Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0017300
Sequence Length
2512 nt
GC Content
0.4061
GUGUGAGCCACUGGGCCUGGCCUAAUUCAGGGAGUUUUAGUAUAUUCACAGAGUUGUGCAUGACACUUUCAUUUUCAUCAUCUGAAAAAAAUCCUUUACCAUUAACAGUCACUCACUAUUUUCUCCCAUAGCACCCCAAUCCUAGACAUCACCAGACUGCAUUCUGUCUCUGGAUUUGUCUGUUCUACAUGUUUCAUUAAAUUGGAACAUACAGUAUGUGAUUCUUUGUGCCAGGACGUUCCUUAGCAUAAUGUUUUCAAGGUUCAUCCAUGUUGUAGCAUGAAUCAGUAGCACAUACCUAUUUAUAGCCCAAUAAUAUUCCAUUAUUUUUCUUUACCUGUUGAUGAGUUGAUAGACAUUUAGGUUGUUUACACGUUUUGACUAUUAAGAUAGGACUGUAGUGAACAUUGUGUGGAUUUAAGUUUUUAUUUCUCCUUGGUAUUUACCUAGGAGUGGAAUUCCUGGGUUAUAUAGUUUGUUUACUUUUUUGUUGUUGUUAUUUGUUUUUUGUUUUUUUGAGAUGGAGUUUCACUCUUGUUGCCCAGGCUAGAGUGCAAUGGCGCAAUCUCAGUUCACCUCAACCUCCCCCUCCCGGGUUCAAGCAGUUCUCCUACCUCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGGCAUGUGCCACCAUGCCCGGCUAAUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCUGUAUGUUGGUCAGGCUGGUCUCAAACUCCCAACCUCAGAUGAUCCACCCACCUCGGCCUCCCAGAAUGCCCAGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCACCCGGCCACUUUCGUUGUUUCAAGAGCAAUAGGUCAUAGCAGAAAAAAGGACCGUGGUUAGCUUUGUUUUUAAAGUUGCCUCCAUAUACUAGGCUGCUGGCAGAUUUCAUUUGGUGGUUUUAAACUGUUACUUGGCCGGGCACGGUGGCUAACGCCUGUAAUCCCAACACUUUUGGAGGCCAAGGCAGGCAGAUCACUUGAGUUCAGGAGUUGGAGACCAGCCUCACCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUAUAAAAAGUAACUGGGCGUGGUGGUGCACGCCUGUAAUCCUGGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGUGAAUAGUUUGAACGACCCUGGGAGGCAGAGGUUGCACUGAGCCAAGAUUGCACCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACAUGUUGACAGAGACUCCAUCUCAAAGGUCAAGUGCUUCCAGGGGCAAAAGCCUUUUAGGACUUUUCCUCUCUUGUAUCUUGCUGUGAUUUCAGAUGGAACAUUUUAAGUUCUGUGGGCUUAGUUUCCUCAUUGUACACCCCUUCUAGUACUAAAAUUUUAAAUGUCUUUGACUUUACUGAUCUCACAUGUACUUUCAUAAAGAACCUGAAGUUGCUUCAGUAGAAUAUCAGCCUGAUGUCUAGAAAGUCCAUAGUAGUUCUGUUUCUCUGCCCUUUGAGUAGUUUAAUAUCUCUGUAAACUAAUAUUUAAAGAAGUGAUGGACAUCAGUCACCUCUUGGGGAAUAUAGACAGGCCAGAAACUAAAACACUGCCUGGAAAAUUAACAAUGAUAAUGGAUGAUACUCCAUCUCCCGUAAAAAUAGUGAGACUUGAGUAAUGUUUGAUGUCACUUGUCUUUCUAGGAUUACUUUGAUAUUGUGAAGAGCCCCAUGGAUCUUUCUACCAUUAAGAGGAAGUUAGACACUGGACAGUAUCAGGAGCCCUGGCAGUAUGUCGAUGAUAUUUGGCUUAUGUUCAAUAAUGCCUGGUUAUAUAACCGGAAAACAUCACGGGUAUACAAAUACUGCUCCAAGCUCUCUGAGGUCUUUGAACAAGAAAUUGACCCAGUGAUGCAAAGCCUUGGAUACUGUUGUGGCAGAAAGUUGGAGUUCUCUCCACAGACACUGUGUUGCUACGGCAAACAGUUGUGCACAAUACCUCGUGAUGCCACUUAUUACAGUUACCAGAACAGGUAUCAUUUCUGUGAGAAGUGUUUCAAUGAGAUCCAAGGGGAGAGCGUUUCUUUGGGGGAUGACCCUUCCCAGCCUCAAACUACAAUAAAUAAAGAACAAUUUUCCAAGAGAAAAAAUGACACACUGGAUCCUGAACUGUUUGUUGAAUGUACAGAGUGCGGAAGAAAGAUGCAUCAGAUCUGUGUCCUUCACCAUGAGAUCAUCUGGCCUGCUGGGUAAGUCUUAACGUUGUUACUUUCUCUGGAAUUUUUCUUUAUCGUGAAUAUUAACAAGUUUUUUAUUCUAUGCAAUUGACUGUAUUAUAUCUUCAAAGUUACUAUCUUUAAAUUGUUUUCUUUGGGUUUGGCCACGAUAAUUAUAGUUCGCUUUUUAAAAAUUAAGUAACCUAGUAUCCAAAAAUAGAUUUUUAUCUUAUUUUUAUGCAUUCUUCUUAGCCAUAUAAAUAUAUUUUAUUCUGCUGGAUUGUUUAUUAAAAUUAUAUUGUAGUUAUUACACAUCAAAAGUAAAUAUUUAUGGCCAGGCGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-862.