Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0017200
Sequence Length
775 nt
GC Content
0.4310
UUUUCAAACCAGAAGAACUACGACAGGCACUGAUGCCAACUUUGGAGGCACUUUACCGUCAGGAUCCAGAAUCCCUUCCCUUUCGUCAACCUGUGGACCCUCAGCUUUUAGGAAUCCCUGAUUACUUUGAUAUUGUGAAGAGCCCCAUGGAUCUUUCUACCAUUAAGAGGAAGUUAGACACUGGACAGUAUCAGGAGCCCUGGCAGUAUGUCGAUGAUAUUUGGCUUAUGUUCAAUAAUGCCUGGUUAUAUAACCGGAAAACAUCACGGGUAUACAAAUACUGCUCCAAGCUCUCUGAGGUCUUUGAACAAGAAAUUGACCCAGUGAUGCAAAGCCUUGGAUACUGUUGUGGCAGAAAGUUGGAGUUCUCUCCACAGACACUGUGUUGCUACGGCAAACAGUUGUGCACAAUACCUCGUGAUGCCACUUAUUACAGUUACCAGAACAGGAUAUUUUUAAACAAGCUACUGAAGAUAGAUUAACAAGUGCAAAGGAAUUGCCUUAUUUCGAGGGUGAUUUCUGGCCCAAUGUUCUGGAAGAAAGCAUUAAGGAACUGGAACAGGAGGAAGAAGAGAGAAAACGAGAGGAAAACACCAGCAAUGAAAGCACAGAUGUGACCAAGGGAGACAGCAAAAAUGCUAAAAAGAAGAAUAAUAAGAAAACCAGCAAAAAUAAGAGCAGCCUGAGUAGGGGCAACAAGAAGAAACCCGGGAUGCCCAAUGUAUCUAACGACCUCUCACAGAAACUAUAUGCCACCAUGGAGAAGCAUAAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-183.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -196.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 135.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......))))).((......((((....)))).....(((.(((.((((((.((((((.((((.(.....................).)))).)))......(((((....))))).......)))...)))))).))))))((((....))))......(((((..((((((.(((((...((((...((((...(((...(((((...)))))...)))...))))....))))((((((....))))))....((((.(((((..........(((((...((((.(((.((((...............))))))).)).))....((((((.(((..(((((.......(((((..(((((((((((...(((((.((((....))))))))))))).......((((.((.(.(((((((.........((((((((((.((((((((..........))))))))...........((..((((((((((((......)))))))))))).))))..))))))))..........))))....)))).)).))))...............))))))).....)))))........)))))..))).)))))).....((((....))))...................................)))))((((......))))...........))))).)))).)))..)).))))))..)))))........((.(((((............))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......)))))}((......((({....}))).....(((.(((.((((((.((((((.({{{.,,.............,......,.}))).}},.,{...(((((....)))))......})))...)))))).)))))){{{,....}}},......(((((..((((((,({(((...{{{{,{{(,{{}}}|{(,..({(((,,.}}}}}}}}))|,,|}}}}....}}}}((((((....))))))....((((.(((((.........,((((({..((((.(((.((((.,{.........,..))))))).)).))....((((((.(((..(((((.......(((((.{(((((((((((...(((((.{(((....)))}))))))))).......((((.((.{.(((((((......({.((((((((((.((((((((..........)))))))).........,.((..((((((((((((......)))))))))))).))))..)))))))).,,.......))))....))),.)).))))...............)))))),..,}.)))))........)))))..))).)))))).....((((....)))).......................,,{{........,,}},||||,.,,.,))))}..........))))).)))).))}.,)}.))))))..)))))........((.(((((..,......}..))))).})))
Back