Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EP300_0021900
Sequence Length
282 nt
GC Content
0.5674
GUCUUCUUUGUGAUCCGCCUCAUUGCUGGCCCUGCUGCCAACUCCCUGCCUCCCAUUGUUGAUCCUGAUCCUCUCAUCCCCUGCGAUCUGAUGGAUGGUCGGGAUGCGUUUCUCACGCUGGCAAGGGACAAGCACCUGGAGUUCUCUUCACUCCGAAGAGCCCAGUGGUCCACCAUGUGCAUGCUGGUGGAGCUGCACACGCAGAGCCAGGACCGCUUUGUCUACACCUGCAAUGAAUGCAAGCACCAUGUGGAGACACGCUGGCACUGUACUGUCUGUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-94.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -97.52
Frequency: 0.0054
Diversity: 50.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...(((....((.(((((((((((......))))(((((.(((.((((.(((((.(((((((((.((.((((...........)))))).)))))))))((((.....)))).)))))))))...)))...))))).((((((.....))))))...((((((((((((.((....))))))((..((((....))))..)).))))))))............)))))))..))...))).....)))))).(((.((((......)))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((...(((....((.((((((({(((.,,,,.}}}|(((((.(((.((((.(((((,(((((((((.((.((((...........)))))).)))))))))((((.....)))),)))))))))...)))...))))),((((((.....))))))...{(((((((((((.((....))))))||,.||||....)))).,)),||||}}}}..},,,......)))))))..))...))).....)))))).(((.((((......)))).)))..
Back