Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_EPS15_0001300
Sequence Length
1893 nt
GC Content
0.4258
UGGGUUGUAUCCCCUGCAGAAAAAGCUAAAUAUGAUGAAAUCUUCCUGAAAACUGAUAAAGAUAUGGACGGAUUUGUGUCUGGAUUGGAGGUCCGUGAAAUAUUCUUGAAAACAGGUUUACCUUCUACCUUACUAGCCCAUAUAUGGUCAUUAUGCGACACAAAGGACUGUGGGAAGCUUUCAAAGGAUCAGUUUGCCUUGGCUUUUCACUUAAUCAGUCAGAAGUUAAUCAAGGGCAUUGAUCCUCCUCACGUUCUUACUCCUGAAAUGAUUCCACCAUCAGACAGGGCCAGUUUACAAAAGAACAUCAUAGGAUCAAGUCCUGUUGCAGAUUUCUCUGCUAUUAAGGAACUAGAUACUCUUAACAAUGAAAUAGUUGACCUACAGAGGGAAAAGAAUAAUGUGGAACAGGACCUUAAGGAGAAGGAAGAUACUAUUAAACAGAGGACAAGUGAGGUUCAGGAUCUUCAAGAUGAAGUUCAAAGGGAGAAUACUAAUCUGCAAAAACUACAGGCCCAGAAACAGCAGGUACAGGAACUCCUUGAUGAACUGGAUGAGCAGAAAGCCCAGCUGGAGGAGCAACUCAAGGAAGUCAGAAAGAAAUGUGCUGAGGAGGCCCAACUGAUCUCUUCUCUGAAAGCUGAAUUAACUAGUCAGGAAUCGCAGAUCUCCACUUACGAAGAAGAAUUGGCAAAAGCUAGAGAAGAGCUGAGCCGUCUACAGCAAGAAACAGCAGAAUUGGAGGAGAGUGUAGAGUCAGGGAAGGCUCAGUUGGAACCUCUUCAGCAGCACCUACAAGAUUCACAACAGGAAAUUAGUUCAAUGCAAAUGAAACUGAUGGAAAUGAAAGAUUUGGAAAAUCAUAAUAGUCAGUUAAAUUGGUGCAGUAGCCCACACAGCAUUCUUGUAAACGGAGCUACAGAUUAUUGCAGCCUCAGCACCAGCAGCAGUGAAACAGCCAACCUUAAUGAACAUGUUGAAGGCCAGAGCAACCUAGAGUCUGAGCCCAUACACCAGGAAUCUCCAGCAAGAAGUAGUCCUGAACUACUGCCUUCUGGUGUGACUGAUGAAAAUGAGGUGACUACAGCUGUUACUGAAAAAGUUUGUUCUGAACUCGACAAUAAUAGACAUUCAAAAGAGGAAGAUCCAUUUAAUGUAGACUCAAGUUCGCUGACAGGUCCAGUUGCAGAUACAAACUUGGAUUUUUUCCAGUCUGAUCCUUUUGUUGGCAGUGAUCCUUUCAAGGAUGAUCCUUUUGGAAAAAUCGAUCCAUUUGGUGGUGAUCCUUUCAAAGGUUCAGAUCCAUUUGCAUCAGACUGUUUCUUCAGGCAAUCUACUGAUCCUUUUGCCACUUCAAGCACUGACCCUUUCAGUGCAGCCAACAAUAGCAGUAUUACAUCGGUAGAAACGUUGAAGCACAAUGAUCCUUUUGCUCCUGGUGGAACAGUUGUUGCAGCAAGCGAUUCAGCCACAGACCCCUUUGCUUCUGUUUUUGGGAAUGAAUCAUUUGGAGGUGGAUUUGCUGACUUCAGCACAUUGUCAAAGGUCAACAAUGAAGAUCCUUUUCGUUCAGCCACAUCGAGCUCUGUCAGCAACGUAGUGAUUACAAAAAAUGUAUUUGAGGAAACAUCGGUCAAAAGUGAAGAUGAACCCCCAGCACUGCCACCAAAGAUCGGAACUCCAACAAGACCCUGCCCUCUACCACCUGGGAAAAGAUCCAUCAACAAAUUGGAUUCUCCUGAUCCCUUUAAACUGAAUGAUCCAUUUCAGCCUUUCCCAGGCAACGAUAGCCCCAAAGAAAAAGAUCCUGAAAUAUUUUGUGAUCCAUUCACUUCUGCUACUACCACUACCAAUAAAGAGGCUGAUCCAAGCAAUUUUGCCAACUUCAGUGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-490.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -528.32
Frequency: 0.0000
Diversity: 471.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((......)))..(((....(((.....(((((((...((((..((.((((((......((((((((((((((.((.......)).))))))))(((.((..((((....))))..))..)))............)))))).(((((.......))).))((((((.((((((..........(((((((..(((((((((((((.(((.....))).)))))))).....))))))))))))))).)))))))))..(((((...((((......))))..))))).)))))).)).)))).)))))))((((((.((((((((.((.((((((((.((....((((((((.....((........))..)))))..)))..))))))).......))).)).))))))))....((.((((((((..............((..(((((.....(((((((((((........((((((.((((((....((.((((((.....((........)).....))))))..))...))))))..))))))((((.((.(((...(((((.((((((.(((..........(((((.........(((((((((((.((((((((.(.(((((((((...((((.........)))).....(((..(((((...........(((..((((...((((.......))))..)))))))...((........)).........))))).)))....)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....((((..(....)