Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_EPHB4_0002600

Sequence Length

657 nt

GC Content

0.5312

GCUGCAGUGAGCUAUGAUCGCACCGCUGCAUGCCAGCCUGGGUGACAGAGCAGUGUGAGAUCCUCUCUCAAAAUAAAUGAAUAAGAAAGAGAGGGUGAGGAGCUCGUAAAGCUGGGCUGGAGAGUUAAGUACAGGAAGGCCCCCAGUGGGACUGGGGCCAGAGAGAAUCAGAAGGAAUUCUCGAAACAGCCAGGGGGAAAUUGAGACAAGUGUAGCCAGCAGAGGAAGUGUUGGAAAAGAUAAGGGACAUGGCCAGGCUGAUCACAAGGUCAGGAGUUCAAGACUAGCCUGGCCAACGUGGUGAAACCCCAUGUCUACUAAAAAUAAAAAAAUUAGCCAGGCAUGGUGGUGGGCACCUGUAAUCCACUUGGGAAGCAACCAGAAGAAUUGCUUGAACCCAGGAGGCGGAGGUUGCAGUAAGCUGAGACUGCGCCACUGCACUCCAGCCUGGGUGAUAGAGCACGACUCCGUCUCGAAAAAAAAAAUUUUUUUUAAGUUAAGGGACAGAGCUACCAUGCACAAGGGUUCCCUGUGUCUCUGCCUCUCACAGUACCUCCUGCAGUGUCUGACAUCCGGGUGACGCGGUCCUCACCCAGCAGCUUGAGCCUGGCCUGGGCUGUUCCCCGGGCACCCAGUGGGGCUGUGCUGGACUACGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-234.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -247.64

Frequency: 0.0000

Diversity: 225.66

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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