Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0014000
Sequence Length
283 nt
GC Content
0.4735
CCUAUGGGCUAUGGGCCUCGUAUGCAACAGCCUUCCAACCAGGGCCAGUUCCUUCCUCAGACUCAGUUCCCAUCACAGGGAAUGAAUGUAACAAAUAUCCCUUUGGCUCCGUCCAGCGGUCAAGCUCCAGUGUCUCAAUCUAAAGUGGAAGACUGUAAAAUGGAAUCUACCGAAACAGAAGAGAGAAGCACUGAGUUAAAAACUGAAAUAAAAGAGGAGGAAGACCAGCCAAGUACUUCAGCUACCCAGUCAUCUCCGGCUCCAGGACAGUCAAAGAAAAAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-56.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -64.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 55.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((...)))).)))).......(((((......)))))...............((...((((((......))))))....))...........((((((((..((((.(.((((.(((((.((((((((..(((....(((.(((((((...))))..))).)))....)))...)))..)))))))))).....((........)).(((((..(((......(((......))).....))).))))))))).).)))))))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.((((((((...}))).)))).|..,,.(((({......)))))..|||.,........,,{{,{(((((......))))))}}..|,...........((((((((..((((.{.((((.((((,{((((((((..(((....(((.(((,(,{....}),,.))).)))....})}.,,)})}.}))))))))).....{{........,}.(((((,.(((..,...(((......))).....))).))))))))).}.)))))))))))).......
Back