Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0021000
Sequence Length
789 nt
GC Content
0.3663
GGUAAGCAUAUUUUGAUAAUGGCUUUUUUUCUUUAACUAGCAUGGCAUUCUGGUGAGAUAUAGGUUAAAUAUGCAAAUAUAUAACUCUUGGCCUUUUUUUCCUCAUUUUAGUUCUUACGUAACAAUUCUCUUAACUUUGUUGGAGCCCCUUUGAAGUUAAUGUCAGUAGAGAGAAAUGGAUAUGUUGGCCCUAGUUUCACCCAUCCAACAUUAGUUUUGUUUGUAAGCUAAGCCAUUGGGUCCACUUUGCUUUGAAGUUUGAUUUGUGCCCCUCAUUUGAGGGCAGAAUUUUAACUGCAUUUGAUCCUUUUACAACCUGGGUAUGAAGACCAAAAACAGUUCUGGAGAUACUUCUUACCUUUAGAGUAUGUAUGUCAUUGGAAACAUUCACUCCCUCAUCUUGAAGUCUGUUUCUCUGAACAGUGUGCCUUUUAAUUUAGCUCUUGUUAAAUGGGUCCAUUUUCCUUUGCAGUGUAAUCUUCAUUUGGUCUUAACAUGCAGACUUAGGGUUUUUGGAUCCAGGGCUAAGUCACCCACUUCGUGGCUGAGAUUCGCAACAUCCCACCAUGGCCUCCAAAAAUAAGUAGGCAAUAUGAGAUCCAUUGUUACUACUGUGAGUUAUGCCUAAUUUUGGCCUCACAAUGUUAAUCUCAUUCUGGGUUAUAUAUACACUGUGUUAUCUUGGGAAAAAUUAUUGGUAUCUAUAUCAACUCCAACUUGUGGUUUAAAAUGUAGCCUUCUAGAAUAGAUUAUCUCUUUUCCUUAAUGUUCUUUCUCUUUGUAUUGUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-174.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -191.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((..((...(((....((((.....((((..(((((.(......))))))))))....(((((.((((....)))).)))))...)))).........)))...))...))))).(((((((....(((((((((..((....))..)))))))))......((((((((((.(((((((((((...((((((..((((...(((((.(((..(((.(((((.((((((((((((((..((((.((((((.((((.((.((.(((((.((....))))))).)).)).))))......(((((....((..(((((((((((((((((((....((((.(((((((((((.........((((((((...((....)).))))..)))).........)))))..))))))..))))((((.((((....(((((((....))))))))))).))))......((.((......)).)))))))))))..)))....)))))))))....))))))))))).)))).)))))....))))))((((((.(((..(((.((.....((((.(........).))))....)).))).............((((((....(((.......))))))))).))).))))))....))).))))).))).))))))))....))))..))))))((((((....))))))..)))))....((((........)))).....(((.(((.....))).)))....)))))))))))))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.,{,...{{{.,{.{(((.....,,,,..{{{{{.{......,}}||}||||...{(((((,((((....}))).)}}},.}})))),...,,,,.)))...,,,,.))))).(((((((....(((((((({..((....))..}))))))))......{(((((((((.((((((({{((,..((((((..((((...((((,,(((..(((.(((((.((((((((((((((..((({.((((((.((((.((.((.((((((((....))))))).)).)}.))))......(((((....,,..((((((({(((((((((({....((((.(((((((((((.........((({,{{{.{,(,....||.}))}..)))).........))))).,))))))..)))){(((.((((....(((((((....))))))))))).)))}......{{,{{.,....,,.,,)))))))))..})),),.}))))))}}....))))))))))).}))).)))))....)))))}((((((.{((..{,..,,..,||({{{.{........|,||}},.,{||.,...,}},}}..,,,,{(((((....(((.......))))))))).))).)))))),...))).))))).))).))))))))....))))..)))))),{||{,....})))}}..}}}}}....((((........)))).....(((.(((.....))).)))....)))))))))))))))).)))))))
Back