......(((.((((.((((......(((.((((((.....))).))).))))))).)))).))).((((((.......((.((((.(((.((((.((...(.(((((((((.....((((...))))))))))))).).)).))))))))))).)).....)))))))))))).)))..)).))).)))...)).)))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......)))))((((((((.(((((((((((........)))))((((((.(((((((.....)))))))...))))))(((((((.(((((.(((((.((((((((..((.(((((((.((((((((((((({..,{{{{{{.....((((((.....{(,.(((......))).,},......))))))......}}},}.,..))))}}(((.....)))(((((...,,...,,,))..))}}).,..,.})))))))(((.((((....(((((((..((((((((((.((((..,((((........))))..((((((((({.,{{||,|(((((,.(((....))).{{((((((,(((((((..,....{{....}),,},.))}}}.(((((.(((((..(((((((.....((((((.((,{((((((((.................(((({.....})))).......|||((,{..((((((((((((..{(((((...)))))))))))))))).))..).}||||,(({{{..,,,))))).....)))))))))))))))))...)))))))....))))).)))))}}}|}},,,,,}...((((((,{..{{{.{((((((,,((((...)))))))))))|,,,...{.((((((.(((.(((((...(,,((((((((..((((..((((..((.{{.{.{(((({,,..}}}}}.,}}.(((((...(((((....)))))...))))).,,,,,})).))))...))))..)))))}....))})),..))))))))..)))))),.)))..,)))))))))))),}})))))}.)))).)))))))))).(((.....)))........)))))))((((((....((......)))))))))))).)))(((((.(((.((((((...)))))).))))))))((((((((.....))))))))..))).)))).))..)))))))).))))).),......(((((((.......)))))))...((((((.((((......)))).)))))).((((((({...(((((,......))))).})),)))))))))))))))))(((.(((..((..(((....((((((.,,,{(.,,({((((,,,(({{((({(({({..{(((,...||,.....))))))}.))})}),)}|||||,.,,....||,{|||,|{{.((((.((,,.(.(((((((((.,...((,....}}})))))))))).).)),))))},})))).,}.....}},})))))))).)))..)).))).)))...}).)))))).))))))
Back