Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0021600
Sequence Length
609 nt
GC Content
0.4828
GAUAUUUUUAAACAAGCUACUGAAGAUAGAUUAACAAGUGCAAAGGAAUUGCCUUAUUUCGAGGGUGAUUUCUGGCCCAAUGUUCUGGAAGAAAGCAUUAAGGAACUGGAACAGGAGGAAGAAGAGAGAAAACGAGAGGAAAACACCAGCAAUGAAAGCACAGAUGUGACCAAGGGAGACAGCAAAAAUGCUAAAAAGAAGAAUAAUAAGAAAACCAGCAAAAAUAAGAGCAGCCUGAGUAGGGGCAACAAGAAGAAACCCGGGAUGCCCAAUGUAUCUAACGACCUCUCACAGAAACUAUAUGCCACCAUGGAGAAGCAUAAAGAGGUCUUCUUUGUGAUCCGCCUCAUUGCUGGCCCUGCUGCCAACUCCCUGCCUCCCAUUGUUGAUCCUGAUCCUCUCAUCCCCUGCGAUCUGAUGGAUGGUCGGGAUGCGUUUCUCACGCUGGCAAGGGACAAGCACCUGGAGUUCUCUUCACUCCGAAGAGCCCAGUGGUCCACCAUGUGCAUGCUGGUGGAGCUGCACACGCAGAGCCAGGACCGCUUUGUCUACACCUGCAAUGAAUGCAAGCACCAUGUGGAGACACGCUGGCACUGUACUGUCUGUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-164.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -176.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 171.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((..........)))))))).....(((((((((.((((((((((((......))))))))))))(..(((..(((((..((.......))..))))))))..).((((...((((((((.....(((((((......((((((((....(((....)))....((((((...((.....((((........................))))........(((((..(.(((((((((..((.((((((.....((((((.....))))))...(((((((........((.((((....)))).))........))))))))))))).))....)))))..)))).)..)))))))...))))))......)))))))).......)))))))(((((..((.((((...)))).)).)))))((((.....)))).....(((........)))....)))))))).)))).....(((.(((((((..(((((((..((((..(((..((((....))))..)))((((......)))).....((((.....)))))))).))))))).))).)))))))..))))))...)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{{{{{{,.........,|,}|||||{.,..(({(((((,.((((((((((((......)))))))))))){..(({..(((((..({.......))..))))))))..)}{{{{,..{{{{{{{,.....(((((((......((((((((..,{(((....)))....((((((.,((((....|}||.......................,{{{{.........{({({.({((..(((,{.{(({(((({......((((((.....))))))...{((((((........{{.((((....}})}.,}...}....)))))))))))))}),.})}.,)))),})))}},..)))))....))))))..,,..))))))))....,..))))))){((((..((.((((...)))).)).))))}((((.,,,,,|||,,{,.{{({,,,,,,.}|||{.,}}||||||.}}}},,}},||||{{{(((({,(((,(({..,|||}}|((..((((....))))..))}||||,}},.,)))).....((((.....)))).}},}))})))),))},)))}}))}})))}))}}})}).}}
Back