Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ELP3_0004400
Sequence Length
640 nt
GC Content
0.4734
GUAUUCUGAGAGAAGCCUCACAAAGUGUAUUGGAAUUACUAUUGAAACCAGACCAGAUUACUGCAUGAAGCGACAUUUAAGUGACAUGUUGACCUAUGGCUGCACAAGGCUGGAGAUUGGGGUGCAGAGUGUUUAUGAAGAUGUGGCUAGAGACACCAACAGGGGCCACACUGUGAAGGCAGUGUGUGAGUCAUUUCACCUGGCCAAAGAUUCCGGUUUUAAAGUGGUGGCCCAUAUGAUGCCUGACCUGCCAAACGUGGGACUAGAAAGAGACAUUGAACAGUUCACAGAGUUUUUUGAGAACCCUGCUUUUCGUCCCGAUGGGCUGAAACUCUAUCCUACCCUGGUGAUUCGUGGGACCGGGCUUUAUGAGCUUUGGAAAUCAGGAAGAUAUAAGAGUUACUCUCCUAGUGACCUGGUUGAAUUGGUGGCUCGGAUCCUAGCCCUCGUGCCUCCAUGGACUCGAGUGUACCGAGUACAGAGGGAUAUUCCAAUGCCUUUAGUUAGCUCAGGAGUAGAGCAUGGUAACCUGAGAGAGCUGGCACUUGCAAGAAUGAAAGACCUCGGAAUACAGUGUCGAGAUGUGAGAACCAGAGAAGUUGGAAUCCAAGAAAUUCAUCACAAAGUACGGCCAUACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-170.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -184.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 200.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((....(((....((((.((((((((((((((.((((((((.((.(((....))).....(((.((((((..(((((((.(((((((....((.((......)).))....)))).))).))).))))..)))))).))).......((....))(((((((((((....)))))))(((((....)))))..))))......)).))))))))))))))(((((((..((..(.......((((...((((((.(((((((((((.(((.........))).)))))))(((((......)))))((((....))))......))))))))))..)))))..))))))).))(((((...((((((.(.(((((((((......((.(((.....))).))....)))))))...)).).))))))......)))))..((.((((..((.(((((.......))))).)))))).))..))))))))))))((((..((((((...............))))))..))))))).(((.((....)).)))..)))))))))).((((((...((((((((((((.....))))...........))).))))).....))))...))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((.,..,,{,,..{(((.((((((((((,,((.{((,,{{(,{,.(((....|||..,..{((.((((({..{{(((((.|{{((((.,,,((.((,..,,,|}.}}.,,.}))).}}|.}))}||}}..}))))).))}.....,.((....})(((((((((((....)))))))(((((....))))).,))))......||,|||||||||||}||(((|{{,..|,.,||,{|..,((({...((((((.((((,,{,{,,..,{,...,}}}.(((.{{{{|,,.,)))).))}.,|{({(|((|...)))},)}}}.))))))))))..))))}..}}}}})},})|||||,,,||||||,}},,{((((((....{,..,(((....,))}.)),}..)))))))...,,,},}))))}},},}}))))||.||||{{{,.||,(((((.,....,))))).)})))).,,}))))))))))))}((((..((((((..{{.....,,.,..))))))..)))))|}.{(,.{,....}}.,}}..)))))))))).((((((...((((((({{{{,.....||||...},,,....))).)))))...,.))))...}}...
Back