Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0006700
Sequence Length
1528 nt
GC Content
0.4476
GCUGGAGUGCAGUGGUACGAUCUCGGCUCACUGCAACUUCUCCCUCCUGGUUUCAAGCAACUCUCCUGCCUCAGCCUUCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGUGCCAUCAUGCCCGGCUAACUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCUCCAUGUUGGUCAGGCUGAUCUCGAACUCCCGACCUCAGGUGAUCCGCCUGCCUCGGCCUCCCAACGUGCUAGGGUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCCGGCCUGAAAUCUUCACUUUUUAAUUUAAAAAACUAAAUUUAUCCCAGAGUUUAGAAAAACUAGUUUUUCACCAACCCGAAAGACCCCUCUGCUGAGUCUCUUGAGGAGUUCUUCAUUGCUCUUUAAAACCUAAUUUGGGUGUGCUUUUAACUACAGACACCCUCUCACCCUUCCCUCUCCCGCUGGAGUUUACCAUGUCCUUCUCUCUGCUUUUGCUCUCUGUGUAUUAUACAUACUUAUAUCACUUCGUAAUGUCAUUUUUUUUCUUAUUAAAUUGAGCUUCUUAAAGGUAGGAGCCAUGGUUUAUGCAUUCCCUGUGUCAAAAAAUGGAGUCUGGCUUAUAGUAGACUAACCAUAAAGGUUUUCAUUGAAAAUAUCCACAUCUCUAUUUAUUAAGAAAUAGCACAUUAUGACUCCUACCAUUAAAUAUAUUGUUAUAUCUCUCAGGGUCAACAGCCAGCCCCGCAGGUCCAGCAGCCAGGCCUGGUGACUCCAGUUGCCCAAGGGAUGGGUUCUGGAGCACAUACAGCUGAUCCAGAGAAGCGCAAGCUCAUCCAGCAGCAGCUUGUUCUCCUUUUGCAUGCUCACAAGUGCCAGCGCCGGGAACAGGCCAAUGGGGAAGUGAGGCAGUGCAACCUUCCCCACUGUCGCACAAUGAAGAAUGUCCUAAACCACAUGACACACUGCCAGUCAGGCAAGUCUUGCCAAGUGGCACACUGUGCAUCUUCUCGACAAAUCAUUUCACACUGGAAGAAUUGUACAAGACAUGAUUGUCCUGUGUGUCUCCCCCUCAAAAAUGCUGGUGAUAAGAGAAAUCAACAGCGUAAGUGAUGAAAUCUUUUGAAGGUUUAUAUGAAAAGUUUUAAAGUCUCACCAGUGCCAUUUAUAGUACUACUUGAUUAUGUGAGGGACCUGUGGUGUUGUACUAUGUUGAAUAAAUGUUUUUUUCCCUUUUAAUUUUUCUGCUUCCCUAGUGCAUAGAAUUGAACUGCUUAGGGAGUUUGAGGCUGCAGUGAGCUAUGGUCAUGUUACUGCGCUCCAGCCUGAGUGAUGGAGUGAGAACCUGCCUCAAUUAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAACAGUGCAGUGGCUCAUGCCUGUCAUCCCAACAGUUUUGGAAGCCAAGGCAAGAGGAUUCCCAGGAGUUCAAGACCAGCCUAGGCAACUUAGCAAGACCUUGUAUCUUCCAAAAACUUUAAAAAUUAGUUGUGUGUGGUGUGCCUGGCUGAGAUGAGAGGAUUGCUUGAAUCCAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-499.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -525.50
Frequency: 0.0000
Diversity: 237.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((((((((((..((....))..))))))).)))))..)(((((((.((((((((((((((....(((((((.(((.((...)).)))....(((((.....((((((((.(((((((.(((...(((((.(.(((.(((((((((......((((.(.((((((.(((.(((((((........((.(((((.(.(((((.(((.(((.((..((...((((.(((((((((((((((.((((......((((...)))).(((((((((.......((((((((......))))))))........(((((((........)))))))..(((....)))....(((((((((........)))))))))..........((((((..............))))))((((((((.((.(((....((((((((.((.((((.((..(((.((((....((.(((((((((...))))))...........(((((((((.......(((((((.(((((.((((((((.......)))))((((..((((((((.....))))).)))..))))((((((........))))))((((.....))))....................))).))))).)))))))....))))))))).............(((((....))))).....((((((((((..((((.((((((((((..((....((((((((((((((((..(((((.....))))).))))))........((((.....((..(((....)))..))...)))).((((((((((....(((..((........))..)))..))))))))))....(((((.(((.(((((((..........))))))).)))........((((........))))((((((((((((.(..(((((...))))).).)))))...((((((((((((.(...............).))))))..)))))).((((....))))..)))))))))))).(((...((((((.((((.......)))).))))))...))).......((((((((.(((......))).))))))))..))))))).)))...((((((........))))))))..)))))))))).)))).....))))))..............))))..............((((((((.(((...........)))))))))))...))))).)))).)))....)).)))).))....))))))))..))).)).)).)))))).........)))))))))........................)))).))))))))))))))).))))...))..)).))).))).))))).).))))).)).))))))).))).)))))).).))))......))))))))).))).).))))).....))).))))))).))))))))))))))))))))..)))))..))))))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..((((((((((((..((....))..))))))),,))))..)(((((((.((((((((({((((....(((((({.(((.((...)).)))...,(((((,..{{(({(((((.(((((((.(((...{((((.{.(((.(((((((((..,...((((.(.((((((.(((.(((((((.,......((.(((((.{.(((((.(((.(((.((,.((.,.((((.(((((((((((((((.((((..,...,{{..,,||,,.(((((,...,,,,...((((((((......))))))))........(((((((........)))))))..(((....)))....(((((((((........)))))))))..........((((((.{{.........}}))))))((((((((.((.(((....((((((((.{{.((((.((..(((.((((....((,({{{(((({...}}}}}}...,,........||||,||........,.,,,|..||,.,||{{{{{((({.((((((((.((((((...{(({,....,}}},......{{|{((((((,,,...,,)))))).,||,,...}|||{{{...}}}}},...,....,}|{||||....,})))},),}.)))))).)))))))).}}},(((((....))))).....((((((((((..((((.((((((((((..((....((((((((((((((((..(((((.....))))).))))))........((((.....((..(((....)))..))...)))).(((((((({(,...(((..((......,.))..)))..))))))))))....(((((.(((.(((((((..........))))))).)))........((((........))))((((((((((((.{..(((({...})))).}.)))))...((((((((((((.{...............,.))))))..)))))).((((....))))..)))))))))))).(((...((((((.((((.......)))).))))))...))).,.....((((((((.(((......))).)))))))}..))))))).)))...{(((((.,.....,))))))))..)))))))))).)))).....))))))..............)))}.,,,,,,,,..,((,,{{{{{{.|||.,,,,,,,,,.}))})))))))}..))))).)))).)))....)).)))).,,....))))))))..))).)).)).))))))...........................,,}...,........)))).))))))))))))))).))))...)),,)}.))).))).))))).).))))),)).))))))).))).)))))).).))))...}..))))))))).))).}.)))))....,))}.))))))).))))))))))))))))))))..)}))),.))))))))).)))))))
Back