Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0007200
Sequence Length
622 nt
GC Content
0.5273
GGUCAACAGCCAGCCCCGCAGGUCCAGCAGCCAGGCCUGGUGACUCCAGUUGCCCAAGGGAUGGGUUCUGGAGCACAUACAGCUGAUCCAGAGAAGCGCAAGCUCAUCCAGCAGCAGCUUGUUCUCCUUUUGCAUGCUCACAAGUGCCAGCGCCGGGAACAGGCCAAUGGGGAAGUGAGGCAGUGCAACCUUCCCCACUGUCGCACAAUGAAGAAUGUCCUAAACCACAUGACACACUGCCAGUCAGGCAAGUCUUGCCAAGUGGCACACUGUGCAUCUUCUCGACAAAUCAUUUCACACUGGAAGAAUUGUACAAGACAUGAUUGUCCUGUGUGUCUCCCCCUCAAAAAUGCUGGUGAUAAGAGAAAUCAACAGCCAAUUUUGACUGGAGCACCCGUUGGACUUGGAAAUCCUAGCUCUCUAGGGGUGGGUCAACAGUCUGCCCCCAACCUAAGCACUGUUAGUCAGAUUGAUCCCAGCUCCAUAGAAAGAGCCUAUGCAGCUCUUGGACUACCCUAUCAAGUAAAUCAGAUGCCGACACAACCCCAGGUGCAAGCAAAGAACCAGCAGAAUCAGCAGCCUGGGCAGUCUCCCCAAGGCAUGCGGCCCAUGAGCAACAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-192.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -204.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 157.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......((((....((((.((........))))))(((.((((((..(((((.....))))).))))))))).....)))).....((((...((((((((........).))))))))))).((((((.((........(((..((((((((..((((((((((((...(((.(((((((..........))))))).)))........((((........))))((((((((((((.(..(((((...))))).).)))))...((((((((((((.(...............).))))))..)))))).((((....))))..)))))))..((..((((((..((((.((((.......)))).))))...))))))..))....)))))))).)))).....(((((....)))))((.(((.((......))))))).......((((((.........(((((((.((((.(((((.......))))).))))...)))........))))......))).))).........))).)))))..)))......))))))))...((((((((((.......))).)))).)))))))((((.....)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..,,{{,,{{....((((,(,.....,..))))))(((.((((((..(((((.....))))).))))))))).....((((.....((,.(({,,,,|||,.}}...,,)}}))}}))|||},{{,(({.{({{,....,{((..((((((((..((((((((((((,..(((.(((((((..........))))))).)))........((((........))))((((((((((((.{..(((({...})))).}.)))))...((((((((((((.{...............,.))))))..)))))).((((....))))..))))))){{(,..((((((.{((((.((((.......)))).)))).,.))))))..))}.,.)))))))).))))......,,,({{{((((((((((((....(((((((.....,,.,,,,.....}}},).)))))))..)))},)))).)))}.,||||....{,.||||||{{..{,,........}},..,,}},,)}.,.,.....})).)))))..}}}..,....,)),,.....||{(((((((.......))),}))).)))))))((((.....)))).
Back