Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EP300_0014100

Sequence Length

554 nt

GC Content

0.4838

GUUUGAAUCAAUUUGGCCAGAUGAGCAUGGCCCAGCCCCCUAUUGUACCCCGGCAAACCCCUCCUCUUCAGCACCAUGGACAGUUGGCUCAACCUGGAGCUCUCAACCCGCUUUCCCAGCCAGCUGUAAGCAUUGAAGGACAGGUAUCAAAUCCUCCAUCUACUAGUAGCACAGAAGUGAAUUCUCAGGCCAUUGCUGAGAAGCAGCCUUCCCAGGAAGUGAAGAUGGAGGCCAAAAUGGAAGUGGAUCAACCAGAACCAGCAGAUACUCAGCCGGAGGAUAUUUCAGAGUCUAAAGUGGAAGACUGUAAAAUGGAAUCUACCGAAACAGAAGAGAGAAGCACUGAGUUAAAAACUGAAAUAAAAGAGGAGGAAGACCAGCCAAGUACUUCAGCUACCCAGUCAUCUCCGGCUCCAGGACAGUCAAAGAAAAAGAUUUUCAAACCAGAAGAACUACGACAGGCACUGAUGCCAACUUUGGAGGCACUUUACCGUCAGGAUCCAGAAUCCCUUCCCUUUCGUCAACCUGUGGACCCUCAGCUUUUAGGAAUCCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-129.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -138.72

Frequency: 0.0000

Diversity: 109.17

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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