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -909.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 533.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....)))(..((((((((....((...((((........))))...))((((((((((((.......((((((.....))))))......................((((.(.(((((((.((((((((..((((...((((((...(((((..(((...))).)))))...))))))......((((((((......))))))))...(((((((...((((((((.((((...))))..)))))).........(((((((.(........).)))))))))...))))))).....(((((((((.....((((((............(((((..((((..(....)..))))))))).(((((((((..((.(((((............))))).))...)))))))))..............(((((.(((....))).)))))))))))...)))))))))..((((((.(((((...((.((((.............((..((((((((((((((((((..((.(((((((((((((.(((((((.(((.(((((((..(((((...(((((((..((((((((((((((((.((((.(((...((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.((.(((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((.(((((((((((.((((((....(((((.(((((..((..(((.(((((((.(((.((....((((((((((((.((((((((..(((((((((((..(((((((...)))))))))))..((((((.....((((((((((.((((((((....))))))))...))))...((((....))))(((((...)))))..))))))...))))))...)))))))..)))))))).))))))))))))....)).))).))))))).)))..))..))))).)))))....)))))).))))))))))).)))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))..)).))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).))).)))).)))))))....)))))))))..)))))))...)))))..))))))).))).))))))).)))))))))))))....))..)))))))))))))))))).))((((((...((((((((((((((..((((((((((((..(((...(((.......)))...))).))))......)))))))).))))))..........)))....)))))...)))))).......((((((((.(((((..((((......(((((.((((((.........((((((...))))))((((.(((((...))))))))))))))).))).))....((((((.....((((..((((((((((.........)))))))............(((((........))))))))..)))).....))))))(((((..............((((((((....(((((((((.((((((.(((((..((((.(.........).))))...))))).)))))).))))).)))).)))))))).....(((((((((((........(((.(..(((..((.((.......)).))..)))..)))))))))))))))....))))))))).))))).))))))))((((((.....)))).))((((((....))))))..)))).)).))))).))))))...(((....((((.(((.((((...............))))))).)).))..))).))))....)))))))).))))))).)))))......(((((...)))))((((....))))...))))))))))))..(((((((.((.((((.((((((.((((......))))......)))))).)))))).)).)))))..(((((((((.....)))))))))((((.......)))).......((((((((((.((((((((.....(((((.((((((.((((((((((.(((((.(((..(((.(.((...(((((...))))).....)).).))))))))))))))).........((((((.((((((....))))))..))))))..))))))..)))))))))))...))))))))...(((((..((.....))..))))).(((((......)))))............((((((((.((((((..((...((.(((..(((....)))...))).))...))..)))))).))..))))))...((((..