Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0013200
Sequence Length
248 nt
GC Content
0.4839
AUGGCCCUCUACCUGACCCAAGUAUGAUCCGUGGCAGUGUGCCAAACCAGAUGAUGCCUCGAAUAACUCCACAAUCUGUUGGAGUUCUCUCCACAGACACUGUGUUGCUACGGCAAACAGUUGUGCACAAUACCUCGUGAUGCCACUUAUUACAGUUACCAGAACAGGUAUCAUUUCUGUGAGAAGUGUUUCAAUGAGAUCCAAGGGGAGAGCGUUUCUUUGGGGGAUGACCCUUCCCAGCCUCAAAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-65.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -71.51
Frequency: 0.0001
Diversity: 45.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((................((((.(((..(((((...))))).....))).))))............((((.(((((.((((....)))))))))...)))).(((.(((((.....))))))))......(((((((.((.((((.((((((.((((......))))......)))))).)))))).)).)))))..(((((((((.....)))))))))((((.......)))).)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((..,,.....},.....((((.(((.,(((((...}))))...,.))).))))...,......,,{{{,.{(((,{((((....))))))))}.{((((.{(((....)))})))))}))}........(((((((.{.(((({.((((((.((((......))))......)))))).}))))}.)),}))))..(((((((((.....)))))))))((((.......)))).)))......
Back