Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ELP3_0000600
Sequence Length
981 nt
GC Content
0.4669
GGUGAAAACCAAGACAGCUGCCAAAUAUGGCCUUUCUGCCCAGCCCCGCCUGGUGGAUAUCAUUGCUGCCGUCCCUCCUCAGUAUCGCAAGGUCUUGAUGCCCAAGUUAAAGGCGAAACCCAUCAGAACUGCUAGUGGGAUUGCUGUCGUGGCUGUGAUGUGCAAACCCCACAGAUGUCCACACAUCAGUUUUACAGGAAAUAUAUGUGUAUACUGCCCUGGUGGACCUGAUUCUGAUUUUGAGUAUUCCACCCAGUCUUACACUGGCUAUGAGCCAACCUCCAUGAGAGCUAUCCGUGCCAGAUAUGACCCUUUCCUACAGACAAGACACCGAAUAGAACAGUUAAAACAACUUGGUCAUAGUGUGGAUAAAGUGGAGUUUAUUGUGAUGGGUGGAACGUUUAUGGCCCUUCCAGAAGAAUACAGAGAUUAUUUUAUUCGAAAUUUACAUGAUGCCUUAUCAGGACAUACUUCCAACAAUAUUUACGAGGCAGUCAAGUAUUCUGAGAGAAGCCUCACAAAGUGUAUUGGAAUUACUAUUGAAACCAGACCAGAUUACUGCAUGAAGCGACAUUUAAGUGACAUGUUGACCUAUGGCUGCACAAGGCUGGAGAUUGGGGUGCAGAGUGUUUAUGAAGAUGUGGCUAGAGACACCAACAGGGGCCACACUGUGAAGGCAGUGUGUGAGUCAUUUCACCUGGCCAAAGAUUCCGGUUUUAAAGUGGUGGCCCAUAUGAUGCCUGACCUGCCAAACGUGGGACUAGAAAGAGACAUUGAACAGUUCACAGAGUUUUUUGAGAACCCUGCUUUUCGUCCCGAUGGGCUGAAACUCUAUCCUACCCUGGUGAUUCGUGGGACCGGGCUUUAUGAGCUUUGGAAAUCAGGAAGAUAUAAGAGUUACUCUCCUAGUGACCUGGUUGAAUUGGUGGCUCGGAUCCUAGCCCUCGUGCCUCCAUGGACUCGAGUGUACCGAGUACAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-262.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -281.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 313.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....(((.((((((.((((....))))...((((((..((...))..))))))......(((((..(.....)..)))))((((.....((((.....))))......))))..(((((.((.....)).)))))...)))))).)))(((((..((....))..)))))..((((((.((.((((..((((...........)))).))))...))))))))...((((.......)))).(((((((((...(((((.(((((...)))))..((((((......(((((((((....(((((((..........(((..................)))..........))))))))))))))))..)))))).....)))))))))))))).((((..(((((.((.....(((((.(((.....))))))))..........(((((...)))))(((......)))..........(((.((((((((.(((((.((((......))))......((((.((.((((((.((((((((.((.(((....))).....(((.((((((..(((((((.(((((((....((.((......)).))....)))).))).))).))))..)))))).))).......((....))(((((((((((....)))))))(((((....)))))..))))......)).))))))))))))))..)).))))))))).))).)))))...)))(((((..(((((((..........((((.((((....)))).)))).)).))))).))))))).))))).)))).......))))((..(((((((((((((((((((......(((.....(((((((......((.(((.....))).))....))))))).....)))))))))).)))))((.((((.(((.....)).).)))).))..))))).)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.....(((.((((((.((((....})))...(((({{,,({..,||||}}|||}.,,,..{((((..(.....,..}})}}{({{...,,((({,,,..))}}.....,)))}..(((((.((.....)).))))).,.)))))).)))(((((..((....))..)))))..((((((.{{.{(((.,({({.,.......}|))||.})})...}|})))}}...,((({{{{{{{,||,.,{(((((({,,.{{{{|.(((((...)))))..((((((......((((((,((....(((((((,,.,,.....||...,..............,|||.....,}},.)))))))))}))))))..)))))).....})))))))))))}}.(((({{(((((,(({,,,,(((({.{{{.....}}})})))..........,{({{{,{,||||||.,,,...{||{,..,,,{{,..({(((,,(({.({,,,,||,|,...}})))...,,,}||,|}||}|{((((.((((((((.({.(((....}}}..,..(((.((((((..(((((((.{((((((....((.((......)).))....)))).))}.))))}}))..)))))).))).......((....))(((((((((((....)))))))(((((....))))).,))))......}}.)))))))}}))))}|||},}},,}}})).}}},,}}}},...|{((((,{{(({{{,{,,..,{,...,|}}.(((.{{{{|,,.,)))).))),}|||||||||,,.)))}}})}}.}))))))})),}))))}.,)),))))},,))))|..}})))),,}.)}}}))))}}.|,,....({({{{{|}||{||{|.,|)))),,,....)))))))}}}},,...)))(((((({{((..,({((.,,.,.,}.}))))))).)))
Back