Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0016100
Sequence Length
592 nt
GC Content
0.5051
GCUGGAGUGCAGUGGCGGGAUCUGAGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAUCUGGGACUGCAUGCGCAUGCCACCAUGCCCGUCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAGGAUUUCACCGUGUUGGCCAGGAUGGUCUCGAUCUCUUGACCUGGUGAUCCACCCGCUUCGAGCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCUACCACACCCGGCCUCAUUUAAUAAUUUCACAACAGCUCUGAGGUUAUUGGCCUGAAGCUUAGCAAAGUUAAGUAACUUUCCACAGGUUACUCAGCUGACCCUACUGCCUGGGCCAGGAAGCAGACCCAGGCAGUCUGAGGCAGAGUGCUCAAAUCCAGCCAUUCCAACAAGUGUUAAUUGACUAUUUUAGGACUAGAACUUUUGUGGCUCUAGUGAUCUGCAAAAGGCACCAGUUUUCAAACCAGAAGAACUACGACAGGCACUGAUGCCAACUUUGGAGGCACUUUACCGUCAGGAUCCAGAAUCCCUUCCCUUUCGUCAACCUGUGGACCCUCAGCUUUUAGGAAUCCCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-174.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -185.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 132.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((.........)).)))))))..)))))..((((((((.((((.((((.(((((.(((.((.(((((......)))))..))(((.(((((....))))).)))((((...........))))..))).)))))............(((((...)))))..)))).)))))))))).)).......))...((..(((.((((.((((((....((((((((((...((......)).))))).(((((((((((.........))))))))))))))))..(((((((...))))))).....(((((((((........((((...((((((((((.(........).))))))))))((((((.((((((((....(((((...........(((.((((.........)))).)))....(((((((((.((....)).))))))))).....(((((((......).))))))......((((....))))....))))))))))))).)).))))((....(((....)))....)))))))))))))))..)))))))))).))).))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,((((((((((((((.........)).)))))))..))))}..{{((((({{((((.((((,(((((,(((.((.(((((......}))))..)}{{(.(((((....))))).)}}{{,,...........,,}}..))),)}))}.....,,,,,,.||{{|},}}))},..)))).)))))))))).}}.......{{{..{|,,{{{,{|||,|{{{||,,,.((((((((((...((......)).))))).(((((((((((.........))))))))))))))))..(((((((...))))))).....((((((((({,{.....,{,,...((((((((((.(.,....,.).)))))))))){(((((.((((((((....(((({....,{{....(((,((,,..,,}..,,}},),)}}.,..(((((((((.((....)).))))))))).....(((((((......)))))}))......((({....))))....})))))))))))).)).)))){{....{{|.....,,....,,)).))))))))))..}}}})),,,}{||,...}},
Back