Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EP300_0020800

Sequence Length

427 nt

GC Content

0.4403

GUUUGUGGACAGUGGAGAGAUGGCAGAAUCCUUUCCAUACCGAACCAAAGCCCUCUUUGCCUUUGAAGAAAUUGAUGGUGUUGACCUGUGCUUCUUUGGCAUGCAUGUUCAAGAGUAUGGCUCUGACUGCCCUCCACCCAACCAGAGGAGAGUAUACAUAUCUUACCUCGAUAGUGUUCAUUUCUUCCGUCCUAAAUGCUUGAGGACUGCAGUCUAUCAUGAAAUCCUAAUUGGAUAUUUAGAAUAUGUCAAGAAAUUAGGUUACACAACAGGGCAUAUUUGGGCAUGUCCACCAAGUGAGGGAGAUGAUUAUAUCUUCCAUUGCCAUCCUCCUGACCAGAAGAUACCCAAGCCCAAGCGACUGCAGGAAUGGUACAAAAAAAUGCUUGACAAGGCUGUAUCAGAGCGUAUUGUCCAUGACUACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-110.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -119.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 77.25

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((((((((((((.((((((((((....)))..............((((....((((((..............((((.((((((((((.....)))))((((((((.(((((...)))))((((((..............(((((((..((((.((((.......))))))))...))))))).(((((.........))))).)))))).....((((((((.....)))).)))))))))))).........)))))))))...)))))).....)))).....(((...))).((((((((....))))))))..))))))))))).........(((((...(((((((((((((........))).........))))))....))))))))).......))))))))))))(....)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((({(((((((((((((.((((((((,,....}||......,,......((((,,,,({{{,..},,,.........((({{((((((...((({{{((({{{,,{{(((.(((((...)))))((((((..,,..........(((((((,.((((.((((.......))))))))...))))))).(((({......,},))))).)))))).....{{{{((((.....)))).}}}}))))))))))))))..))))))))))..,)))))}.,,,,})}}.....{{|,..))).((((((({....})))))))..))))))))))).........(((((...((((((((({.,,,,.,...,}}}.........})))))....))))))))).......))))))))))))(....)