Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ELP3_0002900
Sequence Length
729 nt
GC Content
0.4527
UUAAAACAACUUGGUCAUAGUGUGGAUAAAGUGGAGUUUAUUGUGAUGGGUGGAACGUUUAUGGCCCUUCCAGAAGAAUACAGAGAUUAUUUUAUUCGAAAUUUACAUGAUGCCUUAUCAGGACAUACUUCCAACAAUAUUUACGAGGCAGUCAAGUAUUCUGAGAGAAGCCUCACAAAGUGUAUUGGAAUUACUAUUGAAACCAGACCAGAUUACUGCAUGAAGCGACAUUUAAGUGACAUGUUGACCUAUGGCUGCACAAGGCUGGAGAUUGGGGUGCAGAGUGUUUAUGAAGAUGUGGCUAGAGACACCAACAGGGGCCACACUGUGAAGGCAGUGUGUGAGUCAUUUCACCUGGCCAAAGAUUCCGGUUUUAAAGUGGUGGCCCAUAUGAUGCCUGACCUGCCAAACGUGGGACUAGAAAGAGACAUUGAACAGUUCACAGAGUUUUUUGAGAACCCUGCUUUUCGUCCCGAUGGGCUGAAACUCUAUCCUACCCUGGUGAUUCGUGGGACCGGGCUUUAUGAGCUUUGGAAAUCAGGAAGAUAUAAGAGUUACUCUCCUAGUGACCUGGUUGAAUUGGUGGCUCGGAUCCUAGCCCUCGUGCCUCCAUGGACUCGAGUGUACCGAGUACAGAGGGAUAUUCCAAUGCCUUUAGUUAGCUCAGGAGUAGAGCAUGGUAACCUGAGAGAGCUGGCACUUGCAAGAAUGAAAGACCUCGGAAUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-188.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -205.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 267.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..........((.(((.(((((((((((((((..((((((.(..((((.((..(......)..)).))))..).))))..))..))))))))))).......)))).)))))......(((......)))))(..(((((.(((((...((...((((((..(((..(((....((((.((((((((((((((.((((((((.((.(((....))).....(((.((((((..(((((((.(((((((....((.((......)).))....)))).))).))).))))..)))))).))).......((....))(((((((((((....)))))))(((((....)))))..))))......)).))))))))))))))(((((((..((..(.......((((...((((((.(((((((((((.(((.........))).)))))))(((((......)))))((((....))))......))))))))))..)))))..))))))).))(((((...((((((.(.(((((((((......((.(((.....))).))....)))))))...)).).))))))......)))))..((.((((..((.(((((.......))))).)))))).))..))))))))))))((((..((((((...............))))))..))))))).)))...))))))...))))))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
({.....,}{{,{({({{,(({((((((((((((..((((((.(..((((.((..(,....,)..)).))))..).)))}..}}..))))))))))),.......,,|{{(((({....,||,,,,..,|||{{..,{{{{{..(((({..{{,.{{{{{||{,{|,..|||}}..,|||,||{||||||{,|||.|{{,.,,{,||,|{{....|||,,{,.,((.{{{{{{..||,{|||,|||{{(({{{{,,{(({..{{{||{,|{{{.||||.||{,|||||{||{{||,|}|{|||,,.,.,,((....}|({{((((((((....)))))))(((((....})))).,))))......|{,|||||||,||||||{{{||||.,|,.}|},||,,,{{{{...{(((((,{{((,,{,{,,..,{,...,}}}.(((.{{{{|,,.,)))).))).,|||{|||||...)))},)}}}.)))))))}}),,})))}..}},}})},))|||||}}}}}}))|}}}..{((((((....{,..,(((....,))}.)),}..)))))))....,,,,,)))),)}))))))))}}.||}|,,|}}}|}(((((.,....,))))).},||||..||||||||||||}},((((..((((((..{{.....,,.,..))))))..))))))),,}}},..}}}))...,.))))}}}}}},,)
Back