Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0017800
Sequence Length
1518 nt
GC Content
0.4289
GAUUACUUUGAUAUUGUGAAGAGCCCCAUGGAUCUUUCUACCAUUAAGAGGAAGUUAGACACUGGACAGUAUCAGGAGCCCUGGCAGUAUGUCGAUGAUAUUUGGCUUAUGUUCAAUAAUGCCUGGUUAUAUAACCGGAAAACAUCACGGGUAUACAAAUACUGCUCCAAGCUCUCUGAGGUCUUUGAACAAGAAAUUGACCCAGUGAUGCAAAGCCUUGGAUACUGUUGUGGCAGAAAGUUGGAGUUCUCUCCACAGACACUGUGUUGCUACGGCAAACAGUUGUGCACAAUACCUCGUGAUGCCACUUAUUACAGUUACCAGAACAGGUAUCAUUUCUGUGAGAAGUGUUUCAAUGAGAUCCAAGGGGAGAGCGUUUCUUUGGGGGAUGACCCUUCCCAGCCUCAAACUACAAUAAAUAAAGAACAAUUUUCCAAGAGAAAAAAUGACACACUGGAUCCUGAACUGUUUGUUGAAUGUACAGAGUGCGGAAGAAAGAUGCAUCAGAUCUGUGUCCUUCACCAUGAGAUCAUCUGGCCUGCUGGAUUCGUCUGUGAUGGCUGUUUAAAGAAAAGUGCACGAACUAGGAAAGAAAAUAAGUUUUCUGCUAAAAGGUUGCCAUCUACCAGACUUGGCACCUUUCUAGAGAAUCGUGUGAAUGACUUUCUGAGGCGACAGAAUCACCCUGAGUCAGGAGAGGUCACUGUUAGAGUAGUUCAUGCUUCUGACAAAACCGUGGAAGUAAAACCAGGCAUGAAAGCAAGGUUUGUGGACAGUGGAGAGAUGGCAGAAUCCUUUCCAUACCGAACCAAAGCCCUCUUUGCCUUUGAAGAAAUUGAUGGUGUUGACCUGUGCUUCUUUGGCAUGCAUGUUCAAGAGUAUGGCUCUGACUGCCCUCCACCCAACCAGAGGAGAGUAUACAUAUCUUACCUCGAUAGUGUUCAUUUCUUCCGUCCUAAAUGCUUGAGGACUGCAGUCUAUCAUGAAAUCCUAAUUGGAUAUUUAGAAUAUGUCAAGAAAUUAGGUUACACAACAGGGCAUAUUUGGGCAUGUCCACCAAGUGAGGGAGAUGAUUAUAUCUUCCAUUGCCAUCCUCCUGACCAGAAGAUACCCAAGCCCAAGCGACUGCAGGAAUGGUACAAAAAAAUGCUUGACAAGGCUGUAUCAGAGCGUAUUGUCCAUGACUACAAGGAUAUUUUUAAACAAGCUACUGAAGAUAGAUUAACAAGUGCAAAGGAAUUGCCUUAUUUCGAGGGUGAUUUCUGGCCCAAUGUUCUGGAAGAAAGCAUUAAGGAACUGGAACAGGAGGAAGAAGAGAGAAAACGAGAGGAAAACACCAGCAAUGAAAGCACAGAUGUGACCAAGGGAGACAGCAAAAAUGCUAAAAAGAAGAAUAAUAAGAAAACCAGCAAAAAUAAGAGCAGCCUGAGUAGGGGCAACAAGAAGAAACCCGGGAUGCCCAAUGUAUCUAACGACCUCUCACAGAAACUAUAUGCCACCAUGGAGAAGCAUAAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-401.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -431.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 429.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((..............(((.((((((((.((...........(((.((((...((((((.((((((.......((((.(((((......(((((....(((((........((((((....))))))....((((((((((((....((((((.(((((((((.(((.((((...............))))))).))......).))))))...(((((((((((..((((((((....))))).....)))...)))))))))))..))).))).....))))).))))))).(((((.((((((.((((......))))......)))))).)))))......((((..(((((((((.....)))))))))((((.......))))...))))................))))).....)))))........))))).))))..)))))))))))))))).)))...........)).)))))))).)))..((((((((........))).)))))...((((((.((.((((((...(((((..(((((...(((((.((((((((.((((((.((((((....))))))......((((.(((((((...)))..))))))))))))))....)))))).....))))))).....))))).)))))..)))))).))..)))))).)))))))))))))(((((((((.......((((((..((((((((..((......))..)))))(((((((((((((((((......)).))))))))...........((((....((((((..............((((.((((((((((.....)))))((((((((.(((((...)))))((((((..............(((((((..((((.((((.......))))))))...))))))).(((((.........))))).)))))).....((((((((.....)))).)))))))))))).........)))))))))...)))))).....)))).)))))))...((((((((((((....)))))))).))))..((((((((.((((.......(((..((...((....)).))..)))...........(((((......((((.(((((((....(((((.((....)).)))))...........))).))))..)))).....)))))((..((((((((((((......)))))))))))).))((((((((((...)))..)))))..))..))))..))))))))..............((((((.......((....))....(((....))).....(((....((((....)))).........................((..........)).((((......))))............))).((((((.....)))))).....))))))............)))..)))))))))))))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{{{(((({{{{.,((({,,.,{,{{{(({((((((((.{(.....,,{,..(({,(({(.,,((((((.((((({.,|,.,,{(({.(((({.,....{{{((|,.,{{{{{......,.((((((....))))))....((((((((((((.....,{(((,(((((((((.(((.((((.,(.........}..))))))).)}.,}..,}|}))))}...{((((({{({|..,({(((((....)))))...,,|||{{.||||,,,,))),}))))})).....))))).))))))).(((({.((((((.((((......))))......)))))).}))))..,...||||,,|||{||{{{{.,.,|||||}}||(({{...,,},}}}}.,,}}},................}}}}}.,..{|}},}........,}}}}.}}))},}}}))}}}))))))}}..,}{{{{...}})})}.))}}}})).}}|{{,{{{{|{||,,|||||{{,{|,..,.},|{((((.((,((((({...(((((..(((((...(((({{((((((((.{({({,.(((({,....}))))).,..{((((,{(((({{{...}}}..))))))))))})))....)))))).....))))))).....))))).)))))..}))))),)}..}))))}.||||||||||}}}{{|||{{||,,,....{{{{{{..{{,{((((..((......))..))))}(((((({((((((((((......)),})))))))...........((((....(((({,.,......,,,.,,((({{((((((...(((({{((({,{{{{((((.(((((...)))))((((((..,,..........(((((((,.((((.((((.......))))))))...))))))).(((((......,},))))).)))))).....{{{{((((.....)))).}},,}}})))))))}}}}..))))))))))..,))))))....,)))).)))))))...{{{{((((((({....}))))))).})))|.((((((((.((((..,.{{{(({..((...((....)).))..}))},.........(((((......((((.(((((((....(((((.((....)).)))))...........))).))))..)))).....)))))((..((((((((((((......)))))))))))).))((({{((({(...,,,.,}))))..))..))))..)))))))).,............{|{|||......}}},},.},...}|||,,,}})).||..|||....((((....)))).........................{{..........}}.{(((......))))............,,},{({|||,,...))})))..,..))))))..,.........}}}..))))))})}}))))...,,)
Back