Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ELP3_0005600

Sequence Length

376 nt

GC Content

0.4574

UGUCGAGAUGUGAGAACCAGAGAAGUUGGAAUCCAAGAAAUUCAUCACAAAGUACGGCCAUACCAGGUUGAAUUGGUAAGGAGAGAUUAUGUUGCAAAUGGUGGCUGGGAAACAUUCUUGUCAUACGAAGACCCAGAUCAAGACAUUUUGAUUGGCCUCCUACGAUUACGCAAGUGUUCAGAAGAAACUUUCCGUUUCGAAUUGGGUGGAGGUGUCUCCAUAGUACGAGAGCUGCAUGUGUAUGGGAGUGUGGUCCCUGUGAGCAGCCGGGAUCCUACUAAAUUUCAGCAUCAGGGAUUUGGCAUGCUGCUGAUGGAGGAAGCAGAAAGAAUAGCUAGAGAAGAACAUGGGUCUGGGAAAAUCGCUGUGAUAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-97.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -101.48

Frequency: 0.0011

Diversity: 46.00

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.....((((((((((((.....))))...........))).))))).....(((((..((((..(((.....((((.......))))....))).)))))))))....)))((..((((((((((...((((((((......((((..(((((((((((....((((((.((((((....(((((.....))))).......((((((....)))))).......)))).)).))))))))))))(((..(((((((.(((((((.(((((((.................))))))).)...)))))).)))).))).))).........))))).))))......))))))))....))).)))))))..))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.....((((((({{{{{.....||||...}},,....))).))))).....(((((,,{(((..{{{..,,,{{{{.......))}}.,,.}}}.)))))))))....)))((..((((((((((...((((((((......((((..(((((((((((....((((((.((((((....(((((.....)))))....,..((((((....)))))).......)))).)).))))))))))))(((..(((((((.(((((((.(((((((.................))))))).)...)))))).)))).))).))).........))))).))))......))))))))....))).)))))))..))