Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_ELP3_0005800
Sequence Length
666 nt
GC Content
0.3754
AUAGGUUUCAGUGGAGGCGAUAAGGACUAGAAGAUGAAACCCAAACCAUUGAACACCUGACAGUUUUGAGACAAAGGGGUGCUCCUGAGAGCUACGCAUGAGACGUGAUUUUGAAAUUUUACAUUAAGAGACUCUUCAUGGGGAGUCAAAUGCAUGGAAGCCUUUACUGAGCUGGAUCUCUGUAAGAGUCUCAAGGUUAAUGAAGUUCAAGUAUUUGUGAAAUUAUACAGUUAUUUUCCUUUUAUAAUAGUCCAUGAACAAGGUGUGAACUUUAAUCUUGGUGCUAUUUGAGAGUAGACAAGUAAAAAGAAACAUAAUUAGUGAUUAUUCAUUCCUUAUCCCUAACUAGAUAUUAACCUAAAUAAAUACAUACAAUUACAAAAAUGAAUUUGGUUCUUUAAUUUUGAAUAAUAUUUUUUGUGGCUUUUUACUAAAUAGGUUGAAUUGGUAAGGAGAGAUUAUGUUGCAAAUGGUGGCUGGGAAACAUUCUUGUCAUACGAAGACCCAGAUCAAGACAUUUUGAUUGGCCUCCUACGAUUACGCAAGUGUUCAGAAGAAACUUUCCGUUUCGAAUUGGGUGGAGGUGUCUCCAUAGUACGAGAGCUGCAUGUGUAUGGGAGUGUGGUCCCUGUGAGCAGCCGGGAUCCUACUAAAUUUCAGCAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-151.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -165.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 197.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((....((.(......).))......)))))))....((((...((((.((.(((((((..((((..((((((.((((...((((((.(((..((((((((((................(((((((((.(((((((.(((...((.(((.........))).))))).)))))))))))))))).(((((((((.((((.(((((.(((((......))))).)))))..((((((.(((((((((.((..(((((....)))))..)).))).))))))))))))...................((((..(((((....)))))..))))....))))...)))))))))................(((((((((........((((.........)))).....)))))))))(((((((((((..........)))))))))))))))))))))....)))))))))))))..))))))))))........((((((.((..(((((((((((((........))))))...))))))).....(((((.....))))))).))))))((((....))))........))))))))).)))))))).((((.((((((.((.....)).)))))).))))...............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((((((((((((,(({,.....,.,.......|,...|}|...||||}}}|,||}||...((((({,((({..{(((((.((((...((((((.(((..((((((((((({,,.,,,,.,{{{,,(((((((((.(((((((.{({...((.(((,,....,,.))).))}}),)))))))))))))))).,{{}}||||||}}|}||{((.(((((....,.,}},,.||||||,((((((.(((((((((.((..(((((....)))))..)).))).))))))))))))..,}.,,}},........,||||..{{(({....))))},,}}}|,({{.{((((.,.((((((((...............{((((((({.,,{,...((((.........))))...,,))))))))}.,.,,,,.,,..)))))))).))))),))).))))))))))).,..)))))))))))))..)))))))))).......},}(({{{(((({....})))))))){((((.,{{{,((({.{,|||{{{....|||||,,..,))}}}.,,}}}.||||||},,}))))}}.....}})),)|}},||||}}||},((((.((((((.((.....)).)))))).)))).....,,,}}},},}
Back