..)))).((.....)).(((..(((((((....((((.............))))....)))))))..)))))))).(((((((.....(((....)))....)).)))))...(((((((.((..........)).)))))))................((((.((((((.(..((((((((.((..((((...((((((.((.(((..((..((((.(((.((((((.....))))))..))))))).))..))).))...))).))))))).(((......)))....)).))))))))..))))))).......(((((...(((.(((...))).))))))))........)))).))))).((((..((((.((........(((((.....)))))(((((((..((((.((((((((..(((((.((((((.(((((..((((........))))...)).))).))))))..)))))....((((((((((((...(((((((((.(((((((((((((((((....((((........(((((((.....)))))))...........))))......)))))))))..(((((.....)))))......))))..)))).)))))))))..)))..((((.((((((.(((((((..........))))).....))..)))))).)))).)))))))))(((((((...(((.(..(((....(((....((((((((...))))))))..))))))..).)))..)))))))..........((((.....)))).(((.((...((((..(((....))).))))...)).))))))))))).))))))))))).)).))))..)))).)))))))))....))))).....(((((.........)))))))).)).)))).......(((((........))))).((((....(((.......)))..))))...)))))))))))....)))))..))..))).))))).))....((.((........)).)).))))))..(((....)))...)))...))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((,,,...}}}..((({{,...,.....,,{((((..,((((,,({.,{{(((....{{(((({{{{(({{{|,||||}...,||{||||||||,,..,,..|{{,....}|||,.,,,,|||.,|||.....{{||,,,,.{{(({..,.,..},}.},{{((({,((((({,........{(((((((,.{((((((((((((.(((.....))).))))))),....,)))))))))))))|},}}}}))))}..{((((...((({......))))..))))).,}||||.,,.}})),)}}}}}}{|{{{,.((((((((.((.(((((((({{{....{(({((((.....{{........}}..)))))..))}.,}})))},.......,)).)).)))))))),,,.||.||||||{|,,...,........|||,{{{{{,,...(((((((((((,.......((((((.((((((....{{.((((((.....{{........}}.....))))))..}}...))))))..))))))((((.((.(({...(((((.((({((,(((,,..{((({.,(((({........(((((((((((.((((((((.{.(((((((((...((((.,.....,.))))...,{(({..(((((.,,......,.{{,..{(((...((((.......))))..)))}}}}.,.((........)).....,},.))))).))).},.)))))))))).))))))))..)))))))))))(((((.....,,{({.,....}},,,||.{{{,..,,,.,||,.{((((((....((((.............))))....)))))))..,,,}}))).(((((((.....(({....)))....)).)))))...{{{{(((.({....,,,...}}.}||||},,,{{{{,.{{{{{,.,.....|||}}..(((((((.{........})))).))),.,,{{.(((,.{{,.((((.{{(.((((((.....))))))..))))))).))..))),)}...,))))))|,|....}}}))),}},...,(((((((((((((((.(((........(((((..,{{{.(({...))).)))))))).,,,....||,..}}},...))).)))).)))).)))))))|(((.....)))}.})))))))}|{{|||(({(((,(((((....))))).,{{({,,{|||....{(((((..{(((((({{((.((({...}))).))|{(((((((((((.{,(((((((((.((((({{,(((((((((....{(((........(((((((.....))))))).,,........))})......)))))))))..(((((.....)))))......,))},))))).)))))))))}.)))}.((((.((((((.(((((((..,....,..)))))...,})}..)))))).)))).,}))))))}(((((((...(((.{..(((....(((....((((((((...})))))))..))))))..}.)))..)))))))..,{{{{{..((({.....)))}.{((.((...((((..(((....))).))))...)).)),))))))))))))))))))).,,))))),}}}...,)))))))).}}}.)))))....,(((((.........)))))))).)).)))).......(((((........))))).,{{{,...(((.......)))..,,,)...}))))))))))....}}}|||,}}..,)),)))))}),....,,.,,.,,.....}}.)).}))))),,(((....}}}...,,,,..)))}
Back