Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EPHB4_0000300

Sequence Length

2423 nt

GC Content

0.6232

GUGGACACGGUGGCCGCGGAGCAUCUCACCCGGAAGCGCCCUGGGGCCGAGGCCACCGGGAAGGUGAAUGUCAAGACGCUGCGUCUGGGACCGCUCAGCAAGGCUGGCUUCUACCUGGCCUUCCAGGACCAGGGUGCCUGCAUGGCCCUGCUAUCCCUGCACCUCUUCUACAAAAAGUGCGCCCAGCUGACUGUGAACCUGACUCGAUUCCCGGAGACUGUGCCUCGGGAGCUGGUUGUGCCCGUGGCCGGUAGCUGCGUGGUGGAUGCCGUCCCCGCCCCUGGCCCCAGCCCCAGCCUCUACUGCCGUGAGGAUGGCCAGUGGGCCGAACAGCCGGUCACGGGCUGCAGCUGUGCUCCGGGGUUCGAGGCAGCUGAGGGGAACACCAAGUGCCGAGCCUGUGCCCAGGGCACCUUCAAGCCCCUGUCAGGAGAAGGGUCCUGCCAGCCAUGCCCAGCCAAUAGCCACUCUAACACCAUUGGAUCAGCCGUCUGCCAGUGCCGCGUCGGGUACUUCCGGGCACGCACAGACCCCCGGGGUGCACCCUGCACCACCCCUCCUUCGGCUCCGCGGAGCGUGGUUUCCCGCCUGAACGGCUCCUCCCUGCACCUGGAAUGGAGUGCCCCCCUGGAGUCUGGUGGCCGAGAGGACCUCACCUACGCCCUCCGCUGCCGGGAGUGCCGACCCGGAGGCUCCUGUGCGCCCUGCGGGGGAGACCUGACUUUUGACCCCGGCCCCCGGGACCUGGUGGAGCCCUGGGUGGUGGUUCGAGGGCUACGUCCUGACUUCACCUAUACCUUUGAGGUCACUGCAUUGAACGGGGUAUCCUCCUUAGCCACGGGGCCCGUCCCAUUUGAGCCUGUCAAUGUCACCACUGACCGAGAGGUACCUCCUGCAGUGUCUGACAUCCGGGUGACGCGGUCCUCACCCAGCAGCUUGAGCCUGGCCUGGGCUGUUCCCCGGGCACCCAGUGGGGCUGUGCUGGACUACGAGGUCAAAUACCAUGAGAAGGGCGCCGAGGGUCCCAGCAGCGUGCGGUUCCUGAAGACGUCAGAAAACCGGGCAGAGCUGCGGGGGCUGAAGCGGGGAGCCAGCUACCUGGUGCAGGUACGGGCGCGCUCUGAGGCCGGCUACGGGCCCUUCGGCCAGGAACAUCACAGCCAGACCCAACUGGAUGAGAGCGAGGGCUGGCGGGAGCAGCUGGCCCUGAUUGCGGGCACGGCAGUCGUGGGUGUGGUCCUGGUCCUGGUGGUCAUUGUGGUCGCAGUUCUCUGCCUCAGGAAGCAGAGCAAUGGGAGAGAAGCAGAAUAUUCGGACAAACACGGACAGUAUCUCAUCGGACAUGGUACUAAGGUCUACAUCGACCCCUUCACUUAUGAAGACCCUAAUGAGGCUGUGAGGGAAUUUGCAAAAGAGAUCGAUGUCUCCUACGUCAAGAUUGAAGAGGUGAUUGGUGCAGGUGAGUUUGGCGAGGUGUGCCGGGGGCGGCUCAAGGCCCCAGGGAAGAAGGAGAGCUGUGUGGCAAUCAAGACCCUGAAGGGUGGCUACACGGAGCGGCAGCGGCGUGAGUUUCUGAGCGAGGCCUCCAUCAUGGGCCAGUUCGAGCACCCCAAUAUCAUCCGCCUGGAGGGCGUGGUCACCAACAGCAUGCCCGUCAUGAUUCUCACAGAGUUCAUGGAGAACGGCGCCCUGGACUCCUUCCUGCGGCUAAACGACGGACAGUUCACAGUCAUCCAGCUCGUGGGCAUGCUGCGGGGCAUCGCCUCGGGCAUGCGGUACCUUGCCGAGAUGAGCUACGUCCACCGAGACCUGGCUGCUCGCAACAUCCUAGUCAACAGCAACCUCGUCUGCAAAGUGUCUGACUUUGGCCUUUCCCGAUUCCUGGAGGAGAACUCUUCCGAUCCCACCUACACGAGCUCCCUGGGAGGAAAGAUUCCCAUCCGAUGGACUGCCCCGGAGGCCAUUGCCUUCCGGAAGUUCACUUCCGCCAGUGAUGCCUGGAGUUACGGGAUUGUGAUGUGGGAGGUGAUGUCAUUUGGGGAGAGGCCGUACUGGGACAUGAGCAAUCAGGACGUGAUCAAUGCCAUUGAACAGGACUACCGGCUGCCCCCGCCCCCAGACUGUCCCACCUCCCUCCACCAGCUCAUGCUGGACUGUUGGCAGAAAGACCGGAAUGCCCGGCCCCGCUUCCCCCAGGUGGUCAGCGCCCUGGACAAGAUGAUCCGGAACCCCGCCAGCCUCAAAAUCGUGGCCCGGGAGAAUGGCGGGGCCUCACACCCUCUCCUGGACCAGCGGCAGCCUCACUACUCAGCUUUUGGCUCUGUGGGCGAGUGGCUUCGGGCCAUCAAAAUGGGAAGAUACGAAGAAAGUUUCGCAGCCGCUGGCUUUGGCUCCUUCGAGCUGGUCAGCCAGAUCUCUGCUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1025.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1066.52

Frequency: 0.0000

Diversity: 613.38

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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