Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ELP3_0003400
Sequence Length
1273 nt
GC Content
0.3590
GUAUAUGAAGCAGGCCAACUAAGAUCUGCAUAGUGAACUUUUAGUAUGUAUCUAGUUUGACAUUUUCAUCAAUUGAAAGUAAAAAUUUUGUUUUAUUCUUGGUGUAACAUUUUAUUUUUGCAGAAAUGUUCUAGUGCUAAUGGUGCUUGAAUGUAAGUUUUCCAUCAUUGGGUUGAAAAUAGGGUUGUCUAGUCCAGCGAGCUCAGUGCAGAUCAUGAUGUGUUUGUAGAAAAAGCCCUGUGGAAGAGAAAUCCUCUUUCAGUAAUAUUCUAGGCAGUGCCAGUGUUGUUUUGUUUCUGUUCUUGAAUUUACCUCAAGAGGGCAACGAACACUUUAUUUUCAGAUAAAAAUUUAUAUAUGAUUUGGGUCUUCAUUGCAACACAUCUCAUGAAUGCCUCUUGAGAAGUAAUGAAAGUACAAUCUGGGAGCCAUAAAACCAUCCAUAAAUUACACUGAAUUCUGCCAACACACACUUUAAAUGUUUUGCUCUUUUCUCUCAGUCUCUAUAUUUUUAUGAGAUCAUCUGGAAAAAAAAAAGACCUGAUUUGUGGCGUGUUGUUGCUUUGUUAAGGUAAAGUUUUACUACAAACCCCUCAUAAUAGAGUUUGUAUUUGUUUUGAGGGAAACUUUGUAUUUGAGGAAAUAAUAGUCUAGUUUGUGCUAUAGAACUAGAGACAGAAAGUAUUUUCAAGUGUUGGCAUAAUUGUGAAAUAAAAAGCAGCCCAGAGAAGUUGUGGUUUUGACAUAAUGUGGCCCUCGGAAAUGUUUGGAUUUGACCUUGCCCUUCUCUCUCAUCCUGCCCAGAGUCUAUGAGUGAAAACUGGUUGGUUUGCACAGCGUAGCCCACUGCUCUUAGAUGUAAGGUGAUGAACUUCAUGUUUAUUUUACUUUUGUUUUUGCUUGCUGACUACAUAGAUGUAAACUGACUUUCAUUAGCUUAGCAGGGUUUUUUAAAGAUUAAUUUUAAAUUAGGUUAAAAAUGAUGUAUUGUGACCUAUGAGUCAGCAAGCAGCAUUUAAGGUUAAUAGUCUGUUCACGUUAGGGUCAAGUUUUACUGCUGUGUUGGCUCAGGUGUCCCUGCUAUGUUUUCAUAUGUUGAACCUGAUUAAAGUUUUGCUUCUUAAAAGAAUAGGAGUUAAGGUAAAGAAAAGCCCCAGCAAGCAGAGCCUGGUUAUUAUUUAUGGCAAGCUAGUAGCAAGCAGUGUGUUAUAUAUAUUCUCGUGGAUGGAUAAAUUGGAAAGUUGAGUGAACAGAGAGUUCAAGGACAAAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-314.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -341.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 252.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((..(((((((((((.((((..(((((.(((....))).)))))))))..........(((((.....)))))((((((((..((((.((((...)))).))))....))))))))....((((((.((((((...)))))).)))))).(((((((..((((((((((((....(((((.(((.(((((((....(((((.(((..((((((((((((.((((...((((((..((((((((.....))))))))...........(((...)))((((((...(((((....(((((((.......))))))))))))..))))))(((((....)))))(((((.......)))))))).)))..))))))))))..)))))).)))...))))).............(((.((((((.(((((((((((........(((.(((..((((.(((((((((.(((.......(((((....((((((....(((((.(((....)))))))).....))))))....))))).......))).....((((((.(((.(((((.((((((((..........((((((.((((((.......)))))).))))))))))))))..))))).))).))))))((((((((........))))))))....((((....))))..))))))))).))))))).))).....(((((........))))))))))........)))))).))))))..)))))))))).)))...)))))......)))....)))))......))))..))))))))))))))))))....))))))(((((...(......)...)))).(((((((..(((((((((.((((((....(((((((((((((.(((((..((......((..((((((((((((.((((((..((...))..))))))...))))))))...)))).))......))))))))))))))))))))...............(((((((((((..(((((.......(((((((((.(((((((((((.((...((((((....)))).)).)))))))......(((((((((((((......)))))(((..(((........)))..))).))))))))...(((((.....))))).))))))..)).)))))))..........))))))))))))))))......)))))).)))))))))..)))))))...........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((..(((((((((((.(((,.{(((((.(((....))).)))))))))..........(((((.....)))))((((((((..((((.(((,...,))).))))....))))))))....((((((.((((((...)))))).)))))).{((((((..((((((((((((....(((((.(((.((((((((...(((((.(((..(((((((((((((((((...{,((((..((((((((.....))))))))...........(((...)))((((({...{((((.{{.{((((((.......))))))))),)))))))))),{{{,....,|||},,,,,......,)),,.)))},)}..}))))))))),.}))))).)))...)))))..{{,.......,}}..((((((.(((((((((((........,{{.(((..{(((.(((((((((.{,{..,,.,,(((((....((((((....(((((.(({....))}))))).....))))))....))))).,.,,,,}||{,|....,{|||{({,{,||||||{,,{{|,.,}||||,.((((((.((((((.......)))))).)))))),,,}}}}},,|||}}|}}},},,,,.((((((((........))))))))....{{{,....))))..))))))))).))))))).,,,.....{((((........))))))))))}.......}))))).))))))..,)}})))))).)))...)))))......)))....)))))......))))..))))))))))))))))))....))))))(({(({{.{......}},.)))).(((((((..(((((((((.((((((....{((((((((((((.(((((..{{..,,..{{..((((((((((((.,{((((..{{.,,,,..}})))},,,)))))))),.,}))).}}...}}.)))))))))))))))))))}...............(((((((((((..(({{{.......{(((((({(,(((({((((((.{{...((((((....)))).)).)})))))}.....{{((((((((({{......}))))||{..(((........))).,)))})))))))),,,(({{{.....}}))).,)))}}..)),,)))))}.,..,,....}}}},)))))))))))..,,..)))))).)))))))))..)))))))...........)
Back