Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_ELP3_0006000

Sequence Length

481 nt

GC Content

0.3451

CCUGCCAAAUGCAGACCAGUUUGUGGCACCUACACGAGUGUUAGUCUAUGGCUUCUCAGAAAGGAAGGGAAAGAGUGUUUGUCCUUUUGUACUAUCUUUGUGACAAAUUAUCCCCUAAAUGUCCCCUAAUUAAAUGUACAUUUUCUGGGUUCUGUAUAUUCCUCUGUUCCAUUUUGGUAUUCUAAUAAAGAUCAUAUAUGUUUCUUUUUUGGUGCAUGUUCCAGUAGUAUUUUUAAAAUCAUUAUUAAUAUCUUCUUAAAGACAAUGGAUACAAUAUAAAGUAUUUCUUUACUACAGGAAUUCAAUUUCAACAUCAUUAUUAAUCAGACUGGAAUUGAUGAUAUGGAAUACUACUUUGCUAGAUAAUGUAUUAGCUAGGUGUUUGCUUAUUGGUGUCUGUUGUAGCUGCACUGUGGCAGCAUUGUUUUGUAGCUCCUCCCAGGAAUCUGUAUUCCAUGACUUGACAUUUACUCAUUUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-95.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -105.20

Frequency: 0.0000

Diversity: 116.03

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((...((......))...))))).((.((.(((((((((((.((((.....((((..(((((((...((..((((((((...............).)))))))..)))))).....)))((((.(((...(((((((.(((((.....(((((((((((.((((((.((((((....((((((.(((...((((((.((......)).))))))(((.((((((.............((((..(((((.............))))).)))).............)))))).))).............))).)))))))))))).)))))).))......)))))).)))....))))).)))))))))).))))...((((..(.(((((.(((((((((.....)))))))))))))).)..)))).((((...)))).))))....))))))).))))....))))...)).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((...({,,....}}..,||}}}.{{.||.(((((((((((.((((.....((((..(((((((...((..((((((({....,......,...).)))))))..)))))).....))){{{{.{{{...(((((((.(((((.....(((((((((((.((((((.((((((....((((((.(({...,{((((.{(......)).))))||(((.((((((......,......{{{,..{{(((,.,...}}}....}||||,...}....},}}},...)))))).)))},...........})).)))))))))))).)))))).))......)))))).)))....))))).}))))))}}}.)))),{,,{((,.,.,{{{{,{{({,,,{||.||})}},)))))))},|.,..}}))){(({...)))).)))).,..))))))),,)))},,,.}}}...)).}}