Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EP300_0002100

Sequence Length

1959 nt

GC Content

0.4890

AUUUUGGCUCUCUAUUUGACUUGGAGCACGACUUACCAGAUGAAUUAAUCAACUCUACAGAAUUGGGACUAACCAAUGGUGGUGAUAUUAAUCAGCUUCAGACAAGUCUUGGCAUGGUACAAGAUGCAGCUUCUAAACAUAAACAGCUGUCAGAAUUGCUGCGAUCUGGUAGUUCCCCUAACCUCAAUAUGGGAGUUGGUGGCCCAGGUCAAGUCAUGGCCAGCCAGGCCCAACAGAGCAGUCCUGGAUUAGGUUUGAUAAAUAGCAUGGUCAAAAGCCCAAUGACACAGGCAGGCUUGACUUCUCCCAACAUGGGGAUGGGCACUAGUGGACCAAAUCAGGGUCCUACGCAGUCAACAGGUAUGAUGAACAGUCCAGUAAAUCAGCCUGCCAUGGGAAUGAACACAGGGAUGAAUGCGGGCAUGAAUCCUGGAAUGUUGGCUGCAGGCAAUGGACAAGGGAUAAUGCCUAAUCAAGUCAUGAACGGUUCAAUUGGAGCAGGCCGAGGGCGACAGAAUAUGCAGUACCCAAACCCAGGCAUGGGAAGUGCUGGCAACUUACUGACUGAGCCUCUUCAGCAGGGCUCUCCCCAGAUGGGAGGACAAACAGGAUUGAGAGGCCCCCAGCCUCUUAAGAUGGGAAUGAUGAACAACCCCAAUCCUUAUGGUUCACCAUAUACUCAGAAUCCUGGACAGCAGAUUGGAGCCAGUGGCCUUGGUCUCCAGAUUCAGACAAAAACUGUACUAUCAAAUAACUUAUCUCCAUUUGCUAUGGACAAAAAGGCAGUUCCUGGUGGAGGAAUGCCCAACAUGGGUCAACAGCCAGCCCCGCAGGUCCAGCAGCCAGGCCUGGUGACUCCAGUUGCCCAAGGGAUGGGUUCUGGAGCACAUACAGCUGAUCCAGAGAAGCGCAAGCUCAUCCAGCAGCAGCUUGUUCUCCUUUUGCAUGCUCACAAGUGCCAGCGCCGGGAACAGGCCAAUGGGGAAGUGAGGCAGUGCAACCUUCCCCACUGUCGCACAAUGAAGAAUGUCCUAAACCACAUGACACACUGCCAGUCAGGCAAGUCUUGCCAAGUGGCACACUGUGCAUCUUCUCGACAAAUCAUUUCACACUGGAAGAAUUGUACAAGACAUGAUUGUCCUGUGUGUCUCCCCCUCAAAAAUGCUGGUGAUAAGAGAAAUCAACAGCCAAUUUUGACUGGAGCACCCGUUGGACUUGGAAAUCCUAGCUCUCUAGGGGUGGGUCAACAGUCUGCCCCCAACCUAAGCACUGUUAGUCAGAUUGAUCCCAGCUCCAUAGAAAGAGCCUAUGCAGCUCUUGGACUACCCUAUCAAGUAAAUCAGAUGCCGACACAACCCCAGGUGCAAGCAAAGAACCAGCAGAAUCAGCAGCCUGGGCAGUCUCCCCAAGGCAUGCGGCCCAUGAGCAACAUGAGUGCUAGUCCUAUGGGAGUAAAUGGAGGUGUAGGAGUUCAAACGCCGAGUCUUCUUUCUGACUCAAUGUUGCAUUCAGCCAUAAAUUCUCAAAACCCAAUGAUGAGUGAAAAUGCCAGUGUGCCCUCCCUGGGUCCUAUGCCAACAGCAGCUCAACCAUCCACUACUGGAAUUCGGAAACAGUGGCACGAAGAUAUUACUCAGGAUCUUCGAAAUCAUCUUGUUCACAAACUCGUCCAAGCCAUAUUUCCUACGCCGGAUCCUGCUGCUUUAAAAGACAGACGGAUGGAAAACCUAGUUGCAUAUGCUCGGAAAGUUGAAGGGGACAUGUAUGAAUCUGCAAACAAUCGAGCGGAAUACUACCACCUUCUAGCUGAGAAAAUCUAUAAGAUCCAGAAAGAACUAGAAGAAAAACGAAGGACCAGACUACAGAAGCAGAACAUGCUACCAAAUGCUGCAGGCAUGGUUCCAGUUUCCAUGAAUCCAGGGCCUAACAUGGGACAGCCGCAACCAGGAAUGACUUCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-593.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -633.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 452.15

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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