Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EP300_0015200

Sequence Length

773 nt

GC Content

0.4502

CUUUCCCAGCCAGCUGUAAGCAUUGAAGGACAGGUAUCAAAUCCUCCAUCUACUAGUAGCACAGAAGUGAAUUCUCAGGCCAUUGCUGAGAAGCAGCCUUCCCAGGAAGUGAAGAUGGAGGCCAAAAUGGAAGUGGAUCAACCAGAACCAGCAGAUACUCAGCCGGAGGAUAUUUCAGAGUCUAAAGUGGAAGACUGUAAAAUGGAAUCUACCGAAACAGAAGAGAGAAGCACUGAGUUAAAAACUGAAAUAAAAGAGGAGGAAGACCAGCCAAGUACUUCAGCUACCCAGUCAUCUCCGGCUCCAGGACAGUCAAAGAAAAAGAUUUUCAAACCAGAAGAACUACGACAGGCACUGAUGCCAACUUUGGAGGCACUUUACCGUCAGGAUCCAGAAUCCCUUCCCUUUCGUCAACCUGUGGACCCUCAGCUUUUAGGAAUCCCUGAUUACUUUGAUAUUGUGAAGAGCCCCAUGGAUCUUUCUACCAUUAAGAGGAAGUUAGACACUGGACAGUAUCAGGAGCCCUGGCAGUAUGUCGAUGAUAUUUGGCUUAUGUUCAAUAAUGCCUGGUUAUAUAACCGGAAAACAUCACGGGUAUACAAAUACUGCUCCAAGCUCUCUGAGGUCUUUGAACAAGAAAUUGACCCAGUGAUGCAAAGCCUUGGAUACUGUUGUGGCAGAAAGUUGGAGUUCUCUCCACAGACACUGUGUUGCUACGGCAAACAGUUGUGCACAAUACCUCGUGAUGCCACUUAUUACAGUUACCAGAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-189.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -206.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 230.44

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.........))((((..((((((..((((((((......((((((.(((..............((((..(((((.((((.(((((....))))).((((....))))..........))))....(((...(((.....)))...)))((.((...)).))(((.((((((((.(.(((((........))))).).))))...)))).)))..........))))).)))).((((...))))........)))))))))..)))((((((((((.((.(((((((((....(((((((((....((((((((((....((.(((((......))))).))......((((....)))).......((((.......(((.((((.....(((..........))).....)))))))..)))).....(((((....)))))...)))))))..)))...)))))(((.(..(((..((.((.......)).))..)))..)))).........))))..))))..))).)).)).).)))))))))..)))))..))))))((((((....))))))....((((((((((((....((((((.(((((((((.(((.((((...............))))))).))......).))))))...(((((((((((..((((((((....))))).....)))...)))))))))))..))).))).....))))).))))))).....................))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((......,..||((((,.((((((..(((((((((((....(((((((((.,......{,,.,,,|||..(((((((.......)))))))...,|||||....},}},}.))))))))){{....|||...(((.,,..}}},,.))).,.}|||||,.{{(((.(({(((((,(,{((((........}|}}},|.,}}||,..}}}.}}}........,.{{{{.{.{{({.((......{{{{{.{{...,.({.{(....}),,||,,,||,}||}|,|||,|||}}.}}}},{{({({,,,||,{{{...,....{(.(((((......))))).))......((({....})))..{{.(((.(((.((((((.({((((.({,,,{,.............,.....,},}))}.},,.,,...(((((....)))))...,,.}))}...)))))).)))))).|}.{((.,((.({.......)).))..))),.))}))}.)),)).)}}}))))))}.}}},||,||.}.})))))))}..}))))..})))))((((({....})))))....((((((((((((......{(((,(((((((((.(((.((((,,(.........}..))))))).)}..,..,)}})))))...{(({{{{{{{|..{({(((((....))))).....|||,,.||||}}}}))).,))))})).....))))).)))))))...,,..,,,,})),..,.,.}}})