Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ELP3_0003000
Sequence Length
1023 nt
GC Content
0.4536
UUAAAACAACUUGGUCAUAGUGUGGAUAAAGUGGAGUUUAUUGUGAUGGGUGGAACGUUUAUGGCCCUUCCAGAAGAAUACAGAGAUUAUUUUAUUCGAAAUUUACAUGAUGCCUUAUCAGGACAUACUUCCAACAAUAUUUACGAGGCAGUCAAGUAUUCUGAGAGAAGCCUCACAAAGUGUAUUGGAAUUACUAUUGAAACCAGACCAGAUUACUGCAUGAAGCGACAUUUAAGUGACAUGUUGACCUAUGGCUGCACAAGGCUGGAGAUUGGGGUGCAGAGUGUUUAUGAAGAUGUGGCUAGAGACACCAACAGGGGCCACACUGUGAAGGCAGUGUGUGAGUCAUUUCACCUGGCCAAAGAUUCCGGUUUUAAAGUGGUGGCCCAUAUGAUGCCUGACCUGCCAAACGUGGGACUAGAAAGAGACAUUGAACAGUUCACAGAGUUUUUUGAGAACCCUGCUUUUCGUCCCGAUGGGCUGAAACUCUAUCCUACCCUGGUGAUUCGUGGGACCGGGCUUUAUGAGCUUUGGAAAUCAGGAAGAUAUAAGAGUUACUCUCCUAGUGACCUGGUUGAAUUGGUGGCUCGGAUCCUAGCCCUCGUGCCUCCAUGGACUCGAGUGUACCGAGUACAGAGGGAUAUUCCAAUGCCUUUAGUUAGCUCAGGAGUAGAGCAUGGUAACCUGAGAGAGCUGGCACUUGCAAGAAUGAAAGACCUCGGAAUACAGUGUCGAGAUGUGAGAACCAGAGAAGUUGGAAUCCAAGAAAUUCAUCACAAAGUACGGCCAUACCAGGUUGAAUUGGUAAGGAGAGAUUAUGUUGCAAAUGGUGGCUGGGAAACAUUCUUGUCAUACGAAGACCCAGAUCAAGACAUUUUGAUUGGCCUCCUACGAUUACGCAAGUGUUCAGAAGAAACUUUCCGUUUCGAAUUGGGUGGAGGUGUCUCCAUAGUACGAGAGCUGCAUGUGUAUGGGAGUGUGGUCCCUGUGAGCAGCCGGGAUCCUACUAAAUUUCAGCAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-272.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -296.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 294.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....))((((.((((((..((((((((((((..((((((.(..((((.((..(......)..)).))))..).))))..))..)))))))))))).........(((((...)))))((((((((((((((((...........((((((..(((((.((.((((.(((((((.(((.((((((((((((((.((((((((.((.(((....))).....(((.((((((..(((((((.(((((((....((.((......)).))....)))).))).))).))))..)))))).))).......((....))(((((((((((....)))))))(((((....)))))..))))......)).))))))))))))))(((((((..((..(.......((((...((((((.(((((((((((.(((.........))).)))))))(((((......)))))((((....))))......))))))))))..)))))..))))))).))(((((...((((((.(.(((((((((......((.(((.....))).))....)))))))...)).).))))))......)))))..((.((((..((.(((((.......))))).)))))).))..)))))))))))(((((..((((((...............))))))..)))))((((((((.............(((((.........))))).((((((((((((.....))))...........))).))))).....(((((......)))))(((((...(((((.(.....((((.(((((.((((((((......((((........))))))))).)))...)))))))))...)))))).)))))..))))))))((((..(((((.....)))))...)))))).))))).)))))).)))))..)).))))...))).))))))))).)))))))))).))((.(((((........))))).))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.....}}({,{{{{,,,{|,{(((((((((((..((((((.(..((((.((..(,....,)..)).))))..).))))..))..)))))))))))|,,,,|||,.|{{({{{(({,{{(((((((((((((....,,,.,{{{..((((((..(((((.((.((((.((((({({(((.((((((((((.,((.{((,,{{(,{,.(({....|||..,,.{((.((((({..{{{((({.|{{{(((.,,,((,((,..,,,||,}|.,,.}))}.}}|.}))}|||}..}))))).))}.....,.((....})(((((((((((....)))))))(((((....))))).,))))......||,||||||||||||||((({{{,..|,.,|}.{|..,((({...((((((.((((,,{,{,,..,{,...,}}}.(((.{{{{|,,.,)))).))}.,|{({(|((|...)))},)}}}.))))))))))..))))}..}}}}})},))|||||,,,||||||,}},,{((((((....{,..,(((....,))}.)),}..)))))))...,,,},}))))}},}}}}))))|,.||||{{{..||,(((((.,....,))))).)})))).,,)))))))))))))|((((..((((((..{{.....,,.,..))))))..))))}((((((((.............(((({.,....,,.))))).((((((({{{{,.....||||...},,,....))).)))))...,.{((((.,,,,,}}}}}.,||||||,{{{{.,.||,.,,{..,,,||||{{({(((......{{{{,,......}})))))}},|||,,.,,,)))))))}}})))))}),},,..)))))))){(({..(((((.....)))))...}))}})}))))).)))))).)))))..)},)))).)}))),)))))))))},)})}}))))},.{{.||{||,....,,,))))).)),}}))
Back