((((((((((....))).))))))))))).......(((((...(((((.....)))))...))))).................)))))))))).((((.........))))........))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.....)))(..((((((((,,,.,,.({((({..,,,,..}}}}.,.||({((({{((({{.......{(((((.....)))))}..................,{,.,,,,,|,|{{{{||,||{{{{{{.........((((((...(((((..(({...})).)))))...))))))......((((((((......))))))))...{{{{{{{...,.((((((.((((...})))..)))))}.{,.,,{{{(((({{{.{,{{,....)})))}},,||{{{,|||,|}{{{..{((((((((.....((((((,...........,,{,,..||,|,,,.{{{{{{,{{{{{{||,{{(((((((,.((.(((((..,{......},))))).)).,.)))))))))}}}}}}.}}})}}.{((((.(((....))).)))))))))))...)))))))))})),.||||||||,.,,{(,{{{{{{,,,,,{,....{(,.{(((((((((((((((((..,(.(((((((((((((.(((((((.(((.(((((((..(((((...(((((((..((((((((((((((((.((((.(((..,((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((.{,.(((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((.(((((((((((.{(((((..,.(((((.(((((..((..(((.(((((((,((({((....((((((((((((.((((((((..((((((((,,...(((((((...))))))),|||..{(((((.....,{{{{{{,((,{(((((((....))))))))}}.}},,...{{{{.,.,)))){{({{...}}})).,)))}}}...))))}}..})))))))..)))))))).))))))))))))....)).)))}))))))).)))..))..))))).))))).,..)))))}.))))))))))).)))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))..}}.))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).))).)))).))))))}...,))}))))))..)))))))...)))))..))))))).))).))))))).))))))))))))).,..),..))))))))))))))))}}.,,((((((...(((((,,,((((((..((((((((((((..({{.{.(((.......)))..,))).))))......)))))))).)))))).,........,,}.,..)))))...)))))).......,(((((((.(((((..(((((..{{.{{(((.((((((.........((((((...))))))((({{(((((...})))))))})))))).))}.||,|,{((((((,{..,((({..{{{(((((({.,,....,,))))))}..,|||.{{{{.(((((......,.))))).))}})))),..,,}))}})||{||,..,.......,,,{((((({{....(((((((((.((((((.(((((.,((((.{.......,.).))))...))))).)))))}.))))).)))).)))))))).,,.,{{{((((((((........(((.(..(((..((.((.......)).))..)))..)))))))))))))||,,.,))))))))).))))).)))))))|((((((.....)))).))|(((((....))))))..,,||,{|||||||,}}},,,||||,{,{{{((((.(((.((((.,{.........}..))))))).)).}}..}))}))))).,,}})))})),))}}}||{((((....))))},,,..|}}||,{(((....)))},}}))))))}}}})),,|{|||||,|.(((({.((((((.((((......))))......)))))).})))),.}},,))))..(((((((((.....)))))))))((({.....,.))))...,,..((((((((((.((((((((.{(..(((({,((((((.,,{((((({{.((((,{(((..{(({{.{{...(((((...)))))...,}.}}}}},,)))))))))))),.....,..{(((((.{{{(((....})))))..)))))}..}},}}},.))))))))))).,,)))))))).,,(((((..{,.....,,..))))).{{(({...,,.}}}}}........,{{{({{(({,,.,{{{{{..|{...|||||({,..,,}}.))),,,.,},)),,.||,,}}}}},.,..,)))})}...((({..((((((((((....)))},)))))))))).....,,,{(((...(((((.....)))))...)))))},,},,,..........)))))))))).,,||,,,..,,,,)))),,,.,,,.))))))))..)
Back