Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0014900
Sequence Length
2022 nt
GC Content
0.4263
ACACCUACACCACCAACAACACAACUUCCCCAACAAGUGCAGCCUUCACUUCCUGCUGCACCUUCUGCUGACCAGCCCCAGCAGCAGCCUCGCUCACAGCAGAGCACAGCAGCGUCUGUUCCUACCCCAACAGCACCGCUGCUUCCUCCGCAGCCUGCAACUCCACUUUCCCAGCCAGCUGUAAGCAUUGAAGGACAGGUAUCAAAUCCUCCAUCUACUAGUAGCACAGAAGUGAAUUCUCAGGCCAUUGCUGAGAAGCAGCCUUCCCAGGAAGUGAAGAUGGAGGCCAAAAUGGAAGUGGAUCAACCAGAACCAGCAGAUACUCAGCCGGAGGAUAUUUCAGAGUCUAAAGUGGAAGACUGUAAAAUGGAAUCUACCGAAACAGAAGAGAGAAGCACUGAGUUAAAAACUGAAAUAAAAGAGGAGGAAGACCAGCCAAGUACUUCAGCUACCCAGUCAUCUCCGGCUCCAGGACAGUCAAAGAAAAAGAUUUUCAAACCAGAAGAACUACGACAGGCACUGAUGCCAACUUUGGAGGCACUUUACCGUCAGGAUCCAGAAUCCCUUCCCUUUCGUCAACCUGUGGACCCUCAGCUUUUAGGAAUCCCUGAUUACUUUGAUAUUGUGAAGAGCCCCAUGGAUCUUUCUACCAUUAAGAGGAAGUUAGACACUGGACAGUAUCAGGAGCCCUGGCAGUAUGUCGAUGAUAUUUGGCUUAUGUUCAAUAAUGCCUGGUUAUAUAACCGGAAAACAUCACGGGUAUACAAAUACUGCUCCAAGCUCUCUGAGGUCUUUGAACAAGAAAUUGACCCAGUGAUGCAAAGCCUUGGAUACUGUUGUGGCAGAAAGUUGGAGUUCUCUCCACAGACACUGUGUUGCUACGGCAAACAGUUGUGCACAAUACCUCGUGAUGCCACUUAUUACAGUUACCAGAACAGGUAAGCUUGGCCAGGUGUGGACCAUGGUCCAUGUGUCCACAUGUCCAGGGAGUGCAUGCGGAUGGGCCAGCACACAUACAGUCAUGGUUCAUGUGUAUCUUGCUUGAAGACAGCUGUAUAGCACAAGUUCUGUUUUUUGCCUUCUGCCUUUGUUUGCAGAACAAUAAAAUUUUCUAUCAGAGUAGCCUUGCAUCAGUUACCUGGGUUCCUCCCAAGAGCUUGAGAAGUUAAGCAACUUUGUGAGUUGUUGGCCUAGAUGGGUCUAUAUCCCAGGCCCCACUUCUCUUUCUACUGUGUGUUUGUUGAUCACCACAGCCUGAGGCAAAACUGAGAAGAUUUUUAAACUUUUAACUGAAACUCGCUAGACAGCUUUUUGGAAAUAUUUCCUUUUUAGAUGAGGCCUAUCCCUAAGUAGUUGUUAUUAGAAUAUAUGAAAACAGGAUUCUGGAGUCUUUUCUUUGCCUCAUAUUAAGCAAAUUAAAAGGAAAACCUCACAUAGCUCUCUGUACCUUACUUUUCCCAACCCAGCCUUGUAUGUGACAGAGGAUGAUUUGAGUCUAAUAAACGAGGCACCUCUGCCUAAUUUUCUCCUGCCCAAUCAAUGGCUGUAAUCACAUAAAUCUCAUUCACUAAUCUAUCUUAACCACAAUUUGUCUCCUGUUUUCAGUGAUCAGCUACAAGUAUAGCUUGCAUUGGGUGUUUAUUUGGGGCUCUGAUACAAUAAUAACAAGGCUGGAUGAUAUUAAUACCCUUUAUUUGUUUGUUAAUACCAAAUCCAUGGUGUUGGUUUUUGCUGAACUUGUGUGUUGCAGAUGCAUUUCUAGCUUUGAAAAGUCACUUAAACUUUUUCUUUUAUUUACAAAAAGUUAGGCGUGCUUCUAAUGCUUUGUAGACCUAAUGCUUUGAUUUUGCAGUGAGUAAAAAUCUAGCUCUUUACUCAUUUGAAACCUAGAAAAGGUGGGACUCAAGUUGUUAUAAGUACCUUAUGUUUAAAAAAGCAAGUAACUGGACAUGAAACUUUUCUCAUGUUUACUAAAACAGUAGUCUAAAGUGUUUAUCUUUGCACCAAGCCAUCUUUAAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-531.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -570.75
Frequency: 0.0000
Diversity: 565.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............((((((.....((((((.....(((((((...........)))))))((.((((((........)))))).))....((((......))))..(((((((.(((((........)))))...)))))))......(((..(((((((..(((.....((((.(((((....((((((((.(((((...((((((((((((((........(((....)))..(((((((.......))))))).....((((....))))...))))))))).....((((((((((((..........((((((((((.(((.(((.((((((((.(.(((((........))))).).))))...)))).)))....(((.((((((((...(.((((...)))).).............(((.(..((((((((((.((.(((((((((....(((((((((....((((((((((....((.(((((......))))).))......((((....)))).......((((.......(((.((((.....(((..........))).....)))))))..)))).....(((((....)))))...)))))))..)))...)))))(((.(..(((..((.((.......)).))..)))..)))).........))))..))))..))).)).)).).)))))))))..).)))......((((((..(((((.(((((.....)).)))((((....)))).((((((((((((..((((((((.....))))....(((((((((((((((.(((((.((((.((((((((((((((...((((....))))(((((.(((((((((.((((((........