Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EPHB4_0000100

Sequence Length

2104 nt

GC Content

0.5703

GUACUAAGGUCUACAUCGACCCCUUCACUUAUGAAGACCCUAAUGAGGCUGUGAGGGAAUUUGCAAAAGAGAUCGAUGUCUCCUACGUCAAGAUUGAAGAGGUGAUUGGUGCAGGUGAGUUUGGCGAGGUGUGCCGGGGGCGGCUCAAGGCCCCAGGGAAGAAGGAGAGCUGUGUGGCAAUCAAGACCCUGAAGGGUGGCUACACGGAGCGGCAGCGGCGUGAGUUUCUGAGCGAGGCCUCCAUCAUGGGCCAGUUCGAGCACCCCAAUAUCAUCCGCCUGGAGGGCGUGGUCACCAACAGCAUGCCCGUCAUGAUUCUCACAGAGUUCAUGGAGAACGGCGCCCUGGACUCCUUCCUGCGGCUAAACGACGGACAGUUCACAGUCAUCCAGCUCGUGGGCAUGCUGCGGGGCAUCGCCUCGGGCAUGCGGUACCUUGCCGAGAUGAGCUACGUCCACCGAGACCUGGCUGCUCGCAACAUCCUAGUCAACAGCAACCUCGUCUGCAAAGUGUCUGACUUUGGCCUUUCCCGAUUCCUGGAGGAGAACUCUUCCGAUCCCACCUACACGAGCUCCCUGGGAGGAAAGAUUCCCAUCCGAUGGACUGCCCCGGAGGCCAUUGCCUUCCGGAAGUUCACUUCCGCCAGUGAUGCCUGGAGUUACGGGAUUGUGAUGUGGGAGGUGAUGUCAUUUGGGGAGAGGCCGUACUGGGACAUGAGCAAUCAGGACGUGAUCAAUGCCAUUGAACAGGACUACCGGCUGCCCCCGCCCCCAGACUGUCCCACCUCCCUCCACCAGCUCAUGCUGGACUGUUGGCAGAAAGACCGGAAUGCCCGGCCCCGCUUCCCCCAGGUGGUCAGCGCCCUGGACAAGAUGAUCCGGAACCCCGCCAGCCUCAAAAUCGUGGCCCGGGAGAAUGGCGGGGCCUCACACCCUCUCCUGGACCAGCGGCAGCCUCACUACUCAGCUUUUGGCUCUGUGGGCGAGUGGCUUCGGGCCAUCAAAAUGGGAAGAUACGAAGAAAGUUUCGCAGCCGCUGGCUUUGGCUCCUUCGAGCUGGUCAGCCAGAUCUCUGCUGAGGACCUGCUCCGAAUCGGAGUCACUCUGGCGGGACACCAGAAGAAAAUCUUGGCCAGUGUCCAGCACAUGAAGUCCCAGGCCAAGCCGGGAACCCCGGGUGGGACAGGAGGACCGGCCCCGCAGUACUGACCUGCAGGAACUCCCCACCCCAGGGACACCGCCUCCCCAUUUUCCGGGGCAGAGUGGGGACUCACAGAGGCCCCCAGCCCUGUGCCCCGCUGGAUUGCACUUUGAGCCCGUGGGGUGAGGAGUUGGCAAUUUGGAGAGACAGGAUUUGGGGGUUCUGCCAUAAUAGGAGGGGAAAAUCACCCCCCAGCCACCUCGGGGAACUCCAGACCAAGGGUGAGGGCGCCUUUCCCUCAGGACUGGGUGUGACCAGAGGAAAAGGAAGUGCCCAACAUCUCCCAGCCUCCCCAGGUGCCCCCCUCACCUUGAUGGGUGCGUUCCCGCAGACCAAAGAGAGUGUGACUCCCUUGCCAGCUCCAGAGUGGGGGGGCUGUCCCAGGGGGCAAGAAGGGGUGUCAGGGCCCAGUGACAAAAUCAUUGGGGUUUGUAGUCCCAACUUGCUGCUGUCACCACCAAACUCAAUCAUUUUUUUCCCUUGUAAAUGCCCCUCCCCCAGCUGCUGCCUUCAUAUUGAAGGUUUUUGAGUUUUGUUUUUGGUCUUAAUUUUUCUCCCCGUUCCCUUUUUGUUUCUUCGUUUUGUUUUUCUACCGUCCUUGUCAUAACUUUGUGUUGGAGGGAACCUGUUUCACUAUGGCCUCCUUUGCCCAAGUUGAAACAGGGGCCCAUCAUCAUGUCUGUUUCCAGAACAGUGCCUUGGUCAUCCCACAUCCCCGGACCCCGCCUGGGACCCCCAAGCUGUGUCCUAUGAAGGGGUGUGGGGUGAGGUAGUGAAAAGGGCGGUAGUUGGUGGUGGAACCCAGAAACGGACGCCGGUGCUUGGAGGGGUUCUUAAAUUAUAUUUAAAAAAGUAACUUUUUGUAUAAAUAAAAGAAAAUGGGACGUGUCCCAGCUCCAGGGGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-843.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -880.64

Frequency: 0.0000

Diversity: 495.05

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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