Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0012300
Sequence Length
1455 nt
GC Content
0.4405
UUUUGCUCAUUUACUAAAGGUUGAAAUUUGUCUGAAGGGAUGGACAUCUCCUUAGAAGAGCAGCAGGUCUUCCUCUCCUAUGCCUGAGGCUUGAAUGUACAGCCCUUGAUGGAGGGUAUGGCCAGGGUGGAGCCAGGUCACUACAGACAUCUGUCCUUUCCGAGGGUGCUGUAAAAAUAUUUUCUCUGUGCACUAUGUUGAAAGUACUACACUAGAGCAUGUGCAGAUAAUCCAGGAAAAAGACCUUAGAAUUUAUGUAUUUAUAUUUUAGGUUUUUUUUGAGACGGAGUCUCGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUCAGCUUACUGCAAGCUCCACCUCCCGGGGUCAUGCCCCGGGUUCACGCCAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGCGCCUGCCACCACGCCCGGCUAUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGUUUCACCGUGCUAUCUAGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCGUGAUCCGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGAUAUUUUAUUUUUUUAAGAAUUAUUUCUGUUUUUGUAUUUAAGAGGUACAUGAUAUGUAGUGUGGUAUAAUAUGCAUAUUAUUUAAAAUCAAUGUUCACAGUUUAUGUGCAUAAAAACGUUGUGCUACAUGAUCAAAUUCGGCCACCAUUAGACAUGAUUCAUAGCUAUUAUCCAUGGAGAUACUCUGUUGCAUGCCAACCAGACUCAGACUUUGUUAAACAAUAACAUAUUAAAUGCUAUGAUGGCCUCAAUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUUGCUCCAUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUCGUGUGAUCUUGGCUCACUGCAACCUCCGCCUUCCAGGUUCAUGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGUGCCUGCCACCACGCCUGGCUAAUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCGCCAUGUUGGCUAGGCUGGUUUUGAACUCCUGACCUCAAGUGAUCCACCCACCUCAGCCUCCCAAAGUGCCAGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGUGCCUGGCCUAUAAUGGCUUCAAUAGCUUAUUUUUCUAUCAACAUUGAAAGCACCCGGGCUCAUAAAGGAAUACCAACAAAUCCACUUGGAGGCAUUUUUCUGUAUUCCAGAAAUAACAUUUUCUUCAAGCUUCUGUCUAGUUCAGAGCUUUAUUUUGUGAUUCAUACUCAAUUUUCAAAGGUAUUAUUAAAAAUAUUUUGUGGGGUUUGUGUGUGCAGUGAGUUUUUGUUUGGUUAAGGGAAGAUGGUGCAAAGAUACUUAUUUCUCUUUUUUACUCUAGAUGGCCCUCUACCUGACCCAAGUAUGAUCCGUGGCAGUGUGCCAAACCAGAUGAUGCCUCGAAUAACUCCACAAUCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-420.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -449.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 421.65
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((.((((....(((..((..(((((((....)))))))..)).))))))).))))))(((((.(((((.......(((((.(((((.(((((...((((((....))))))..(((((..((((.((((((.((((((((.(((((.((......)))))))))))).............(.(((((.(((((...(((.....)))..)))))))))).)........(((((((((((.(((((.((......)).))))))))))))))))..((((((((...))))))))....(((.((((((((((((((.........)).))))))..)))))))))..((((((...))))))((((((((((..........((((((..(....)..))))))....((((((((((........(((((((((((................(((.(((((.((((.(.(...((.((((.(((....))))))))).).)))))...))))).)))(((((((((......)))))..((((((..(((((......))))).....))))))....((((((...))))))((((((((((.(((......)))))))))))))..................(.((((((((((((.....)))))).)))))).)......)))).....(((..(((...)))..)))......((((((..(((((((.....((((...............(((((.....)))))...............))))(((((...............))))))))))))....)))))).((..((((.((((...((((((((((.(((((......((.......))...))))).)))))))))))))).))))..)).....)))))))))))....))))))))))..((((.(((((((((((..................(((((...))))).....))))))))))))))).((((..........))))(((((((...(((..............)))...))))))).))))))))))...)))))))))))))..)))))......................)))))..)))).).)))))......))))).)))...........((.((((((((..((((......(((((......)))))..(((((.(((.......)))))))).......(.((((((((.(((.(((((((((((((......)))))))).))))).))).))))).))).)......(((.(((..((((....(((.(.(((((.............))))).).))).....))))..))).)))..............(((((...)))))...)))).)))))))).)).............))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..(((((.{{{.{(,{(((..((..(((((((....)))))))..)).))))))),))))))(((((.,,{((.,.....((({(,(((((,((({{...((((((....)))))}.,((((,{{((((.((((((.((((((((.(((((.((......))))))))))))...........,,(,(((((.(((((...{((.....)))..)))))))))),}.....,,,(((((((((({,(((((.((......)).)))))))))))))))),.((((((((...)))))))).,..(((.((((((((((((((.........))}}))))),.})))))))),{((((((...))))))||((((((((....,,,,{,({({((..{..,.}..)}})))....((((((((((........(((((((((({...........,,{,,({{,((({{.,,{||||.||,,|,||{|,((({..{|||,},,)).,,})})),,.}))}}.}}}{{|{(((((......)))))..(((((({{{((({......}}})),.,},))))))...{(((({{...})))))}{{{{,{({{{((({{{{{,||||||||||,},...........,......,.,,|||||||||,....,))))))}))))}}.},...,.}}}}.....{{{..{||,,.}}}..}}}......((((((..(((((((.....((((.,,{,..........(((((.....)))))........},,..}.))))(((((...............))))))))))))....)))))).{{..((((,((((.{{((((((((((.(((((......((.......))...))))).))))))))},}}}),))))}}))},...)))))))))))....))))))))))..((((.(((((((((((...,{({(.{{,...,,)})})}}|{||...,))..))))))))))))))).{{{{......}...}}},((({{{|...|{|.,.,|,,......,}}),,,))),}}}.)))))))))}...))))))))))},,..}||||.....}}},......,|,,,..}}}}),})))),),)}))).,,,..}||||{||....{{,{{{...,,{{||,|||,.{,,|}}}}}){((((......)))))..{(((||(((.......)))))))}....,||||{{,{((((.{{{.{{{{{{(((((({......)))))))},|}|||,}}}.}}}}).}||{{{,,.{{((({(((,,((((,({,.(({(...,,,,}},...,}})))),......,,,..|{|}}}}|||}},}},,,,,|||,,|,|.,(((({...})))),,,)})))}))))}}),,,.,}}}}}}},}}}))
Back