((((((........((((((.....))))))..(((((......))))).(((((..(.((((((((((((...)))).)))))))).))))))..))))))(((.((((((((..((.......))..)))))))).))).((((.....))))..)))))))))))).)))))))))))))))).(((((........)))))))))))........)))).)))..)).)))))))).....)))))))))))...)))))))).).)))..((((((((...))))))))(((((....)))))))))).))))))....))))))))))).))).))))))))))......(((((((((((((((...((((((((((.........................(((((((.(((((..(((...((((.......))))..)))..))))).)))))))..((((((...((....))..))))))))))))))))))))))))).....(((........(((....)))......)))((((((..(.(((..................))).)..))))))..(((((.(.((.....(((..(((((....)))))..)))......))).)))))..))))))...............)))))))..)))))..........)))))...)))))))))))))..))))).(((((...)))))....(((((((((((...((((.((.((......)).)).))))....))))..)))))))............(((((((((......))))))))).....)))).....))).))))))).))).(((((((.((((((((((.......)))))))......((((((((..((((((......))))))..)))))))).....(((.........)))(((((((((..........)))))))))...))).))))))).)).)))).....))))))...(((..((..(((((....)))))))..)))((((((((........))))))))((((......)))).....((((........)))).......)((......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,...,..........,,,,{({{{{({((......(((((((...........))))))){(.((((((........)))))).})....((((......))))..(((((((,(((((........))))).,.)))))))((((((({,(((({({.{{.((((({{...{,..(((({..,,..,{,.(({.,((........|||||{||{.,...,..{,{.,,,})}..(((((((.......)))))))}}}}},|,,...))))))).)),))})))|.....{{{..,(((,,,..},,,,.}}|{{,|,.,,,,.}}|)))))}.,,{{.{.(((((........))))}{|{||||.{{{|||{|,|...,{{{{{..((((((((..,,({,....,|,{((((((((((((((,,.{,.((((((((((.((.(((((((((........((((((.{{((.(((..,{....((.(((((......))))).))......((({....})))..,,.{((.(((.((((((.({((((.{,,,,{,............,,.....,},)))}.,,,.,,...(((((....)))))...,,,})))...)))))).)))}}|.|}.(((..((.((.......)).))..)))..}},))).)).}}.))))))))))..))).)).)).).)))))))))..}.}},......,,((((((....})))))....{(((((((((((.....,{(((,(((((((((,(((,((((,,{.........,..}}}}))),||,,|,,.|||))))}...{{({{{(((({,.{{,(((((....))))),,,{.|||{{.||||}}}}))).,}})},}},,...}))}).}))))))..,,,,.....,,(((((......))))}.(((((..{.((((((((((((...)))).)))))))).}))))){{||||(((((.((((((((..((.......))..)))))))).)))}|{{{,,,.,||},,,,(((((..((((((((((.|{,,,,,|||{(((((........)))))),,,.,........,,,|{|||,{{|.,||,,,,||||,|,||((,,,..)}}}|}||}},(((((({..((((((((...))))))))(((({...,(((.......))))))))..})))))).}}},.((((({(||,,..},.}},}))))..(((((((((...((((((((((,.............,..........(((((((.(((((..(((...((((.......))))..)))..))))).)))))))..{{{{{{...{{....}),.}))))))))))))))))))))))))...{{({{{{,|..,,{((....,,,...{,,|,,,,|}}|.................((((((((((,{{{,.|||||..{{{{{.({((({{((((((.(((((....)))))...........(((((((...{(((((..{((((..{{,........,,.....................,},.....}.}}}..))))})))))}(((({...))))).)))))))))))))}..)))))),)}).},....,,}))))))))).,,,.,..,,,..},,,,}}}}}}}}}.,{((((((......))))))))))....)),))))))))))..))))),})},}}}|||||{,,{{,,|||.......,))))))))))))))}.}}....,}}}},.))))))))..,,}))))))}}......,,}}}.}}}}}))|(((((((((..........)))))))))},,,.{(((.....)))))))}...,}))))),.,,{{,..||},{((((....))))},|,.,,|{(((((((........))))))))|||.....,})})},,...||||,.......}}},..,}....||......))
Back